37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1934 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1934  hypothetical protein  100 
 
 		 306 aa  632  1e-180  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00452472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4539  protein of unknown function DUF159  63.19 
 
 		 310 aa  387  1e-106  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7577  hypothetical protein  60 
 
 		 320 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.478095 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1184  hypothetical protein  60.32 
 
 		 315 aa  382  1e-105  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0216  putative uncharacterized conserved protein  59.38 
 
 		 319 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3054  hypothetical protein  59.68 
 
 		 315 aa  381  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2828  protein of unknown function DUF159  57.28 
 
 		 309 aa  352  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.269513  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1230  protein of unknown function DUF159  57.1 
 
 		 312 aa  335  5e-91  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4901  protein of unknown function DUF159  50.62 
 
 		 320 aa  303  2.0000000000000002e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.371034 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6868  hypothetical protein  53.09 
 
 		 303 aa  300  1e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.115334  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6828  hypothetical protein  51.79 
 
 		 303 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.30136  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1375  hypothetical protein  47.53 
 
 		 317 aa  278  1e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.246417  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2401  putative uncharacterized conserved protein  48.38 
 
 		 318 aa  274  1.0000000000000001e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000374097  normal  0.489083 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5702  hypothetical protein  52.43 
 
 		 263 aa  260  2e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6744  hypothetical protein  52.06 
 
 		 263 aa  256  5e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6181  hypothetical protein  54.31 
 
 		 264 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.369858 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3516  hypothetical protein  61.54 
 
 		 130 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.313891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4589  hypothetical protein  61.54 
 
 		 130 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0221  hypothetical protein  50 
 
 		 151 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  31.61 
 
 		 227 aa  55.1  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  28.93 
 
 		 255 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  30 
 
 		 227 aa  50.1  0.00005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0378  hypothetical protein  25.37 
 
 		 207 aa  48.5  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4832  protein of unknown function DUF159  27.95 
 
 		 254 aa  47  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.350202 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  27.04 
 
 		 243 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  31.76 
 
 		 219 aa  45.4  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1302  hypothetical protein  27.45 
 
 		 222 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.24308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  31.58 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  31.25 
 
 		 234 aa  44.3  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1122  protein of unknown function DUF159  33.91 
 
 		 226 aa  44.3  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  25.32 
 
 		 240 aa  44.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_4099  hypothetical protein  27.45 
 
 		 222 aa  44.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  27.88 
 
 		 231 aa  43.9  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  33.33 
 
 		 238 aa  43.9  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2375  hypothetical protein  27.78 
 
 		 241 aa  44.3  0.003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.22179  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2333  hypothetical protein  37.04 
 
 		 246 aa  43.1  0.006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.983451  normal  0.48085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  29.91 
 
 		 231 aa  42.7  0.008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>