More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2264 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A2264  protein tyrosine phosphatase  100 
 
 		 182 aa  367  1e-101  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1049  protein tyrosine phosphatase  58.33 
 
 		 165 aa  186  2e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2165  protein tyrosine phosphatase  61.29 
 
 		 160 aa  185  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.234598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1142  protein tyrosine phosphatase  61.07 
 
 		 160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0134152  normal  0.557378 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5949  protein tyrosine phosphatase  61.44 
 
 		 160 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.1373  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2128  protein tyrosine phosphatase  61.44 
 
 		 160 aa  180  1e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2145  protein tyrosine phosphatase  60.78 
 
 		 160 aa  179  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.886119 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5434  protein tyrosine phosphatase  61.44 
 
 		 160 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0903732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1022  protein tyrosine phosphatase  59.48 
 
 		 159 aa  178  4e-44  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.112265  normal  0.296416 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1063  protein tyrosine phosphatase  56.95 
 
 		 166 aa  178  4.999999999999999e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.277437  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1243  protein tyrosine phosphatase  55.41 
 
 		 162 aa  176  2e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2532  protein tyrosine phosphatase  61.97 
 
 		 162 aa  174  4e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513089 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1675  protein tyrosine phosphatase  51.95 
 
 		 161 aa  170  7.999999999999999e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.040808  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3101  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  57.89 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0939667  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1710  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  57.89 
 
 		 159 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2735  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  57.89 
 
 		 159 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1491  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  57.89 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2657  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  57.89 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2601  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  57.89 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.196662  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2219  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  57.89 
 
 		 164 aa  170  1e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2004  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  52.87 
 
 		 160 aa  169  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.704301  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2001  protein tyrosine phosphatase  55.84 
 
 		 175 aa  169  2e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1352  protein tyrosine phosphatase  55.19 
 
 		 158 aa  169  3e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0253204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3646  protein tyrosine phosphatase  57.69 
 
 		 163 aa  166  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.778837  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1551  protein tyrosine phosphatase  53.9 
 
 		 165 aa  166  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0172729  normal  0.0349447 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02206  phosphotyrosine protein phosphatase  50.66 
 
 		 157 aa  164  5e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.361833  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1873  low molecular weight protein-tyrosine-phosphatase  55.92 
 
 		 159 aa  164  5e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.30876  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2581  protein tyrosine phosphatase  51.3 
 
 		 165 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191101  hitchhiker  0.000439001 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1994  protein tyrosine phosphatase  55.7 
 
 		 158 aa  162  3e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0184825  normal  0.355745 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1565  protein tyrosine phosphatase  53.64 
 
 		 165 aa  160  6e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.455451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1460  protein tyrosine phosphatase  51.22 
 
 		 175 aa  159  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0984651  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1431  protein tyrosine phosphatase  51.66 
 
 		 165 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.430051  normal  0.53924 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1617  protein tyrosine phosphatase  56.29 
 
 		 154 aa  159  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.11326  normal  0.164412 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1706  protein tyrosine phosphatase  50.99 
 
 		 163 aa  158  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1588  protein tyrosine phosphatase  53.64 
 
 		 154 aa  157  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.705966  normal  0.241378 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2189  protein tyrosine phosphatase  53.16 
 
 		 171 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.810234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2266  protein tyrosine phosphatase  54.61 
 
 		 167 aa  156  1e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2208  phosphotyrosine protein phosphatase  49.12 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2399  protein tyrosine phosphatase  49.11 
 
 		 171 aa  154  7e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.563268 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2183  phosphotyrosine protein phosphatase  56 
 
 		 154 aa  154  9e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3015  phosphotyrosine protein phosphatase  49.66 
 
 		 155 aa  153  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.331353  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4172  protein tyrosine phosphatase  56.38 
 
 		 154 aa  152  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.207146  normal  0.309722 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1189  protein tyrosine phosphatase  54.25 
 
 		 164 aa  152  2e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330824  normal  0.0337788 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2437  protein tyrosine phosphatase  53.69 
 
 		 157 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94576  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25540  phosphotyrosine protein phosphatase  56.67 
 
 		 154 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1888  protein tyrosine phosphatase  51.66 
 
 		 160 aa  151  5e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0559  phosphotyrosine protein phosphatase  51.97 
 
 		 155 aa  151  5.9999999999999996e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00747923  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1854  protein tyrosine phosphatase  50.64 
 
 		 160 aa  150  8e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.917981  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1590  protein tyrosine phosphatase  51.68 
 
 		 162 aa  150  1e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.199236  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3410  protein tyrosine phosphatase  47.3 
 
 		 162 aa  149  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1749  protein tyrosine phosphatase  50 
 
 		 160 aa  149  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0030  protein tyrosine phosphatase  45.22 
 
 		 161 aa  148  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2438  protein tyrosine phosphatase  51.33 
 
 		 155 aa  148  4e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.203246  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2038  protein tyrosine phosphatase  58.82 
 
 		 137 aa  148  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.326657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1514  protein tyrosine phosphatase  56.08 
 
 		 154 aa  148  5e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.284825  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2057  protein tyrosine phosphatase  48.67 
 
 		 163 aa  147  8e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.323033 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1903  protein tyrosine phosphatase  56.38 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000352137 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1479  protein tyrosine phosphatase  56.76 
 
 		 154 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.14971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2028  protein tyrosine phosphatase  49.35 
 
 		 160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.643964 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3811  protein tyrosine phosphatase  56.38 
 
 		 154 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00121262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002986  low molecular weight protein tyrosine phosphatase  50.67 
 
 		 149 aa  146  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0417  protein tyrosine phosphatase  48.39 
 
 		 158 aa  145  4.0000000000000006e-34  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0349216  normal  0.0689798 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2307  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  50 
 
 		 161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.224234  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22461  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  47.4 
 
 		 159 aa  140  9.999999999999999e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0657  protein tyrosine phosphatase  43.59 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20411  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40.65 
 
 		 157 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02921  hypothetical protein  47.33 
 
 		 149 aa  138  3e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1166  protein tyrosine phosphatase  40.65 
 
 		 157 aa  137  6e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.654881  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2323  protein tyrosine phosphatase  42.68 
 
 		 157 aa  136  1e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0989989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2509  protein tyrosine phosphatase  46.79 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5736  protein tyrosine phosphatase  51.3 
 
 		 158 aa  136  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.062216  normal  0.1595 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1881  protein tyrosine phosphatase  51.03 
 
 		 147 aa  136  2e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00734553  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1485  protein tyrosine phosphatase  50.74 
 
 		 161 aa  135  2e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2913  protein tyrosine phosphatase  50.33 
 
 		 155 aa  136  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14790  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  55.19 
 
 		 154 aa  135  3.0000000000000003e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0702  protein tyrosine phosphatase  45.27 
 
 		 162 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1913  protein tyrosine phosphatase  47.06 
 
 		 159 aa  134  7.000000000000001e-31  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5051  protein tyrosine phosphatase  54.3 
 
 		 165 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.844894  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0818  protein tyrosine phosphatase  43.14 
 
 		 157 aa  133  9.999999999999999e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.74944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0463  protein tyrosine phosphatase  47.06 
 
 		 163 aa  134  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3589  protein tyrosine phosphatase  54.9 
 
 		 164 aa  133  1.9999999999999998e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.164977  hitchhiker  0.00146697 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4026  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 		 166 aa  133  1.9999999999999998e-30  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.22537 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0095  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 		 173 aa  132  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2962  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.502384 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3156  protein tyrosine phosphatase  47.1 
 
 		 159 aa  131  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0047  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  49.03 
 
 		 453 aa  130  9e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1641  phosphotyrosine protein phosphatase  47.74 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3348  protein tyrosine phosphatase  43.87 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4052  protein tyrosine phosphatase  48.03 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0775  protein tyrosine phosphatase  42.95 
 
 		 166 aa  129  3e-29  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00021336  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2842  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.95 
 
 		 186 aa  128  4.0000000000000003e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.998077  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1469  protein tyrosine phosphatase  43.4 
 
 		 164 aa  128  5.0000000000000004e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.368051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2154  protein tyrosine phosphatase  45.39 
 
 		 158 aa  127  6e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.657607  normal  0.32914 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0949  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  42.77 
 
 		 164 aa  127  7.000000000000001e-29  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1683  protein tyrosine phosphatase  39.22 
 
 		 157 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2075  protein tyrosine phosphatase  45.71 
 
 		 172 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.545305  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1737  protein tyrosine phosphatase  47.68 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1307  protein tyrosine phosphatase  52.56 
 
 		 160 aa  126  2.0000000000000002e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2932  protein tyrosine phosphatase  50.67 
 
 		 152 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.611647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1328  protein tyrosine phosphatase  42.21 
 
 		 154 aa  125  2.0000000000000002e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>