150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1950 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1950  putative phosphoglycerate mutase protein  100 
 
 		 236 aa  474  1e-133  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.101421 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3186  putative phosphoglycerate mutase  53.85 
 
 		 238 aa  230  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1369  Phosphoglycerate mutase  53.45 
 
 		 238 aa  229  3e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.252939  hitchhiker  0.00300055 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1846  Phosphoglycerate mutase  53.42 
 
 		 244 aa  228  6e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0565276  decreased coverage  0.00463993 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1155  putative phosphoglycerate mutase  55.13 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0632256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0713  putative phosphoglycerate mutase  55.13 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.107866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1324  phosphoglycerate mutase family protein  55.13 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0438  putative phosphoglycerate mutase  55.13 
 
 		 237 aa  227  1e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1315  phosphoglycerate mutase family protein  55.13 
 
 		 237 aa  226  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2170  Phosphoglycerate mutase  53.42 
 
 		 244 aa  226  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00522572  normal  0.0339926 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1804  phosphoglycerate mutase, putative  54.7 
 
 		 237 aa  226  3e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.991276  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1461  phosphoglycerate mutase family protein  54.7 
 
 		 237 aa  224  7e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.861833  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1985  phosphoglycerate mutase  52.99 
 
 		 240 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2015  putative phosphoglycerate mutase protein  54.51 
 
 		 244 aa  216  2.9999999999999998e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.458682  normal  0.0388095 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1085  phosphoglycerate mutase, putative  55.13 
 
 		 237 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1008  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  50.85 
 
 		 241 aa  194  1e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3089  phosphoglycerate mutase  37.04 
 
 		 252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0351305 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2594  phosphoglycerate mutase  31.9 
 
 		 240 aa  105  9e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.440152  normal  0.139098 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0229  fructose-2,6-bisphosphatase  34.78 
 
 		 223 aa  78.2  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3431  Phosphoglycerate mutase  30.14 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0651  phosphoglycerate mutase  34.54 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.761339 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3578  Phosphoglycerate mutase  33.85 
 
 		 225 aa  72.4  0.000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00100767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1007  phosphoglycerate mutase  29.13 
 
 		 241 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3007  phosphoglycerate mutase family protein, putative  30.39 
 
 		 217 aa  68.2  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1553  Phosphoglycerate mutase  32.11 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.233017  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1544  phosphoglycerate mutase  30.69 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3895  alpha-ribazole phosphatase  29.7 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0234787 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1466  Phosphoglycerate mutase  29.56 
 
 		 198 aa  65.1  0.0000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.570916  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3137  alpha-ribazole phosphatase  28.72 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000105722  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3811  alpha-ribazole phosphatase  30.24 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2516  Phosphoglycerate mutase  27.19 
 
 		 448 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2741  phosphoglycerate mutase/fructose-2,6-bisphosphatase  29.9 
 
 		 213 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.195547  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0580  Phosphoglycerate mutase  28.85 
 
 		 221 aa  60.1  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3590  Phosphoglycerate mutase  26.73 
 
 		 448 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0571749  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3598  phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.593139  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0469  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  26.73 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1555  Phosphoglycerate mutase  32.95 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1465  alpha-ribazole phosphatase  26.5 
 
 		 205 aa  58.9  0.00000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4185  phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 		 200 aa  58.9  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05791  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.79 
 
 		 442 aa  58.5  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.840151  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4242  phosphoglycerate mutase  26.09 
 
 		 447 aa  57.8  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0515  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  23.81 
 
 		 442 aa  57.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.85164  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05711  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  24.87 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02509  phosphoglycerate mutase  31.44 
 
 		 214 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1317  metal dependent phosphohydrolase  28.19 
 
 		 591 aa  55.8  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.678364  hitchhiker  0.000242648 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1967  Phosphoglycerate mutase  25.79 
 
 		 447 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05411  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.52 
 
 		 442 aa  53.9  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2039  phosphoglycerate mutase  28.65 
 
 		 214 aa  54.3  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0234  Phosphoglycerate mutase  33.54 
 
 		 181 aa  53.9  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.953882 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1105  phosphoglycerate mutase  27.89 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3445  phosphoglycerate mutase  31.68 
 
 		 223 aa  53.1  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0141958 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0084  Phosphoglycerate mutase  25.96 
 
 		 207 aa  53.5  0.000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1508  Phosphoglycerate mutase  27.27 
 
 		 459 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.980913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2908  Phosphoglycerate mutase  26.06 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3651  phosphoglycerate/bisphosphoglycerate mutase  24.88 
 
 		 449 aa  52.4  0.000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.79129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2449  phosphoglycerate mutase  27.13 
 
 		 204 aa  52.4  0.000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1599  phosphoglycerate mutase  30.43 
 
 		 223 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0911  Phosphoglycerate mutase  29.34 
 
 		 214 aa  52.4  0.000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0485  phosphoglycerate mutase  27.8 
 
 		 445 aa  51.2  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.081071 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4997  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1908  phosphoglycerate mutase  21.29 
 
 		 208 aa  51.2  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.393562  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0678  phosphoglycerate mutase  31.98 
 
 		 215 aa  51.6  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0308276  normal  0.53852 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4943  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4995  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.715455 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4836  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4909  phosphoglycerate mutase  31.93 
 
 		 215 aa  51.2  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0659  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  25.79 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0693  alpha-ribazole-5-phosphate phosphatase, putative  25.79 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3375  Phosphoglycerate mutase  26.46 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.10408 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1322  Phosphoglycerate mutase  21.89 
 
 		 209 aa  50.4  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2181  phosphoglycerate mutase  24.38 
 
 		 452 aa  49.7  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.111968  normal  0.338284 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0008  phosphoglycerate mutase  28.88 
 
 		 241 aa  50.4  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0357979 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1815  Phosphoglycerate mutase  28.82 
 
 		 193 aa  50.1  0.00003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.230674  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2787  Phosphoglycerate mutase  28.29 
 
 		 220 aa  49.7  0.00004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5140  Phosphoglycerate mutase  27.55 
 
 		 214 aa  49.7  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3084  alpha-ribazole phosphatase  26 
 
 		 200 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.237454  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1520  phosphoglycerate mutase 1 family  30.68 
 
 		 212 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.837785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_597  phosphoglycerate mutase family  25.79 
 
 		 200 aa  49.7  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000681703  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3502  Phosphoglycerate mutase  25.49 
 
 		 200 aa  48.9  0.00006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1322  phosphoglycerate mutase 1 family protein  30.11 
 
 		 212 aa  48.5  0.00008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.191359  normal  0.278018 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1052  phosphoglyceromutase  29.59 
 
 		 206 aa  48.5  0.0001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.121789  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0707  phosphoglycerate mutase  25.59 
 
 		 209 aa  47.8  0.0001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2283  Phosphoglycerate mutase  27.98 
 
 		 245 aa  48.5  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000456651  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4586  phosphoglycerate mutase  26.83 
 
 		 253 aa  48.1  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.616156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0808  Phosphoglycerate mutase  29.79 
 
 		 214 aa  48.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0275634 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3088  alpha-ribazole phosphatase  23.5 
 
 		 213 aa  47.4  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000263977  hitchhiker  0.00177034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1756  phosphoglycerate mutase-like protein  24.06 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.14183 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3400  phosphoglycerate mutase  26.4 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0651  phosphoglycerate mutase family protein  24.72 
 
 		 276 aa  47.4  0.0002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1817  Phosphoglycerate mutase  31.52 
 
 		 208 aa  47  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20020  fructose-2,6-bisphosphatase  33.12 
 
 		 226 aa  46.6  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.286624  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1198  phosphoglyceromutase  29.1 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5852  Phosphoglycerate mutase  31.43 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.415555  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1837  putative phosphatase  29.33 
 
 		 233 aa  46.2  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0923568  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0310  phosphoglycerate mutase  28.8 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2812  phosphoglycerate mutase  35.91 
 
 		 251 aa  46.2  0.0004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0602  phosphoglycerate mutase  29.1 
 
 		 218 aa  45.8  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.690788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1615  phosphoglycerate mutase  29.94 
 
 		 237 aa  46.2  0.0005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.979507  normal  0.794966 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_70394  phosphoglycerate mutase  27.37 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.565846 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0701  putative alpha-ribazole-5'-P phosphatase  25.56 
 
 		 442 aa  45.8  0.0006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>