31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3087 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3087  putative zinc protease protein  100 
 
 		 363 aa  724    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.222342 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3380  putative zinc protease protein  64.48 
 
 		 357 aa  416  9.999999999999999e-116  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4033  putative zinc protease protein  62.31 
 
 		 369 aa  392  1e-108  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.213397 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3501  putative zinc protease protein  62.13 
 
 		 374 aa  380  1e-104  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0403427  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3534  putative zinc protease protein  59.05 
 
 		 360 aa  363  3e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2858  putative zinc protease protein  56.86 
 
 		 384 aa  359  4e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3150  putative zinc protease protein  53.8 
 
 		 385 aa  350  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2740  putative zinc protease protein  56.51 
 
 		 365 aa  348  7e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0331505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3105  putative zinc protease protein  53.46 
 
 		 365 aa  347  3e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2999  putative zinc protease protein  52.11 
 
 		 379 aa  345  6e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.769735  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0337  putative zinc protease protein  57.27 
 
 		 384 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0774  putative zinc protease protein  58.43 
 
 		 399 aa  343  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0866721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0447  putative zinc protease protein  53.39 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.400718  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0456  putative zinc protease protein  53.39 
 
 		 381 aa  323  4e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.428295  normal  0.446741 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1145  putative zinc protease protein  47.73 
 
 		 442 aa  291  2e-77  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0093  hypothetical protein  49.42 
 
 		 387 aa  278  7e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00544178 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0108  hypothetical protein  47.98 
 
 		 357 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000475774 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0093  hypothetical protein  46.47 
 
 		 376 aa  272  7e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0111  hypothetical protein  46.67 
 
 		 363 aa  268  1e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.163649  normal  0.0432694 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0108  hypothetical protein  46.82 
 
 		 363 aa  264  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0043  hypothetical protein  47.01 
 
 		 351 aa  261  1e-68  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0063  hypothetical protein  47.43 
 
 		 336 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.501325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00750  hypothetical protein  47.76 
 
 		 375 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369332  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0146  hypothetical protein  45.78 
 
 		 351 aa  250  2e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0536  putative zinc protease protein  46.11 
 
 		 385 aa  248  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.421159  normal  0.628812 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4455  aminopeptidase-like protein  43.49 
 
 		 353 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01150  hypothetical protein  43.11 
 
 		 355 aa  229  4e-59  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3556  putative zinc protease protein  38.35 
 
 		 356 aa  197  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0009  aminopeptidase  34.88 
 
 		 343 aa  140  1.9999999999999998e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000000716532  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5834  aminopeptidase  35.12 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.325368  normal  0.928661 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0004  aminopeptidase  31.42 
 
 		 340 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0290521  normal  0.0636966 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>