228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2047 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_3477  protein of unknown function DUF214  60.07 
 
 		 884 aa  838    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1527  hypothetical protein  57.81 
 
 		 867 aa  774    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3224  hypothetical protein  62.14 
 
 		 868 aa  847    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.263939  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5155  hypothetical protein  55.06 
 
 		 855 aa  673    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.426312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1291  hypothetical protein  55.53 
 
 		 866 aa  664    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1153  hypothetical protein  62.33 
 
 		 857 aa  861    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2460  protein of unknown function DUF214  58.61 
 
 		 877 aa  721    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.764632  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3114  hypothetical protein  58.5 
 
 		 877 aa  725    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2047  ABC transporter, permease protein  100 
 
 		 844 aa  1589    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.57549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1282  hypothetical protein  63.69 
 
 		 853 aa  776    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000146358 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3628  hypothetical protein  45.93 
 
 		 858 aa  601  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.203673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5006  protein of unknown function DUF214  47.89 
 
 		 857 aa  591  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.624438  normal  0.0207603 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1641  ABC liporpotein exporter, fused inner membrane subunits  48.37 
 
 		 846 aa  586  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.147617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0894  hypothetical protein  45.71 
 
 		 855 aa  581  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.196822  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0804  protein of unknown function DUF214  38.88 
 
 		 835 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0654  ABC transporter, permease protein  38.88 
 
 		 835 aa  379  1e-104  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2144  protein of unknown function DUF214  46.55 
 
 		 408 aa  258  3e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1467  hypothetical protein  30.68 
 
 		 849 aa  258  4e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2155  protein of unknown function DUF214  45.29 
 
 		 445 aa  226  1e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.755011  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1005  hypothetical protein  27.02 
 
 		 858 aa  218  5e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.166389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1312  hypothetical protein  32.38 
 
 		 843 aa  209  2e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.417466  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1272  hypothetical protein  28.96 
 
 		 850 aa  203  9.999999999999999e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2018  protein of unknown function DUF214  30.01 
 
 		 847 aa  203  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000691729 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1994  ABC transporter, permease protein  32.01 
 
 		 837 aa  201  3.9999999999999996e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1858  hypothetical protein  28.16 
 
 		 870 aa  201  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.576802 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2585  hypothetical protein  28.54 
 
 		 866 aa  199  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000661481  normal  0.951642 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11005  adhesion ABC transporter transmembrane protein  27.29 
 
 		 855 aa  198  3e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  6.05567e-37  normal  0.438455 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2209  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 		 847 aa  197  5.000000000000001e-49  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1517  hypothetical protein  27.24 
 
 		 851 aa  184  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1658  hypothetical protein  28 
 
 		 850 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2187  ABC transporter, permease protein  29.71 
 
 		 839 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.424379  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1416  hypothetical protein  32.65 
 
 		 843 aa  175  3.9999999999999995e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.675366  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0122  protein of unknown function DUF214  28.82 
 
 		 845 aa  171  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00908006  hitchhiker  0.000145231 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1921  protein of unknown function DUF214  39.5 
 
 		 842 aa  141  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.270476  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2042  hypothetical protein  37.27 
 
 		 842 aa  140  8.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.056679  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1836  protein of unknown function DUF214  40.13 
 
 		 842 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2636  hypothetical protein  27.45 
 
 		 843 aa  127  1e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.605081  normal  0.364549 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1178  hypothetical protein  28.35 
 
 		 847 aa  127  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.883962  normal  0.792877 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1773  hypothetical protein  36.42 
 
 		 841 aa  124  6e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00954847  normal  0.230312 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0800  protein of unknown function DUF214  27.07 
 
 		 848 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1688  protein of unknown function DUF214  30.77 
 
 		 846 aa  115  4.0000000000000004e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.121796 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3715  protein of unknown function DUF214  24.85 
 
 		 852 aa  113  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.713812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4888  hypothetical protein  27.45 
 
 		 842 aa  110  9.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.355305  normal  0.171205 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2669  hypothetical protein  26.52 
 
 		 820 aa  110  1e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.243432  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2024  predicted permease  22.21 
 
 		 817 aa  110  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5297  protein of unknown function DUF214  26.85 
 
 		 821 aa  105  5e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4397  hypothetical protein  25.76 
 
 		 821 aa  101  7e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.256206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0436  protein of unknown function DUF214  27.97 
 
 		 849 aa  100  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0847  hypothetical protein  27.1 
 
 		 855 aa  97.8  8e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0455  protein of unknown function DUF214  27.54 
 
 		 849 aa  97.4  9e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1848  putative ABC transporter integral membrane protein  26.18 
 
 		 841 aa  97.4  1e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.779452  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02648  hypothetical protein  21.98 
 
 		 817 aa  94  1e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4489  protein of unknown function DUF214  28.35 
 
 		 839 aa  94  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0832  hypothetical protein  22.96 
 
 		 889 aa  92.4  3e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003769  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  22.06 
 
 		 817 aa  92  4e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.660506  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3960  hypothetical protein  27.4 
 
 		 845 aa  88.6  4e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148723  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5674  protein of unknown function DUF214  28.05 
 
 		 838 aa  88.2  6e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.172834  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1235  hypothetical protein  27.51 
 
 		 836 aa  87  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0042131  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0626  hypothetical protein  23.22 
 
 		 845 aa  87  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0867  hypothetical protein  22.44 
 
 		 889 aa  84.7  0.000000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0256  hypothetical protein  25.76 
 
 		 793 aa  83.2  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3422  hypothetical protein  25.22 
 
 		 887 aa  82.8  0.00000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3508  hypothetical protein  22.28 
 
 		 879 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0855  protein of unknown function DUF214  22.21 
 
 		 884 aa  81.3  0.00000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3310  hypothetical protein  24.4 
 
 		 887 aa  80.1  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0856  hypothetical protein  23.12 
 
 		 897 aa  79.3  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20480  ABC-type transport system, involved in lipoprotein release, permease component  27.92 
 
 		 835 aa  78.6  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1177  hypothetical protein  27.15 
 
 		 804 aa  77.8  0.0000000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00247698  normal  0.649292 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0345  hypothetical protein  24.07 
 
 		 819 aa  77  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.427244  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6018  protein of unknown function DUF214  24.32 
 
 		 800 aa  76.6  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1005  hypothetical protein  28.57 
 
 		 827 aa  76.6  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.870248 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3145  hypothetical protein  21.78 
 
 		 878 aa  74.7  0.000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4481  hypothetical protein  22.36 
 
 		 854 aa  74.7  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.180518  normal  0.201948 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0712  hypothetical protein  24.78 
 
 		 889 aa  74.7  0.000000000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001049  ABC-type antimicrobial peptide transport system permease component  23.76 
 
 		 836 aa  74.3  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0457  protein of unknown function DUF214  29.25 
 
 		 866 aa  72.8  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.306104  normal  0.015476 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04771  peptide ABC transporter permease  23.48 
 
 		 836 aa  72.8  0.00000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4776  hypothetical protein  26.29 
 
 		 857 aa  71.2  0.00000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8136  protein of unknown function DUF214  26.35 
 
 		 855 aa  71.2  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7898  protein of unknown function DUF214  31.28 
 
 		 853 aa  69.3  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2783  protein of unknown function DUF214  27.37 
 
 		 930 aa  68.9  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.15972 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1886  hypothetical protein  24.36 
 
 		 821 aa  68.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0637904 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2604  protein of unknown function DUF214  32.82 
 
 		 871 aa  68.9  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.426622  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2350  hypothetical protein  24.67 
 
 		 849 aa  68.9  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.112042  normal  0.313375 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4664  permease  26.02 
 
 		 858 aa  67.8  0.0000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3649  protein of unknown function DUF214  25.14 
 
 		 839 aa  67.4  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.652246 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3202  hypothetical protein  22.94 
 
 		 850 aa  67  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2029  hypothetical protein  26.6 
 
 		 819 aa  66.6  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.349708  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3744  hypothetical protein  25.63 
 
 		 826 aa  65.5  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0400891 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0949  hypothetical protein  27.32 
 
 		 825 aa  65.5  0.000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0156534  normal  0.194364 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1637  ABC transporter, permease protein, putative  26.35 
 
 		 825 aa  64.7  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4107  hypothetical protein  23.68 
 
 		 840 aa  64.7  0.000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0555  hypothetical protein  21.84 
 
 		 865 aa  64.7  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4472  protein of unknown function DUF214  23.88 
 
 		 859 aa  64.3  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0220673  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4731  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 842 aa  62.8  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0079  hypothetical protein  28.25 
 
 		 821 aa  62.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0397  protein of unknown function DUF214  23.96 
 
 		 856 aa  62.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0721103  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0345  protein of unknown function DUF214  29.08 
 
 		 873 aa  61.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.787381  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1348  protein of unknown function DUF214  27.82 
 
 		 846 aa  61.2  0.00000009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2027  hypothetical protein  24.05 
 
 		 815 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>