241 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3255 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_1718  Phosphoenolpyruvate carboxylase  54.72 
 
 		 919 aa  936    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.333688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1753  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.14 
 
 		 922 aa  967    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0935488  normal  0.649239 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3664  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.13 
 
 		 916 aa  952    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0387741  normal  0.313845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2137  Phosphoenolpyruvate carboxylase  57.14 
 
 		 922 aa  966    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.24789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7118  phosphoenolpyruvate carboxylase  59.44 
 
 		 920 aa  993    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.700949  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3255  phosphoenolpyruvate carboxylase  100 
 
 		 920 aa  1842    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5925  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.96 
 
 		 946 aa  981    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.613814  normal  0.197386 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6558  phosphoenolpyruvate carboxylase  58.78 
 
 		 920 aa  961    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.985726  normal  0.0731651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1801  phosphoenolpyruvate carboxylase  57.14 
 
 		 922 aa  966    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.369049 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0577  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.82 
 
 		 922 aa  523  1e-147  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.222337 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0559  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.28 
 
 		 922 aa  513  1e-144  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2967  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.57 
 
 		 910 aa  506  9.999999999999999e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000103268 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0226  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.41 
 
 		 911 aa  503  1e-141  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695017  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1629  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.51 
 
 		 923 aa  496  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.194507 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0606  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.87 
 
 		 922 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0209  Phosphoenolpyruvate carboxylase  38.27 
 
 		 912 aa  491  1e-137  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00083066 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4237  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.36 
 
 		 929 aa  490  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.582668  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3110  phosphoenolpyruvate carboxylase  38.44 
 
 		 908 aa  492  1e-137  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.150886 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0808  phosphoenolpyruvate carboxylase  37.27 
 
 		 908 aa  491  1e-137  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0058  Phosphoenolpyruvate carboxylase  39.11 
 
 		 910 aa  486  1e-136  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.424552 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2136  Phosphoenolpyruvate carboxylase  37.8 
 
 		 906 aa  484  1e-135  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0683  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.87 
 
 		 922 aa  482  1e-134  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.781097  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2855  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.1 
 
 		 922 aa  477  1e-133  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0285296 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0998  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.7 
 
 		 938 aa  463  1e-129  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0399  Phosphoenolpyruvate carboxylase  36.57 
 
 		 933 aa  464  1e-129  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.917347  normal  0.991386 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2974  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.52 
 
 		 914 aa  466  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2753  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.54 
 
 		 952 aa  463  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2377  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.5 
 
 		 938 aa  444  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.439412 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0630  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.9 
 
 		 939 aa  446  1e-123  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0739788  normal  0.189937 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0308  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.33 
 
 		 931 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1684  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.55 
 
 		 929 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.56004  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0875  Phosphoenolpyruvate carboxylase  35.02 
 
 		 947 aa  440  9.999999999999999e-123  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.127499  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2928  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.91 
 
 		 928 aa  442  9.999999999999999e-123  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.410794  normal  0.863251 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2278  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.18 
 
 		 928 aa  439  1e-121  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.307465  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0318  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.66 
 
 		 926 aa  434  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.56738  normal  0.211574 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1876  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.13 
 
 		 933 aa  436  1e-120  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.209652 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1972  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.71 
 
 		 936 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1521  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.78 
 
 		 929 aa  432  1e-119  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.19 
 
 		 929 aa  432  1e-119  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3592  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.97 
 
 		 933 aa  424  1e-117  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.795293 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22741  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.66 
 
 		 1002 aa  424  1e-117  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.114136 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1558  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.17 
 
 		 929 aa  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0614036  unclonable  0.000000000174255 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1883  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.17 
 
 		 929 aa  422  1e-116  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2134  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.97 
 
 		 1023 aa  418  9.999999999999999e-116  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1933  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.61 
 
 		 995 aa  419  9.999999999999999e-116  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2358  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.65 
 
 		 985 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.223721 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1436  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.6 
 
 		 920 aa  413  1e-114  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0770  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.57 
 
 		 957 aa  414  1e-114  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.815806  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0396  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.73 
 
 		 997 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.411219  normal  0.654727 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2220  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.23 
 
 		 1018 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0767995 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0763  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.57 
 
 		 950 aa  415  1e-114  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000509332 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17661  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.6 
 
 		 989 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2572  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.98 
 
 		 1001 aa  410  1e-113  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.374778 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2167  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.62 
 
 		 1002 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.524225  normal  0.617309 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17821  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.39 
 
 		 989 aa  408  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17621  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.46 
 
 		 989 aa  407  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2121  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.21 
 
 		 946 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.180736 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0699  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.97 
 
 		 1006 aa  405  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1667  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.21 
 
 		 989 aa  403  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3469  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.09 
 
 		 1024 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1041  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.65 
 
 		 930 aa  405  1e-111  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2647  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.09 
 
 		 1024 aa  404  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.261414  normal  0.0910712 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1696  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.09 
 
 		 1017 aa  405  1e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2252  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.05 
 
 		 1017 aa  400  9.999999999999999e-111  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0123033 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3412  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.89 
 
 		 994 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2233  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.29 
 
 		 949 aa  401  9.999999999999999e-111  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.380618  normal  0.0228414 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2180  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.23 
 
 		 1030 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.235371  hitchhiker  0.000906218 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2691  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.87 
 
 		 937 aa  399  1e-109  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16951  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.14 
 
 		 1007 aa  398  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1068  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.43 
 
 		 1075 aa  395  1e-108  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1138  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.9 
 
 		 926 aa  395  1e-108  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.118011  normal  0.338902 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1822  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.73 
 
 		 926 aa  394  1e-108  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.389962  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2750  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.15 
 
 		 1009 aa  393  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251385  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4238  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.25 
 
 		 1021 aa  396  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1759  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.27 
 
 		 918 aa  392  1e-107  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0836  phosphoenolpyruvate carboxylase  32.34 
 
 		 1038 aa  391  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2311  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.52 
 
 		 900 aa  390  1e-107  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.900921 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1147  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.72 
 
 		 994 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5753  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.28 
 
 		 1008 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.61686  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1373  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.04 
 
 		 947 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.333226  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0561  phosphoenolpyruvate carboxylase  31.86 
 
 		 932 aa  387  1e-106  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00597332 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2000  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.24 
 
 		 951 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277994  decreased coverage  0.000144828 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2889  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.37 
 
 		 949 aa  389  1e-106  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.695135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0868  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.24 
 
 		 1004 aa  389  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3665  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.67 
 
 		 970 aa  384  1e-105  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3689  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.49 
 
 		 900 aa  384  1e-105  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1814  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.92 
 
 		 994 aa  384  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.594671  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2376  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.45 
 
 		 949 aa  386  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2430  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.92 
 
 		 1009 aa  383  1e-105  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.76585  normal  0.238617 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2367  Phosphoenolpyruvate carboxylase  33.8 
 
 		 945 aa  383  1e-105  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20211  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.83 
 
 		 994 aa  386  1e-105  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0871  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.92 
 
 		 1088 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2426  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.92 
 
 		 1009 aa  383  1e-104  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3091  phosphoenolpyruvate carboxylase  34.42 
 
 		 982 aa  383  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.723203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3003  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.41 
 
 		 934 aa  380  1e-104  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371181  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2699  Phosphoenolpyruvate carboxylase  34.84 
 
 		 915 aa  382  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0883  phosphoenolpyruvate carboxylase  36.47 
 
 		 972 aa  382  1e-104  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.3209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0304  phosphoenolpyruvate carboxylase  35.48 
 
 		 931 aa  378  1e-103  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2335  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.81 
 
 		 998 aa  379  1e-103  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.361608 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2469  phosphoenolpyruvate carboxylase  33.81 
 
 		 998 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.792272  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>