More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2853 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2385  hypothetical protein  78.59 
 
 		 433 aa  671    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2853  CBS domain-containing protein  100 
 
 		 439 aa  875    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0266  protein of unknown function DUF21  57.63 
 
 		 444 aa  508  1e-143  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3199  hypothetical protein  57.81 
 
 		 448 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.184722 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3640  hypothetical protein  57.27 
 
 		 441 aa  501  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2439  protein of unknown function DUF21  57.65 
 
 		 443 aa  504  1e-141  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1577  protein of unknown function DUF21  58.22 
 
 		 447 aa  501  1e-140  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.569313  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2313  hypothetical protein  58.06 
 
 		 438 aa  498  1e-140  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3026  hypothetical protein  58.66 
 
 		 442 aa  498  1e-139  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25014  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0098  hypothetical protein  56.91 
 
 		 460 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1932  CBS  55.89 
 
 		 456 aa  492  9.999999999999999e-139  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0017665  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1519  hypothetical protein  60.9 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3770  hypothetical protein  55.71 
 
 		 441 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4935  hypothetical protein  55.92 
 
 		 443 aa  489  1e-137  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2157  hypothetical protein  59.39 
 
 		 437 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.285648  normal  0.808245 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3036  CBS  57.83 
 
 		 442 aa  488  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2774  protein of unknown function DUF21  54.02 
 
 		 440 aa  487  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.730131  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2846  protein of unknown function DUF21  56.21 
 
 		 443 aa  486  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3447  hypothetical protein  54.44 
 
 		 440 aa  487  1e-136  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2077  CBS domain-containing protein  56.49 
 
 		 441 aa  482  1e-135  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4026  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  56.22 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0902  protein of unknown function DUF21  55.05 
 
 		 436 aa  474  1e-132  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4228  hypothetical protein  57.61 
 
 		 445 aa  466  9.999999999999999e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.351193  normal  0.199337 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4765  hypothetical protein  56.7 
 
 		 437 aa  466  9.999999999999999e-131  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.942078 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3855  protein of unknown function DUF21  59.21 
 
 		 437 aa  465  9.999999999999999e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.469597  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2815  CBS domain-containing protein  50.23 
 
 		 439 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1250  CBS domain-containing protein  46.48 
 
 		 432 aa  362  6e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.144301  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3597  protein of unknown function DUF21  44.07 
 
 		 447 aa  360  2e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000988374 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1441  protein of unknown function DUF21  45.41 
 
 		 439 aa  358  9e-98  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.114074  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2766  hypothetical protein  45.89 
 
 		 442 aa  358  9e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0953  membrane protein  42.86 
 
 		 426 aa  351  1e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4050  hypothetical protein  42.22 
 
 		 440 aa  348  1e-94  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0807851  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4403  hypothetical protein  45.28 
 
 		 436 aa  346  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0196704  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0562  hypothetical protein  43.32 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.371677  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2233  protein of unknown function DUF21  43.69 
 
 		 437 aa  343  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0608  hemolysin  43.32 
 
 		 439 aa  343  4e-93  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004057  hemolysin  42.72 
 
 		 434 aa  341  2e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2432  protein of unknown function DUF21  43.33 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3678  protein of unknown function DUF21  43.33 
 
 		 443 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0756  hypothetical protein  43.48 
 
 		 436 aa  335  7.999999999999999e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0635919  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00183  hemolysin  44.65 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.702411  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0926  protein of unknown function DUF21  40.68 
 
 		 441 aa  330  2e-89  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2480  hemolysin  40.42 
 
 		 436 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1085  hypothetical protein  43.26 
 
 		 464 aa  322  9.999999999999999e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.792914 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35020  hemolysin-like protein  42.11 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.518958  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1314  hypothetical protein  41.96 
 
 		 439 aa  316  4e-85  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0274508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0021  protein of unknown function DUF21  40.71 
 
 		 435 aa  312  9e-84  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0831  protein of unknown function DUF21  42.92 
 
 		 452 aa  306  6e-82  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0300168 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1287  protein of unknown function DUF21  38.5 
 
 		 428 aa  305  1.0000000000000001e-81  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2235  protein of unknown function DUF21  36.98 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4675  putative transporter  36.45 
 
 		 447 aa  300  3e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.050719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0264  hypothetical protein  39.86 
 
 		 432 aa  299  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.265353 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4771  putative transporter  36.21 
 
 		 447 aa  298  9e-80  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4686  putative transporter  36.21 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.116284  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4826  putative transporter  36.21 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.229608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4805  putative transporter  36.21 
 
 		 447 aa  298  1e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.140825  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2321  hypothetical protein  40.05 
 
 		 446 aa  296  4e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.638143  normal  0.0384275 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0238  protein of unknown function DUF21  37.88 
 
 		 417 aa  296  7e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.932515 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3668  hypothetical protein  40.09 
 
 		 452 aa  295  8e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2925  hypothetical protein  39.71 
 
 		 465 aa  295  1e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.221134  normal  0.412302 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0769  hypothetical protein  38.19 
 
 		 447 aa  293  3e-78  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574193 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0743  hypothetical protein  39.21 
 
 		 439 aa  293  4e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.946695  normal  0.0273705 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5479  hypothetical protein  38.67 
 
 		 482 aa  293  6e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0396  hypothetical protein  35.75 
 
 		 445 aa  293  6e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0782784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2008  protein of unknown function DUF21  36.45 
 
 		 447 aa  292  7e-78  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000403932  normal  0.229254 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0777  protein of unknown function DUF21  39.16 
 
 		 438 aa  292  8e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.825818  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0848  hypothetical protein  39.16 
 
 		 438 aa  292  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.684402 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3215  CBS:protein of unknown function DUF21:transporter-associated region  36.3 
 
 		 431 aa  292  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.141334 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0343  hypothetical protein  37.26 
 
 		 437 aa  291  2e-77  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.384323  normal  0.630353 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3772  hypothetical protein  36.84 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3627  CBS/transporter associated domain-containing protein  36.84 
 
 		 443 aa  290  3e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4471  putative transporter  34.72 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4787  putative transporter  34.72 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4864  putative transporter  34.72 
 
 		 447 aa  290  4e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.830156  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3577  protein of unknown function DUF21  35.62 
 
 		 441 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04089  predicted inner membrane protein  34.72 
 
 		 447 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3774  protein of unknown function DUF21  34.72 
 
 		 447 aa  289  6e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.767387  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3789  hypothetical protein  34.72 
 
 		 447 aa  289  6e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4210  protein of unknown function DUF21  38.03 
 
 		 427 aa  289  6e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5735  putative transporter  34.72 
 
 		 447 aa  289  6e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4696  putative transporter  34.72 
 
 		 447 aa  289  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04052  hypothetical protein  34.72 
 
 		 447 aa  289  6e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3960  CBS/transporter associated domain-containing protein  36.61 
 
 		 443 aa  289  7e-77  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.216105  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3197  hypothetical protein  40.58 
 
 		 479 aa  289  8e-77  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.241932  normal  0.866715 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1413  hypothetical protein  38.14 
 
 		 430 aa  288  2e-76  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0999393  normal  0.104956 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0820  protein of unknown function DUF21  36.6 
 
 		 444 aa  287  2.9999999999999996e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3174  hypothetical protein  38.84 
 
 		 458 aa  286  4e-76  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3418  hypothetical protein  36.54 
 
 		 442 aa  286  7e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0457  hypothetical protein  35.31 
 
 		 447 aa  285  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0445264  normal  0.119105 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2145  hypothetical protein  38.74 
 
 		 430 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2122  hypothetical protein  39.77 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.705935  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0786  protein of unknown function DUF21  36.99 
 
 		 438 aa  281  1e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.35446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3348  hypothetical protein  40.33 
 
 		 429 aa  281  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0165594  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3102  hypothetical protein  38.03 
 
 		 466 aa  280  4e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0806544  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5725  hypothetical protein  42.86 
 
 		 434 aa  279  6e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.239106  hitchhiker  0.00714589 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1467  protein of unknown function DUF21  36.93 
 
 		 429 aa  279  6e-74  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211541  normal  0.989219 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1852  protein of unknown function DUF21  37.38 
 
 		 433 aa  276  7e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3315  hypothetical protein  36.34 
 
 		 427 aa  274  2.0000000000000002e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.284865  normal  0.945237 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2711  hypothetical protein  37.79 
 
 		 431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.155736 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0723  hypothetical protein  40.49 
 
 		 425 aa  273  3e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.622001 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>