75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2998 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2998  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  438  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3473  integrase family protein  43.84 
 
 		 392 aa  184  7e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00115261 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2312  hypothetical protein  41.55 
 
 		 364 aa  173  1.9999999999999998e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20500  Phage integrase  40.95 
 
 		 399 aa  172  3.9999999999999995e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0995  site-specific recombinase, phage integrase family  32.83 
 
 		 349 aa  90.5  2e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.00503137  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0770  phage integrase family protein  33.13 
 
 		 387 aa  82.8  0.000000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.17567  normal  0.038003 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1037  Phage integrase  30.39 
 
 		 338 aa  81.3  0.000000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1092  phage integrase  31.79 
 
 		 276 aa  79.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.00970061  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0290  integrase  31.86 
 
 		 324 aa  77.8  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0955438  normal  0.658855 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0600  prophage DLP12 integrase  30.9 
 
 		 387 aa  74.7  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000371504 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00486  predicted integrase  30.17 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00491  hypothetical protein  30.17 
 
 		 387 aa  72.4  0.000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1532  phage integrase family site specific recombinase  31.68 
 
 		 369 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3070  prophage DLP12 integrase  31.68 
 
 		 369 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3300  phage integrase family site specific recombinase  31.68 
 
 		 369 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.248425  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3005  phage integrase family site specific recombinase  31.68 
 
 		 369 aa  72  0.000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0366  site-specific recombinase, phage integrase family  29.41 
 
 		 387 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.529105  hitchhiker  0.00000000819042 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0603  prophage DLP12 integrase  29.78 
 
 		 387 aa  71.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.591827  normal  0.109932 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0832  Phage integrase  28.41 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0165  integrase family protein  30.93 
 
 		 369 aa  68.6  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0996  phage integrase family protein  28.65 
 
 		 387 aa  68.2  0.00000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000294682 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3128  integrase family protein  26.97 
 
 		 384 aa  66.2  0.0000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.169868  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0272  phage integrase family site specific recombinase  26.67 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3380  hypothetical protein  38.57 
 
 		 95 aa  59.3  0.00000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00978825 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0795  hypothetical protein  72.5 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.666388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3565  phage integrase family protein  28.49 
 
 		 402 aa  54.3  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000473566  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0831  Phage integrase  32.89 
 
 		 400 aa  53.5  0.000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.00496745  hitchhiker  0.00000971423 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5143  phage integrase family site specific recombinase  28.85 
 
 		 404 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0463539  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3986  phage integrase family site specific recombinase  30.49 
 
 		 172 aa  52.8  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1281  integrase family protein  30.32 
 
 		 429 aa  51.6  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2069  phage integrase  27.32 
 
 		 359 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.244007  hitchhiker  0.000737798 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3274  phage integrase family site specific recombinase  29.3 
 
 		 159 aa  50.1  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1428  integrase family protein  28.39 
 
 		 421 aa  48.9  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2121  integrase family protein  27.65 
 
 		 405 aa  48.5  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4536  integrase family protein  29.19 
 
 		 409 aa  46.6  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1170  integrase family protein  26.83 
 
 		 368 aa  46.2  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.429636 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1646  integrase family protein  29.3 
 
 		 330 aa  45.4  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06819  integrase  29.38 
 
 		 341 aa  45.8  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1568  integrase family protein  28.57 
 
 		 357 aa  45.4  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2627  phage integrase family protein  25.81 
 
 		 376 aa  45.1  0.0008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000511904  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03620  phage integrase family protein  37.31 
 
 		 391 aa  45.1  0.0009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000382884  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1078  phage integrase family site specific recombinase  41.82 
 
 		 414 aa  44.3  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0287  site-specific recombinase, phage integrase family  27.85 
 
 		 412 aa  44.3  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5518  integrase family protein  41.07 
 
 		 477 aa  44.7  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0834932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4490  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 365 aa  43.9  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.6537  normal  0.0343494 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1489  tyrosine recombinase XerD  45.16 
 
 		 313 aa  43.5  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.966498  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5550  phage integrase family protein  28.37 
 
 		 365 aa  43.9  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0498  phage integrase family protein  43.33 
 
 		 390 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000218969  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1727  phage integrase  38.03 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.539916  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1247  putative phage related integrase  25.47 
 
 		 434 aa  43.5  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.578843 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2123  hypothetical protein  25.48 
 
 		 353 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4162  integrase family protein  29.09 
 
 		 396 aa  43.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3903  phage integrase family site specific recombinase  41.94 
 
 		 99 aa  43.1  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.823274  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003284  integrase  25.6 
 
 		 401 aa  43.1  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0395  phage integrase family protein  37.21 
 
 		 397 aa  42.7  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.887583 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0473  integrase family protein  29.23 
 
 		 377 aa  42.4  0.005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2783  phage integrase family protein  31.43 
 
 		 367 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00148084  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1163  phage integrase family protein  45 
 
 		 472 aa  42.4  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.562087  normal  0.524123 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0767  integrase family protein  38.46 
 
 		 371 aa  42  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0883457 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2625  phage integrase family protein  37.5 
 
 		 409 aa  42  0.007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0300817  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1271  integrase family protein  37.04 
 
 		 331 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.828065  normal  0.193617 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1556  site-specific recombinase, phage integrase family  37.04 
 
 		 331 aa  41.6  0.008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1637  integrase  29.93 
 
 		 174 aa  41.6  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1722  hypothetical protein  23.13 
 
 		 339 aa  41.6  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.178853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2507  transposase B  22.75 
 
 		 630 aa  41.6  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1346  Tn554, transposase B  22.75 
 
 		 630 aa  41.6  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2126  integrase family protein  37.7 
 
 		 395 aa  41.6  0.01  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.706316 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1223  Tn554, transposase B  22.75 
 
 		 630 aa  41.6  0.01  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.559956  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1565  phage integrase  30.41 
 
 		 416 aa  41.6  0.01  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.314527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0674  Phage integrase  44.19 
 
 		 386 aa  41.6  0.01  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2359  integrase family protein  28.81 
 
 		 398 aa  41.6  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.522134  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0042  phage integrase family protein  22.75 
 
 		 630 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1716  phage integrase family protein  22.75 
 
 		 630 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0042  phage integrase family protein  22.75 
 
 		 630 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1750  phage integrase family protein  22.75 
 
 		 630 aa  41.6  0.01  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00214495  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>