More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3531 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3531  hydrolase or acyltransferase-like protein  100 
 
 		 425 aa  848    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.17214 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1857  3-oxoadipate enol-lactonase  46.12 
 
 		 260 aa  209  6e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.115671  normal  0.0686473 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2121  alpha/beta hydrolase fold  49.62 
 
 		 256 aa  206  8e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00152914  normal  0.180644 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  43.04 
 
 		 282 aa  194  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1996  alpha/beta hydrolase fold  47.48 
 
 		 254 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.507588  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  41.7 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0159  alpha/beta hydrolase fold protein  41.73 
 
 		 279 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  42.62 
 
 		 279 aa  189  1e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0115  3-oxoadipate enol-lactonase  43.88 
 
 		 282 aa  188  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2609  3-oxoadipate enol-lactonase  40.34 
 
 		 271 aa  188  2e-46  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  39.5 
 
 		 260 aa  182  1e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0560  3-oxoadipate enol-lactonase  39.69 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.027284  normal  0.123793 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3321  alpha/beta hydrolase fold protein  44.44 
 
 		 254 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2283  3-oxoadipate enol-lactonase  43.19 
 
 		 263 aa  176  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  0.256435 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0479  alpha/beta hydrolase fold  39.66 
 
 		 262 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108292 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  37.13 
 
 		 261 aa  172  9e-42  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1578  3-oxoadipate enol-lactonase  37.69 
 
 		 261 aa  170  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000336054  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3491  3-oxoadipate enol-lactonase  39.76 
 
 		 262 aa  170  5e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.323872  normal  0.346177 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0874  3-oxoadipate enol-lactonase  40.5 
 
 		 260 aa  169  7e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.839441  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  38.24 
 
 		 260 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3475  3-oxoadipate enol-lactonase  44.12 
 
 		 258 aa  168  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.651032  normal  0.517943 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1629  3-oxoadipate enol-lactonase  39.5 
 
 		 260 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.351821  normal  0.603035 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4238  3-oxoadipate enol-lactonase  41.77 
 
 		 262 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0193  alpha/beta hydrolase fold protein  38.82 
 
 		 262 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.821297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1535  3-oxoadipate enol-lactonase  37.25 
 
 		 373 aa  165  1.0000000000000001e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.267161  normal  0.120644 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2904  3-oxoadipate enol-lactonase  41.42 
 
 		 377 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.475956  normal  0.271333 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0111  alpha/beta hydrolase fold protein  36.82 
 
 		 263 aa  164  3e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  36.55 
 
 		 260 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1007  3-oxoadipate enol-lactonase  38.19 
 
 		 268 aa  164  4.0000000000000004e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  36.55 
 
 		 260 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1663  3-oxoadipate enol-lactonase  37.65 
 
 		 263 aa  163  5.0000000000000005e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0244187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1348  3-oxoadipate enol-lactonase  43.04 
 
 		 256 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.786206 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1385  3-oxoadipate enol-lactonase  41.67 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.279159  normal  0.947236 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1367  3-oxoadipate enol-lactonase  41.67 
 
 		 256 aa  162  7e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1401  3-oxoadipate enol-lactonase  41.67 
 
 		 256 aa  162  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.926851 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0978  3-oxoadipate enol-lactonase  41.74 
 
 		 262 aa  161  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13040  3-oxoadipate enol-lactonase  39.92 
 
 		 261 aa  160  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  36.25 
 
 		 265 aa  159  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4315  3-oxoadipate enol-lactonase  37.8 
 
 		 263 aa  157  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.781035  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2938  alpha/beta hydrolase  36.71 
 
 		 264 aa  156  8e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0489547  hitchhiker  0.0000722758 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0646  3-oxoadipate enol-lactonase (pcaD)  37.8 
 
 		 263 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.063322 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3853  3-oxoadipate enol-lactonase  57.04 
 
 		 396 aa  155  1e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.126877  normal  0.866495 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0909  carboxymuconolactone decarboxylase  52.82 
 
 		 150 aa  154  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4165  3-oxoadipate enol-lactonase  40.51 
 
 		 256 aa  153  5e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  36.29 
 
 		 266 aa  153  5.9999999999999996e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4676  3-oxoadipate enol-lactonase  39.75 
 
 		 259 aa  152  8.999999999999999e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.256206  normal  0.172762 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2189  3-oxoadipate enol-lactonase  41.56 
 
 		 259 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5022  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  36.61 
 
 		 396 aa  151  2e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.391243  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06270  putative hydrolase  40.65 
 
 		 265 aa  151  2e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.674294  normal  0.191203 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2062  3-oxoadipate enol-lactonase  34.98 
 
 		 270 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  38.46 
 
 		 265 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2455  3-oxoadipate enol-lactonase  34.98 
 
 		 270 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.2187  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2323  alpha/beta hydrolase fold protein  35.69 
 
 		 260 aa  148  2.0000000000000003e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.262735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4655  3-oxoadipate enol-lactonase  40.16 
 
 		 393 aa  147  3e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.32763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  32.56 
 
 		 275 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1856  4-carboxymuconolactone decarboxylase  51.82 
 
 		 138 aa  147  3e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.177717  normal  0.121417 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2079  alpha/beta hydrolase fold protein  39.17 
 
 		 360 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1692  3-oxoadipate enol-lactonase  37.79 
 
 		 269 aa  147  5e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0317  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  38.91 
 
 		 263 aa  146  6e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38180  3-oxoadipate enol-lacton hydrolase  37.6 
 
 		 262 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1070  4-carboxymuconolactone decarboxylase / 3-oxoadipate enol-lactonase  36.47 
 
 		 397 aa  145  2e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3826  3-oxoadipate enol-lactonase  38.91 
 
 		 265 aa  144  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4016  3-oxoadipate enol-lactonase  37.4 
 
 		 392 aa  144  3e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00993372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02909  3-oxoadipate enol-lactonase  35.52 
 
 		 255 aa  144  4e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3606  3-oxoadipate enol-lactonase  37.31 
 
 		 265 aa  143  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0197721  hitchhiker  0.000894779 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0049  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  36.36 
 
 		 261 aa  143  7e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3323  Carboxymuconolactone decarboxylase  51.43 
 
 		 142 aa  143  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2250  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase transmembrane protein  36.63 
 
 		 270 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0146051  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7077  3-oxoadipate enol-lactonase  32.92 
 
 		 269 aa  142  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.335255  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2083  3-oxoadipate enol-lactonase  39.92 
 
 		 393 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.603861  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1020  3-oxoadipate enol-lactonase  38.27 
 
 		 263 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.062909 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2251  3-oxoadipate enol-lactonase  33.72 
 
 		 262 aa  140  3e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4875  3-oxoadipate enol-lactonase  36.19 
 
 		 258 aa  140  3.9999999999999997e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6126  3-oxoadipate enol-lactonase  32.11 
 
 		 263 aa  140  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2085  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 277 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.622652  normal  0.427031 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2263  alpha/beta hydrolase fold  36.63 
 
 		 277 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3546  3-oxoadipate enol-lactonase  38.71 
 
 		 251 aa  140  6e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0975813  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3645  alpha/beta fold family hydrolase  36.36 
 
 		 292 aa  139  7e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0431011  normal  0.291573 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0925  3-oxoadipate enol-lactonase  33.33 
 
 		 262 aa  139  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.407594  normal  0.195291 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4434  3-oxoadipate enol-lactonase  35.14 
 
 		 263 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.600688  normal  0.0168889 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  35 
 
 		 270 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0643  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase  31.44 
 
 		 267 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1274  3-oxoadipate enol-lactonase  35.52 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4460  3-oxoadipate enol-lactonase  35.04 
 
 		 263 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.312255 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1182  3-oxoadipate enol-lactonase  35.56 
 
 		 265 aa  137  4e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1577  4-carboxymuconolactone decarboxylase  54.76 
 
 		 128 aa  137  4e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00107459  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0057  3-oxoadipate enol-lactonase  34.47 
 
 		 261 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0184524  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0059  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase/4-carboxymuconolactone decarboxylase  34.47 
 
 		 261 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.440063  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1486  3-oxoadipate enol-lactonase  34.47 
 
 		 261 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1203  3-oxoadipate enol-lactonase  34.47 
 
 		 261 aa  137  5e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1556  3-oxoadipate enol-lactonase  34.47 
 
 		 261 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  35.14 
 
 		 270 aa  137  5e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0070  3-oxoadipate enol-lactonase  34.47 
 
 		 261 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.678293  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  34.47 
 
 		 261 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3567  3-oxoadipate enol-lactonase  33.61 
 
 		 264 aa  136  7.000000000000001e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0409722 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3004  3-oxoadipate enol-lactonase  37.55 
 
 		 390 aa  136  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1118  3-oxoadipate enol-lactonase  40.15 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  34.62 
 
 		 270 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  37.92 
 
 		 266 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  34.47 
 
 		 261 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>