More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2119 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_1835  peptidase M16 domain protein  46.46 
 
 
949 aa  790    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.300051  normal  0.619696 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5316  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  49.83 
 
 
942 aa  834    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2119  putative zinc protease  100 
 
 
921 aa  1864    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.105618 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0240  peptidase M16 domain protein  42.63 
 
 
948 aa  700    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.239759  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1689  pseudouridine synthase, Rsu  41.84 
 
 
919 aa  715    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000215702  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1834  peptidase M16 domain protein  45.97 
 
 
934 aa  826    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.106959  normal  0.617697 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5911  peptidase M16-like protein, possible Zn-dependent  49.43 
 
 
957 aa  833    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1977  peptidase M16-like protein  42.99 
 
 
928 aa  707    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.794367  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3008  peptidase M16 domain protein  49.38 
 
 
918 aa  884    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3596  pseudouridine synthase, Rsu  45.24 
 
 
912 aa  805    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2253  peptidase M16 domain-containing protein  34.57 
 
 
912 aa  607  9.999999999999999e-173  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.890772  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0496  processing peptidase  36.73 
 
 
903 aa  542  9.999999999999999e-153  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000425054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2012  peptidase M16 domain-containing protein  29.05 
 
 
929 aa  398  1e-109  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27040  zinc protease  31.7 
 
 
908 aa  358  2.9999999999999997e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.883186  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1580  peptidase M16 domain protein  29.72 
 
 
896 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116015 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4630  peptidase M16 domain-containing protein  40.43 
 
 
464 aa  280  1e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3678  peptidase M16-like  27.22 
 
 
945 aa  275  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0331  peptidase M16 domain-containing protein  27.42 
 
 
937 aa  272  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1348  peptidase M16 domain protein  38.59 
 
 
439 aa  271  5e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.387051  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2806  peptidase M16 domain-containing protein  28.12 
 
 
876 aa  268  4e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.326138  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0642  exported pepdidase, putative zinc protease  26.93 
 
 
950 aa  255  2.0000000000000002e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2387  peptidase M16-like protein  27.21 
 
 
959 aa  253  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.183046 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4406  peptidase M16-like  28.4 
 
 
943 aa  242  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0089  insulinase family protease/insulinase family protease  26.94 
 
 
952 aa  239  1e-61  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002529  protease insulinase family/protease insulinase family  25.59 
 
 
947 aa  236  2.0000000000000002e-60  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0089  peptidase M16 domain protein  26.94 
 
 
921 aa  235  3e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03487  peptidase  25.65 
 
 
947 aa  234  4.0000000000000004e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1207  peptidase M16 domain-containing protein  26.57 
 
 
945 aa  235  4.0000000000000004e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04156  zinc protease  28.02 
 
 
956 aa  234  6e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3129  peptidase M16 domain-containing protein  27.58 
 
 
967 aa  226  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.586411 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2034  zinc protease  26.43 
 
 
962 aa  216  9.999999999999999e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.554182  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1955  peptidase M16 domain-containing protein  26.26 
 
 
960 aa  211  3e-53  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.384397  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0107  peptidase M16 domain-containing protein  27.65 
 
 
954 aa  211  4e-53  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.224669  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02764  putative metallopeptidase, M16 family protein  25.27 
 
 
945 aa  211  4e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4079  M16 family metallopeptidase  24.1 
 
 
959 aa  210  1e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0165  peptidase M16 domain protein  27.44 
 
 
949 aa  209  2e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1226  peptidase M16 domain-containing protein  25.89 
 
 
944 aa  207  8e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1328  peptidase M16 domain-containing protein  25.29 
 
 
944 aa  207  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.438205  normal  0.0130612 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1365  peptidase M16-like  24.51 
 
 
958 aa  205  3e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3063  peptidase M16 domain-containing protein  26.33 
 
 
949 aa  204  4e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.354036 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3381  peptidase M16-like  30.25 
 
 
947 aa  204  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.529886  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3327  peptidase M16 domain-containing protein  26.12 
 
 
944 aa  203  1.9999999999999998e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1035  peptidase M16 domain-containing protein  26.28 
 
 
944 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3464  peptidase M16 domain protein  29.6 
 
 
929 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.694105  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4170  peptidase M16 domain protein  24.97 
 
 
969 aa  200  1.0000000000000001e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.353568  normal  0.732695 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2981  peptidase M16 domain-containing protein  26.23 
 
 
949 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1071  peptidase M16 domain-containing protein  26.36 
 
 
943 aa  200  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3261  peptidase M16 domain protein  25.72 
 
 
944 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0698623  normal  0.160904 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3528  peptidase M16 domain protein  29.6 
 
 
949 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.146206  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3161  peptidase M16 domain-containing protein  26.3 
 
 
949 aa  199  2.0000000000000003e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1097  peptidase M16 domain-containing protein  25.72 
 
 
950 aa  197  6e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1030  peptidase M16 domain-containing protein  25.61 
 
 
950 aa  197  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1131  peptidase M16 domain-containing protein  25.5 
 
 
950 aa  197  9e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3560  M16 family peptidase  26.07 
 
 
949 aa  197  9e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2615  peptidase M16 domain-containing protein  25.69 
 
 
910 aa  194  5e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0381043  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1057  M16 family peptidase  25.16 
 
 
945 aa  194  5e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.867585 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0309  peptidase M16 domain protein  30.3 
 
 
901 aa  187  6e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2987  M16 family peptidase  34.64 
 
 
466 aa  187  6e-46  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.669528  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2078  peptidase M16 domain protein  34.28 
 
 
441 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1867  peptidase M16-like  34.28 
 
 
457 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1218  peptidase M16-like protein  25.33 
 
 
974 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1993  peptidase M16 domain protein  34.04 
 
 
457 aa  184  6e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01173  Peptidase, M16 family protein  23.44 
 
 
930 aa  182  2e-44  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0120262  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1544  peptidase M16 domain-containing protein  29.35 
 
 
440 aa  182  2e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2315  processing peptidase  30.34 
 
 
443 aa  178  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.276856  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2117  putative zinc protease  98.89 
 
 
90 aa  177  6e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0318234 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1272  peptidase M16 domain protein  33.55 
 
 
470 aa  177  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.720642  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0335  peptidase M16, C-terminal:peptidase M16, N-terminal  31.43 
 
 
506 aa  177  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.844691  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01108  peptidase, M16 family protein  24.65 
 
 
954 aa  177  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.690969  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3228  peptidase M16 domain-containing protein  30.04 
 
 
493 aa  177  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.966774 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1972  peptidase M16 domain-containing protein  32.4 
 
 
428 aa  174  7.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1933  peptidase M16-like  32.95 
 
 
459 aa  173  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0501339  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0282  peptidase M16-like protein  31.01 
 
 
504 aa  171  6e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.35404  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2545  peptidase M16  32.35 
 
 
464 aa  171  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2190  peptidase M16 domain protein  26.71 
 
 
879 aa  170  1e-40  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0734  peptidase M16-like protein  31.83 
 
 
470 aa  169  2e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1225  peptidase M16-like  27.75 
 
 
431 aa  167  9e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.522553  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4858  peptidase M16 domain protein  32.51 
 
 
463 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3038  peptidase M16 domain-containing protein  30.04 
 
 
513 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.101443  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1392  peptidase M16-like  33.03 
 
 
489 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.260457  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3948  peptidase M16 domain-containing protein  29.41 
 
 
443 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.843768  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0260  peptidase M16 domain-containing protein  29.78 
 
 
443 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0286002 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3581  peptidase M16 domain-containing protein  30.09 
 
 
461 aa  166  2.0000000000000002e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3165  peptidase M16-like  32.26 
 
 
464 aa  165  3e-39  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0269  peptidase M16 domain protein  31.24 
 
 
494 aa  164  6e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.271306  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2826  peptidase M16-like  31.84 
 
 
952 aa  164  6e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.110257  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0377  insulinase family protein  30.82 
 
 
453 aa  164  7e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.454609  decreased coverage  0.00376869 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3545  peptidase M16 domain-containing protein  30.02 
 
 
422 aa  163  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.408173  normal  0.11594 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0102  peptidase M16-like  36.36 
 
 
458 aa  164  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.49801  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0109  peptidase M16 domain protein  36.36 
 
 
458 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.470915  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3948  peptidase M16 domain-containing protein  33.8 
 
 
429 aa  163  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.425388  normal  0.429143 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0120  peptidase M16 domain protein  36.36 
 
 
458 aa  162  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4179  peptidase M16-like  31.85 
 
 
476 aa  162  3e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.567421  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0303  peptidase M16 domain-containing protein  29.3 
 
 
442 aa  162  3e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04890  putative zinc protease  30.28 
 
 
465 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0467  putative zinc protease  30.28 
 
 
465 aa  162  3e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.723216  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4035  peptidase M16-like  32.47 
 
 
461 aa  162  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.291122 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2346  peptidase M16 domain protein  27.87 
 
 
518 aa  161  5e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0242  peptidase M16 domain protein  30.13 
 
 
477 aa  161  7e-38  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0261  peptidase M16 domain-containing protein  29.84 
 
 
443 aa  160  8e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000513625  normal  0.227904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>