59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3395 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3395  MxaJ protein  100 
 
 		 291 aa  593  1e-169  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00965407 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3042  extracellular solute-binding protein family 3  70.11 
 
 		 296 aa  409  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.262852  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3108  extracellular solute-binding protein  65.53 
 
 		 293 aa  375  1e-103  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0300  MxaJ protein  50 
 
 		 284 aa  275  8e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.579886  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2425  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  44.37 
 
 		 303 aa  265  5e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0414883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6476  extracellular solute-binding protein  41.87 
 
 		 304 aa  246  3e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33826  normal  0.119349 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4974  extracellular solute-binding protein  46.15 
 
 		 291 aa  234  9e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0769997  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3941  extracellular solute-binding protein  40.79 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.792832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5951  putative methanol oxidation protein  41.53 
 
 		 291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.834577  normal  0.721299 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1585  extracellular solute-binding protein family 3  40.08 
 
 		 282 aa  178  7e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0856617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1811  extracellular solute-binding protein  39.38 
 
 		 284 aa  179  7e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.893534 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2147  extracellular solute-binding protein family 3  39.38 
 
 		 284 aa  179  7e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.541175  normal  0.31516 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0510  extracellular solute-binding protein  40.5 
 
 		 286 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0862535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1779  extracellular solute-binding protein  35.97 
 
 		 307 aa  169  7e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.117507  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5979  extracellular solute-binding protein family 3  41.27 
 
 		 288 aa  168  1e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.077375  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0478  extracellular solute-binding protein family 3  36.33 
 
 		 282 aa  168  1e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.648252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1763  extracellular solute-binding protein family 3  39.11 
 
 		 284 aa  167  2e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.863479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0022  extracellular solute-binding protein  37.86 
 
 		 270 aa  165  6.9999999999999995e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5754  extracellular solute-binding protein  40.48 
 
 		 298 aa  165  9e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.707188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0699  extracellular solute-binding protein family 3  38.02 
 
 		 282 aa  162  4.0000000000000004e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1943  extracellular solute-binding protein  35.42 
 
 		 270 aa  162  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2580  putative methanol oxidation protein  36.14 
 
 		 274 aa  159  6e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1238  extracellular solute-binding protein  36.14 
 
 		 274 aa  159  7e-38  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.532355 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2345  extracellular solute-binding protein family 3  37.07 
 
 		 277 aa  157  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.366121  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6352  extracellular solute-binding protein  38.55 
 
 		 273 aa  158  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.756783 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2313  extracellular solute-binding protein  36.64 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000951817  unclonable  0.000000229382 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2993  extracellular solute-binding protein  34.77 
 
 		 287 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23641  normal  0.0529683 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0098  extracellular solute-binding protein  33.47 
 
 		 278 aa  143  3e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.155933  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3386  extracellular solute-binding protein family 3  33.73 
 
 		 272 aa  136  5e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2791  extracellular solute-binding protein  32.06 
 
 		 289 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3148  Ankyrin  35.86 
 
 		 581 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1908  extracellular solute-binding protein  30.13 
 
 		 309 aa  99.4  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.365185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4149  extracellular solute-binding protein  29.33 
 
 		 296 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.514926 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2043  extracellular solute-binding protein  26.78 
 
 		 280 aa  92.4  9e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4517  extracellular solute-binding protein family 3  29.64 
 
 		 300 aa  87.8  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.627659  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2994  extracellular solute-binding protein  27.63 
 
 		 276 aa  87  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.141592  normal  0.958295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1828  extracellular solute-binding protein  28.23 
 
 		 283 aa  85.9  8e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.624367 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4209  extracellular solute-binding protein  29.21 
 
 		 302 aa  80.1  0.00000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.352464  normal  0.132236 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8039  extracellular solute-binding protein family 3  29.46 
 
 		 281 aa  79.3  0.00000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.465628  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0472  extracellular solute-binding protein family 3  27.34 
 
 		 285 aa  79.3  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4631  extracellular solute-binding protein family 3  29.51 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.548325 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0780  MxaJ protein  27.55 
 
 		 190 aa  55.5  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.173014  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1590  hypothetical protein  25.53 
 
 		 262 aa  49.3  0.00008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.85132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0891  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  25.28 
 
 		 243 aa  45.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.437353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1023  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.54 
 
 		 243 aa  45.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.916151 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3735  extracellular solute-binding protein family 3  23.33 
 
 		 277 aa  44.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00874  hypothetical protein  24.54 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.183806  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2779  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0149314  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2468  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.54 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381979  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2733  cationic amino acid ABC transporter, periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 243 aa  45.1  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0727882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0936  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.54 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.570643  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0967  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.54 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00868  arginine transporter subunit  24.54 
 
 		 243 aa  44.7  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.208844  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2305  extracellular solute-binding protein family 3  25.52 
 
 		 279 aa  43.1  0.005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000714042  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0994  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.34 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.633483  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0927  arginine ABC transporter, periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.34 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1044  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.34 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.180668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1025  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.34 
 
 		 243 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0962  arginine ABC transporter periplasmic arginine-binding protein ArtI  24.34 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>