More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2679 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 394 aa  791    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  36.52 
 
 		 374 aa  189  7e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  34.6 
 
 		 366 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1907  porin  33.84 
 
 		 371 aa  171  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.178405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5190  outer membrane porin  33.81 
 
 		 371 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.353922 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  34.6 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  31.52 
 
 		 374 aa  111  2.0000000000000002e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  31.7 
 
 		 351 aa  109  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  28.69 
 
 		 348 aa  93.6  5e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  29.98 
 
 		 362 aa  92.4  1e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  28.89 
 
 		 362 aa  90.1  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  28.77 
 
 		 339 aa  88.6  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0338  porin  29.45 
 
 		 431 aa  87  5e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  31.65 
 
 		 335 aa  87  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  27.96 
 
 		 327 aa  87  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  27.68 
 
 		 335 aa  85.5  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  30.43 
 
 		 368 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  29.8 
 
 		 344 aa  84.7  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0350  porin  28.99 
 
 		 431 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.675543  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  29.68 
 
 		 384 aa  82  0.00000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  29.92 
 
 		 329 aa  81.3  0.00000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  27.29 
 
 		 340 aa  80.5  0.00000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  29.38 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  26.56 
 
 		 344 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  27.96 
 
 		 338 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  29.15 
 
 		 348 aa  78.2  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  29.13 
 
 		 426 aa  77.4  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  34.8 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  27.21 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  29.57 
 
 		 376 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  29.23 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  34.8 
 
 		 355 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  28.8 
 
 		 342 aa  73.9  0.000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  29.61 
 
 		 382 aa  73.6  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  27.82 
 
 		 383 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  33.78 
 
 		 380 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  26.25 
 
 		 352 aa  72.8  0.00000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2717  OmpC family outer membrane porin  32.35 
 
 		 355 aa  72.8  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000457721  normal  0.182742 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6141  porin  29.32 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.593112 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5776  porin  29.32 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.524151  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  28.92 
 
 		 386 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  29.89 
 
 		 345 aa  72  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  29.72 
 
 		 349 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  26.48 
 
 		 341 aa  72  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  34.93 
 
 		 430 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  26.73 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  34.93 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  34.93 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  27.53 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  27.51 
 
 		 336 aa  70.5  0.00000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  35.29 
 
 		 389 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  30.2 
 
 		 350 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  27.9 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6621  porin  29.35 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.112273  normal  0.393887 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  34.98 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  27.5 
 
 		 344 aa  70.5  0.00000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  30.54 
 
 		 359 aa  70.1  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  26.73 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7685  outer membrane protein (porin)  28.61 
 
 		 390 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.350624 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  29.3 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  29.02 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  26.73 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  26.73 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  26.73 
 
 		 376 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  29.27 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  29.3 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  29.27 
 
 		 375 aa  69.7  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  33.93 
 
 		 396 aa  69.7  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  34.5 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  34.5 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  34.5 
 
 		 430 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  26.73 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  28.92 
 
 		 350 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  26.73 
 
 		 374 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  28.67 
 
 		 340 aa  69.3  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  28.78 
 
 		 376 aa  68.9  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  29.04 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  34.68 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  32.16 
 
 		 389 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  34.68 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  34.5 
 
 		 390 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  26.49 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  29.95 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  33.62 
 
 		 387 aa  68.6  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  29.95 
 
 		 350 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  27.78 
 
 		 344 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  28.78 
 
 		 401 aa  68.6  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4894  porin  27.11 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  28.94 
 
 		 372 aa  68.2  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  34.23 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  34.68 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  33.5 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  29.43 
 
 		 390 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  34.23 
 
 		 386 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  28.3 
 
 		 413 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  32.84 
 
 		 379 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  26.97 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  34.01 
 
 		 388 aa  67  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  27.62 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  26.65 
 
 		 356 aa  67  0.0000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>