More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A3009 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  100 
 
 		 367 aa  731    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2108  putative outer membrane protein (porin)  48.03 
 
 		 376 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2502  putative outer membrane protein (porin)  48.03 
 
 		 376 aa  294  1e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506227  normal  0.418434 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1592  putative outer membrane protein (porin)  49.43 
 
 		 383 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0359  putative porin protein  47.71 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0373439  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1354  porin  43.65 
 
 		 352 aa  265  7e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0786529 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  34.28 
 
 		 389 aa  153  5e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  30.88 
 
 		 392 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  30.88 
 
 		 392 aa  152  7e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  35.39 
 
 		 354 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  33.43 
 
 		 351 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  34.58 
 
 		 357 aa  134  3e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2974  outer membrane porin  35.16 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.598026  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3099  outer membrane porin  35.16 
 
 		 354 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.345873  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1323  outer membrane porin protein precursor  35.16 
 
 		 357 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  34.1 
 
 		 449 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.33 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1190  outer membrane protein (porin)  34.5 
 
 		 359 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0135905  normal  0.83536 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.33 
 
 		 363 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  34.03 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  34.03 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  34.03 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  35.48 
 
 		 368 aa  130  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  31.07 
 
 		 367 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  32.8 
 
 		 352 aa  129  7.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  31.84 
 
 		 376 aa  129  7.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  34.32 
 
 		 361 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  31.83 
 
 		 355 aa  129  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.97 
 
 		 338 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  29.19 
 
 		 355 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  32.94 
 
 		 363 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  32.09 
 
 		 359 aa  126  5e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  32.95 
 
 		 379 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  33.43 
 
 		 347 aa  126  6e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  32.12 
 
 		 368 aa  126  7e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  31.59 
 
 		 376 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  31.54 
 
 		 352 aa  125  8.000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  31.54 
 
 		 375 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  31.48 
 
 		 367 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  31.59 
 
 		 368 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.66 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  34.1 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  34.1 
 
 		 354 aa  125  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  33.92 
 
 		 367 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  32.85 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  34.38 
 
 		 374 aa  124  2e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  31.06 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  31.06 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  34.74 
 
 		 363 aa  124  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  31.38 
 
 		 360 aa  123  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  34.3 
 
 		 365 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5539  porin  34.01 
 
 		 386 aa  122  9.999999999999999e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  33.83 
 
 		 401 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  32.96 
 
 		 351 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2544  porin  33.82 
 
 		 367 aa  120  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644529 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  34.3 
 
 		 392 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5977  porin  32.11 
 
 		 356 aa  120  3e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0893366 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  32.3 
 
 		 373 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  33.07 
 
 		 357 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  32.67 
 
 		 353 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  31.27 
 
 		 379 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4547  outer membrane porin signal peptide protein  35.02 
 
 		 385 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000157102  normal  0.308815 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0061  porin  30.98 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0431794  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1601  porin  30.91 
 
 		 374 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.32825  normal  0.100291 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  32.7 
 
 		 356 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  32.19 
 
 		 357 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  30.9 
 
 		 376 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1599  putative outer membrane porin signal peptide protein  29.06 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.102431  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  32.27 
 
 		 377 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  32.43 
 
 		 356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  32.43 
 
 		 356 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  31.68 
 
 		 379 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4837  outer membrane protein, (porin)  30.11 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00816794 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  33.24 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  31.04 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  31.3 
 
 		 350 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  32.79 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  32.79 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  31.55 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  32.86 
 
 		 355 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  32.79 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  31.55 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  31.32 
 
 		 362 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  31.12 
 
 		 363 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  32.81 
 
 		 402 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  33.83 
 
 		 386 aa  114  3e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  31.44 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1582  porin  30.87 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  32.23 
 
 		 357 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  42.93 
 
 		 393 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1936  OmpC family outer membrane porin  32.11 
 
 		 369 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000467885  normal  0.0609572 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  31.44 
 
 		 374 aa  113  5e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  32.87 
 
 		 353 aa  113  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  33.8 
 
 		 364 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.24 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  30.55 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  30.3 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  32.79 
 
 		 382 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  30.3 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  32.12 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>