More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3146 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3146  cation efflux family protein  100 
 
 		 296 aa  586  1e-166  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440371  hitchhiker  0.000651912 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4099  cation diffusion facilitator family transporter  74.48 
 
 		 304 aa  426  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.932753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0729  cation diffusion facilitator family transporter  73.87 
 
 		 304 aa  421  1e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1334  cation diffusion facilitator family transporter  67.72 
 
 		 312 aa  377  1e-103  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.215207  hitchhiker  0.000886879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4244  cation diffusion facilitator family transporter  65.26 
 
 		 339 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.337864 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3707  cation diffusion facilitator family transporter  61.43 
 
 		 319 aa  358  5e-98  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0354783  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0487  cation diffusion facilitator family transporter  61.43 
 
 		 319 aa  358  8e-98  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1206  cation diffusion facilitator family transporter  61.75 
 
 		 316 aa  344  8.999999999999999e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4669  cation diffusion facilitator family transporter  62.07 
 
 		 332 aa  339  2.9999999999999998e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1114  cation efflux protein  50.53 
 
 		 305 aa  271  9e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1731  cation diffusion facilitator family transporter  51.41 
 
 		 315 aa  271  1e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.560975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1770  cation diffusion facilitator family transporter  50.74 
 
 		 315 aa  258  1e-67  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1850  cation diffusion facilitator family transporter  50.55 
 
 		 315 aa  255  8e-67  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2073  cation diffusion facilitator family transporter  49.15 
 
 		 308 aa  254  1.0000000000000001e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.981542 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1043  cation efflux protein  47.24 
 
 		 320 aa  251  1e-65  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1483  cation diffusion facilitator family transporter  47.7 
 
 		 308 aa  249  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1439  cation efflux protein  45.58 
 
 		 293 aa  247  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0109958  normal  0.777573 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2025  cation diffusion facilitator family transporter  44.95 
 
 		 313 aa  246  3e-64  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0165078  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0980  cation diffusion facilitator family transporter  45.64 
 
 		 305 aa  245  6.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2106  cation diffusion facilitator family transporter  50.37 
 
 		 315 aa  245  8e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0597  cation diffusion facilitator family transporter  44.25 
 
 		 302 aa  239  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1801  cation efflux family protein  44.44 
 
 		 376 aa  230  2e-59  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0942158  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1928  cation diffusion facilitator family transporter  51.13 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.479128  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0225  cation diffusion facilitator family transporter  43.1 
 
 		 312 aa  223  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07750  cation diffusion facilitator family transporter  43.31 
 
 		 330 aa  221  9e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2873  cation diffusion facilitator family transporter  47.42 
 
 		 314 aa  221  9.999999999999999e-57  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2239  cation diffusion facilitator family transporter  44.84 
 
 		 302 aa  219  3e-56  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0407082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5513  cation diffusion facilitator family transporter  44.93 
 
 		 295 aa  219  5e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.281094  normal  0.363198 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5667  cation diffusion facilitator family transporter  46.29 
 
 		 328 aa  218  1e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2468  cation diffusion facilitator family transporter  45.16 
 
 		 295 aa  216  2.9999999999999998e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.376521 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2658  cation diffusion facilitator family transporter  44.57 
 
 		 295 aa  216  4e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3261  cation efflux system protein  41.94 
 
 		 305 aa  211  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.826048  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3075  cation diffusion facilitator family transporter  40.86 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.553073  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0023  cation diffusion facilitator family transporter  43.12 
 
 		 295 aa  206  3e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.556428 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2198  cation diffusion facilitator family transporter  42.65 
 
 		 293 aa  204  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.776966  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2294  cation diffusion facilitator family transporter  40.62 
 
 		 306 aa  203  3e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.38282  normal  0.177312 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5864  cation diffusion facilitator family transporter  41.61 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.499716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1021  cation diffusion facilitator family transporter  44.76 
 
 		 346 aa  201  9.999999999999999e-51  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3065  cation diffusion facilitator family transporter  44 
 
 		 295 aa  201  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.686004  normal  0.910257 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3290  cation diffusion facilitator family transporter  44 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.208123  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1178  cation diffusion facilitator family transporter  41.18 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00185198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2809  cation diffusion facilitator family transporter  39.58 
 
 		 304 aa  198  9e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.252612  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3264  cation diffusion facilitator family transporter  44.73 
 
 		 295 aa  194  1e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2804  cation diffusion facilitator family transporter  42.07 
 
 		 303 aa  192  4e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3476  putative cation efflux family protein, CzcD-like protein  39.24 
 
 		 296 aa  192  7e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.606573  normal  0.771262 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2446  cation diffusion facilitator family transporter  40.46 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.526861  normal  0.400869 
 
 
-
 
NC_004310  BR1568  cation efflux family protein  42.55 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1514  cation efflux family protein  42.55 
 
 		 302 aa  185  7e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1598  cation diffusion facilitator family transporter  41.82 
 
 		 302 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0050  cation diffusion facilitator family transporter  40.14 
 
 		 317 aa  183  2.0000000000000003e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.374526 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0867  cation diffusion facilitator family transporter  40.75 
 
 		 295 aa  181  1e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.851238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0463  cation efflux transporter  40.83 
 
 		 295 aa  180  2e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.632211  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1013  metal cation efflux protein CzrB  39.72 
 
 		 302 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.323499  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0311  cation diffusion facilitator family transporter  37.05 
 
 		 311 aa  172  6.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2384  cation diffusion facilitator family transporter  39.45 
 
 		 295 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.336168 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0589  cation diffusion facilitator family transporter  35.51 
 
 		 285 aa  170  3e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000134664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2115  cation diffusion facilitator family transporter  40.83 
 
 		 295 aa  169  6e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.922775  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_273  cation efflux protein  36.33 
 
 		 311 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.02572  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3750  cation diffusion facilitator family transporter  33.46 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.220836  hitchhiker  0.0009443 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1661  cation diffusion facilitator family transporter  31.71 
 
 		 331 aa  163  3e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0331  cation efflux family protein  36.33 
 
 		 311 aa  157  2e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1256  cation diffusion facilitator family transporter  38.89 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.513971  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1521  cation diffusion facilitator family transporter  33.08 
 
 		 309 aa  155  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0470  cation diffusion facilitator family transporter  30.97 
 
 		 337 aa  155  1e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2568  cation diffusion facilitator family transporter  30.65 
 
 		 332 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0432  cation diffusion facilitator family transporter  36.21 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2581  cation diffusion facilitator family transporter  40.71 
 
 		 325 aa  150  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3895  cation diffusion facilitator family transporter  35.38 
 
 		 307 aa  148  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.640647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0400  cation diffusion facilitator family transporter  30.35 
 
 		 327 aa  145  9e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1127  cation diffusion facilitator family transporter  33.1 
 
 		 323 aa  143  3e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1113  hypothetical protein  35.23 
 
 		 307 aa  143  3e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.416676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1683  cation diffusion facilitator family transporter  35.38 
 
 		 308 aa  143  4e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000676071  normal  0.070124 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0607  cation diffusion facilitator family transporter  37.64 
 
 		 309 aa  142  5e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.212656  normal  0.0107339 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2000  cation diffusion facilitator family transporter  38.11 
 
 		 285 aa  142  5e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.7679  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1954  cation diffusion facilitator family transporter  33.58 
 
 		 328 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0806665 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0526  cation diffusion facilitator family transporter  36.71 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1536  cation diffusion facilitator family transporter  35.13 
 
 		 295 aa  140  3.9999999999999997e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.503443  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0749  cation diffusion facilitator family transporter  34.69 
 
 		 338 aa  139  7e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0791  cation diffusion facilitator family transporter  31.65 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.536733 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3741  cation diffusion facilitator family transporter  34.72 
 
 		 292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2574  cation diffusion facilitator family transporter  34.56 
 
 		 310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4790  cation efflux family protein  33.45 
 
 		 297 aa  129  6e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4333  cation efflux protein  33.68 
 
 		 297 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4020  ferrous iron efflux protein F  29.89 
 
 		 300 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4392  ferrous iron efflux protein F  29.48 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.123338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4390  ferrous iron efflux protein F  29.48 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.228028 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4278  ferrous iron efflux protein F  29.48 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.546202  normal  0.887398 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4459  ferrous iron efflux protein F  29.48 
 
 		 300 aa  125  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.709567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4307  ferrous iron efflux protein F  29.48 
 
 		 300 aa  124  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3813  ferrous iron efflux protein F  30.8 
 
 		 298 aa  123  3e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.70191  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4057  ferrous iron efflux protein F  29.85 
 
 		 300 aa  123  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.3408  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2795  ferrous iron efflux protein F  30 
 
 		 301 aa  123  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00102947  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03800  ferrous iron efflux protein F  29.48 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.769582  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4070  cation diffusion facilitator family transporter  29.48 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03749  hypothetical protein  29.48 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.859371  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4448  ferrous iron efflux protein F  29.48 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5369  ferrous iron efflux protein F  29.48 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4145  ferrous iron efflux protein F  29.48 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4103  ferrous iron efflux protein F  29.48 
 
 		 300 aa  122  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4355  ferrous iron efflux protein F  29.48 
 
 		 300 aa  122  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.363052 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>