More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3493 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3493  metallo-beta-lactamase family protein  100 
 
 		 468 aa  932    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.828376  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2467  beta-lactamase domain-containing protein  56.7 
 
 		 455 aa  485  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  0.38784 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3291  metallo-beta-lactamase family protein  56.7 
 
 		 455 aa  486  1e-136  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.119615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3879  beta-lactamase-like  54.65 
 
 		 452 aa  485  1e-136  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.486794  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3028  beta-lactamase domain-containing protein  55.16 
 
 		 455 aa  476  1e-133  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.745492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1382  beta-lactamase-like protein  51.77 
 
 		 455 aa  474  1e-132  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3460  beta-lactamase domain-containing protein  54.05 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.857931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1210  beta-lactamase-like  52.48 
 
 		 453 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.856378  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1130  metallo-beta-lactamase family protein  53.36 
 
 		 452 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.332296  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1662  Beta-lactamase-like  51.46 
 
 		 453 aa  460  9.999999999999999e-129  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2360  hypothetical protein  47.43 
 
 		 470 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1967  beta-lactamase-like  52.23 
 
 		 454 aa  456  1e-127  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.166456  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2691  beta-lactamase domain-containing protein  51.76 
 
 		 452 aa  454  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.770917  normal  0.585542 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1508  beta-lactamase domain-containing protein  51.54 
 
 		 452 aa  453  1.0000000000000001e-126  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.872448  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0201  hypothetical protein  52.68 
 
 		 452 aa  451  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.384627 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2297  beta-lactamase domain-containing protein  50.44 
 
 		 452 aa  450  1e-125  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.168183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4381  beta-lactamase domain protein  51.54 
 
 		 454 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.496128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0351  beta-lactamase domain-containing protein  50.89 
 
 		 472 aa  448  1e-125  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.766684  normal  0.755187 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4513  beta-lactamase domain protein  51.54 
 
 		 454 aa  451  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0937857  normal  0.557779 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1144  Beta-lactamase-like:RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  51.35 
 
 		 452 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4121  beta-lactamase domain-containing protein  51.65 
 
 		 457 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.729695 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5891  beta-lactamase domain-containing protein  50.66 
 
 		 467 aa  436  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.273287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3227  beta-lactamase domain-containing protein  51.55 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.500383  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1105  beta-lactamase domain-containing protein  48.45 
 
 		 454 aa  432  1e-120  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4519  exonuclease/RNA metabolizing protein  50.9 
 
 		 452 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0267273  decreased coverage  0.00562504 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0192  beta-lactamase domain-containing protein  50.33 
 
 		 455 aa  433  1e-120  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2652  beta-lactamase domain-containing protein  49.22 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.11992  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2599  metallo-beta-lactamase family protein  50.11 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2742  metallo-beta-lactamase family protein  49.89 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.213611  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0195  metallo-beta-lactamase family protein  49.89 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5599  beta-lactamase domain protein  48.89 
 
 		 477 aa  429  1e-119  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0190943  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0168  metallo-beta-lactamase family protein  50.11 
 
 		 459 aa  430  1e-119  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1013  metallo-beta-lactamase family protein  50.33 
 
 		 603 aa  430  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2580  beta-lactamase domain protein  51.55 
 
 		 454 aa  431  1e-119  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6202  beta-lactamase domain-containing protein  50.44 
 
 		 470 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.19774 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1339  metallo-beta-lactamase family protein  49.89 
 
 		 472 aa  431  1e-119  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6526  beta-lactamase domain-containing protein  50.11 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1078  beta-lactamase domain protein  49.89 
 
 		 454 aa  426  1e-118  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2182  hypothetical protein  48.45 
 
 		 452 aa  424  1e-117  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0148  putative metallo-beta-lactamase family protein  49.55 
 
 		 454 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2046  beta-lactamase domain-containing protein  47.67 
 
 		 461 aa  424  1e-117  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2210  hypothetical protein  48.01 
 
 		 452 aa  421  1e-116  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0462  metallo-beta-lactamase family protein  50 
 
 		 589 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1708  beta-lactamase domain protein  53.03 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.354041  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5322  beta-lactamase domain protein  53.03 
 
 		 454 aa  416  9.999999999999999e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2474  beta-lactamase-like protein  50.68 
 
 		 473 aa  409  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.766773  normal  0.305499 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1001  beta-lactamase domain-containing protein  48.9 
 
 		 460 aa  397  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.294858  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2041  beta-lactamase domain-containing protein  50 
 
 		 461 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00175331 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2623  metallo-beta-lactamase family protein  43.36 
 
 		 451 aa  372  1e-102  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2156  beta-lactamase domain protein  48.7 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3890  beta-lactamase-like  42.74 
 
 		 476 aa  371  1e-101  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.493871 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2064  beta-lactamase domain protein  49.35 
 
 		 460 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.576902  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1776  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  47.58 
 
 		 460 aa  357  1.9999999999999998e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.904116  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1061  metallo-beta-lactamase family protein  38.72 
 
 		 468 aa  345  7e-94  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_933  metallo-beta-lactamase  38.51 
 
 		 467 aa  345  1e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000465053  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0642  exonuclease  42.89 
 
 		 469 aa  337  2.9999999999999997e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000258182  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0944  beta-lactamase domain-containing protein  38.84 
 
 		 468 aa  336  7e-91  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.199817  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1075  beta-lactamase domain protein  38.89 
 
 		 522 aa  330  3e-89  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1299  beta-lactamase domain protein  43.13 
 
 		 470 aa  329  8e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.591175  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0705  beta-lactamase domain-containing protein  39.29 
 
 		 525 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1266  beta-lactamase-like protein  42.37 
 
 		 469 aa  327  3e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23851  normal  0.0118241 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1526  hypothetical protein  42.61 
 
 		 467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.2328  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17570  hypothetical protein  42.4 
 
 		 467 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0305  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.22 
 
 		 525 aa  317  2e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2788  beta-lactamase domain protein  38.06 
 
 		 570 aa  316  6e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1203  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.49 
 
 		 530 aa  316  7e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1677  beta-lactamase domain protein  39.53 
 
 		 544 aa  313  4.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1781  metallo-beta-lactamase family protein  37.9 
 
 		 535 aa  312  7.999999999999999e-84  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.133044  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1284  beta-lactamase domain-containing protein  41.2 
 
 		 467 aa  311  1e-83  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.818199 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1277  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.81 
 
 		 540 aa  311  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1187  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  38.73 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.177034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1830  beta-lactamase domain protein  41.34 
 
 		 462 aa  311  2e-83  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1362  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  39.74 
 
 		 471 aa  310  5e-83  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2486  beta-lactamase domain-containing protein  42.77 
 
 		 467 aa  309  5.9999999999999995e-83  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000215978 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38530  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase family protein  41.54 
 
 		 468 aa  309  8e-83  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0506935  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0816  beta-lactamase domain protein  39.39 
 
 		 462 aa  309  9e-83  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3744  beta-lactamase domain protein  38.66 
 
 		 466 aa  306  6e-82  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000226651  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0611  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  35.26 
 
 		 541 aa  306  6e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000296821  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0473  beta-lactamase domain protein  36.5 
 
 		 515 aa  306  7e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2586  beta-lactamase domain-containing protein  37.69 
 
 		 465 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563089  normal  0.494624 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0588  metallo-beta-lactamase superfamily protein  40.09 
 
 		 464 aa  304  3.0000000000000004e-81  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1906  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  41.7 
 
 		 466 aa  303  4.0000000000000003e-81  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1759  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  34.97 
 
 		 543 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1267  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  36.48 
 
 		 465 aa  301  2e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0095  metallo-beta-lactamase superfamily protein  41.49 
 
 		 474 aa  296  5e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.04699  normal  0.438592 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1601  beta-lactamase domain-containing protein  38.48 
 
 		 536 aa  295  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0394  beta-lactamase domain protein  37.61 
 
 		 547 aa  294  2e-78  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0103  beta-lactamase domain protein  36.46 
 
 		 465 aa  294  3e-78  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0171  beta-lactamase domain protein  37.31 
 
 		 536 aa  293  6e-78  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000341552 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1772  beta-lactamase domain-containing protein  37.85 
 
 		 465 aa  293  7e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0024  beta-lactamase-like  36.05 
 
 		 465 aa  291  1e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0490  beta-lactamase domain-containing protein  38.92 
 
 		 463 aa  291  1e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.955165 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1421  beta-lactamase domain-containing protein  39.5 
 
 		 524 aa  291  2e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1747  RNA-metabolising metallo-beta-lactamase  37.28 
 
 		 467 aa  290  3e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1417  beta-lactamase domain protein  36.73 
 
 		 467 aa  289  9e-77  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2033  beta-lactamase domain protein  36.2 
 
 		 536 aa  288  1e-76  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5075  beta-lactamase domain protein  39.82 
 
 		 464 aa  288  1e-76  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0726  beta-lactamase domain protein  39.96 
 
 		 465 aa  287  2e-76  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.723322 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1400  beta-lactamase domain-containing protein  37.23 
 
 		 535 aa  286  4e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.736343  normal  0.560132 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0238  beta-lactamase domain protein  37.97 
 
 		 468 aa  285  1.0000000000000001e-75  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.465693 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>