64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3499 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3499  hypothetical protein  100 
 
 
178 aa  342  1e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.70844  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0358  MOSC  57.32 
 
 
155 aa  156  1e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00774  mosc  54.25 
 
 
151 aa  144  6e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00950006  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0265  MOSC domain containing protein  47.06 
 
 
184 aa  142  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.798311  normal  0.0276593 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2516  MOSC  53.59 
 
 
165 aa  140  8e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.406281  normal  0.326487 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0007  MOSC domain-containing protein  47.72 
 
 
206 aa  139  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.278634  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1459  MOSC domain-containing protein  50 
 
 
181 aa  132  3.9999999999999996e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.550389  normal  0.126815 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2198  hypothetical protein  53.14 
 
 
159 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4829  MOSC  43.68 
 
 
175 aa  126  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142865  normal  0.399285 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0530  alpha amylase domain-containing protein  49.31 
 
 
144 aa  127  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2927  hypothetical protein  52.94 
 
 
165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0113815  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2906  MOSC domain containing protein  45.4 
 
 
167 aa  124  6e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7200  MOSC domain-containing protein  47.71 
 
 
167 aa  123  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.313237 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0767  MOSC domain-containing protein  46.01 
 
 
182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0791  MOSC  43.2 
 
 
177 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0919  MOSC domain protein  41.42 
 
 
174 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58850  hypothetical protein  38.61 
 
 
149 aa  90.5  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.111042 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5172  hypothetical protein  37.34 
 
 
146 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.634719  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2603  MOSC domain-containing protein  37.97 
 
 
151 aa  69.3  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.10057  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2412  MOSC domain-containing protein  33.55 
 
 
162 aa  67  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.255229  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1460  hypothetical protein  34.31 
 
 
160 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.371187  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1008  MOSC  36.48 
 
 
181 aa  66.6  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1741  MOSC domain-containing protein  37.66 
 
 
153 aa  63.9  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.296315  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0012  hypothetical protein  35.53 
 
 
145 aa  61.6  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0012  hypothetical protein  35.53 
 
 
145 aa  61.2  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000203173 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3575  hypothetical protein  35.56 
 
 
190 aa  59.7  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0106  hypothetical protein  34.48 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0018  hypothetical protein  35.53 
 
 
145 aa  58.5  0.00000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0010  hypothetical protein  38.18 
 
 
150 aa  58.5  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.276585  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1966  hypothetical protein  34.38 
 
 
156 aa  57  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0292017  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3073  MOSC domain containing protein  32.91 
 
 
153 aa  56.6  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0020  MOSC domain-containing protein  35.06 
 
 
145 aa  55.8  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.606276  hitchhiker  0.0000000172861 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3206  MOSC domain containing protein  32.48 
 
 
200 aa  55.5  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0881785  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0019  hypothetical protein  31.37 
 
 
146 aa  54.3  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000110253 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0014  hypothetical protein  37.84 
 
 
146 aa  53.1  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0124057  normal  0.43799 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0010  hypothetical protein  29.75 
 
 
147 aa  53.5  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4111  putative sulferase  33.09 
 
 
174 aa  52.8  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.641133  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0011  hypothetical protein  31.33 
 
 
145 aa  52.4  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1758  MOSC domain containing protein  31.54 
 
 
143 aa  52.4  0.000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.175574  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0012  MOSC domain-containing protein  30.26 
 
 
149 aa  51.2  0.000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000770125  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0016  hypothetical protein  29.63 
 
 
155 aa  51.2  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000226962 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0016  hypothetical protein  33.99 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000149396 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0016  hypothetical protein  35.03 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.010551 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0012  hypothetical protein  33.11 
 
 
148 aa  50.1  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0017  hypothetical protein  35.03 
 
 
148 aa  49.7  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1811  MOSC  30.97 
 
 
158 aa  49.3  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.98215  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0082  MOSC domain-containing protein  30.19 
 
 
164 aa  48.5  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4639  MOSC domain containing protein  27.88 
 
 
163 aa  47.8  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5597  hypothetical protein  34.96 
 
 
179 aa  47  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.963565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1526  MOSC domain containing protein  32.69 
 
 
178 aa  47.4  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5926  hypothetical protein  31.1 
 
 
189 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0229267  normal  0.231206 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4234  MOSC domain-containing protein  30.54 
 
 
180 aa  45.4  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.37433  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2298  MOSC domain containing protein  31.16 
 
 
142 aa  44.7  0.0006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2768  MOSC domain containing protein  37.27 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0410  hypothetical protein  28.08 
 
 
148 aa  43.9  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.966681  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4831  hypothetical protein  32.72 
 
 
189 aa  43.9  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.000000085919  hitchhiker  0.00670464 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2705  MOSC domain-containing protein  33.99 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.705945  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1294  hypothetical protein  38.2 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.247549  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1967  hypothetical protein  30.43 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000022743  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2674  MOSC domain-containing protein  34 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.216386  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2719  MOSC domain-containing protein  34 
 
 
148 aa  43.5  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  decreased coverage  0.005456  normal  0.132425 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4294  hypothetical protein  31.58 
 
 
197 aa  43.1  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.17157  normal  0.269993 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2884  MOSC domain containing protein  32.33 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211052  normal  0.150346 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2179  MOSC domain containing protein  37.1 
 
 
184 aa  41.6  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>