33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2667 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2667  heme oxygenase family protein  100 
 
 		 231 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00170539  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3312  heme oxygenase  61.4 
 
 		 226 aa  271  9e-72  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.242609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3042  hypothetical protein  60.93 
 
 		 226 aa  266  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.109106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3830  TenA family transcriptional activator  57.01 
 
 		 223 aa  265  5.999999999999999e-70  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.806864  normal  0.17183 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2710  hypothetical protein  60.93 
 
 		 226 aa  264  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3022  hypothetical protein  61.4 
 
 		 226 aa  262  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1937  carbamoylphosphate synthase large subunit  60.19 
 
 		 217 aa  256  2e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.677675  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02330  possible Transcriptional activator, TenA family  60.58 
 
 		 218 aa  250  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0265444  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3944  long-chain acyl-CoA synthetase  54.21 
 
 		 216 aa  247  9e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18600  hypothetical protein  60.19 
 
 		 217 aa  245  4e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.291232  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03394  putative transcriptional activator, TenA family  53.27 
 
 		 223 aa  243  1.9999999999999999e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3351  TenA family transcription regulator  54.88 
 
 		 224 aa  239  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0291  AMP-dependent synthetase and ligase  53.7 
 
 		 730 aa  231  6e-60  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2431  hypothetical protein  52.58 
 
 		 220 aa  227  1e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0370972  normal  0.527853 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003614  long-chain acyl-CoA synthetase  50.23 
 
 		 227 aa  225  4e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2033  putative transcriptional activator, TenA family  51.87 
 
 		 221 aa  218  3.9999999999999997e-56  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0952  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  50.46 
 
 		 743 aa  213  1.9999999999999998e-54  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.623495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0650  hypothetical protein  54.21 
 
 		 229 aa  211  7.999999999999999e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.57288  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0546  hypothetical protein  48.61 
 
 		 223 aa  209  3e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0136  hypothetical protein  49.09 
 
 		 236 aa  209  4e-53  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.278669  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1285  heme oxygenase family  50.23 
 
 		 226 aa  202  5e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.882326  normal  0.863144 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2586  heme oxygenase family  46.12 
 
 		 222 aa  191  8e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4140  long-chain acyl-CoA synthetase  37.5 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0245  hypothetical protein  28.65 
 
 		 242 aa  73.6  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.542715  normal  0.0643029 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3740  TENA/THI-4 protein  28.96 
 
 		 238 aa  71.2  0.00000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.805522  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1051  hypothetical protein  29.41 
 
 		 227 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.535057  normal  0.555479 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4043  hypothetical protein  24.23 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0391  3-oxoacyl-(acyl-carrier-protein (ACP)) synthase III domain protein  27.6 
 
 		 233 aa  57  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5062  putative transcriptional activator, TenA family  23.12 
 
 		 218 aa  50.4  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.66393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1690  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  22.68 
 
 		 650 aa  50.4  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2349  3-oxoacyl-(acyl carrier protein) synthase III  23.87 
 
 		 647 aa  48.5  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0625  hypothetical protein  25.13 
 
 		 226 aa  45.8  0.0005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.749504 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1408  hypothetical protein  30.07 
 
 		 235 aa  43.9  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.664659  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>