299 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1886 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  100 
 
 		 67 aa  134  4e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  91.04 
 
 		 67 aa  124  3e-28  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2857  50S ribosomal protein L35  91.04 
 
 		 67 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.20359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  86.57 
 
 		 67 aa  118  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  86.57 
 
 		 67 aa  117  4.9999999999999996e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3091  ribosomal protein L35  86.57 
 
 		 67 aa  116  9.999999999999999e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.848097  normal  0.0845178 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  83.58 
 
 		 67 aa  113  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2398  50S ribosomal protein L35  82.09 
 
 		 67 aa  111  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.35653  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1450  50S ribosomal protein L35  82.09 
 
 		 67 aa  111  3e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1338  ribosomal protein L35  79.1 
 
 		 73 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1872  ribosomal protein L35  80.6 
 
 		 67 aa  107  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.742216  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  80 
 
 		 65 aa  106  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1892  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.265203  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4617  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00520028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 65 aa  105  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1361  50S ribosomal protein L35  78.46 
 
 		 81 aa  105  3e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.531997  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  76.92 
 
 		 65 aa  103  7e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  75.38 
 
 		 65 aa  101  3e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  73.85 
 
 		 65 aa  100  9e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1777  50S ribosomal protein L35  77.42 
 
 		 62 aa  99  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.786581 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  72.31 
 
 		 65 aa  97.8  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1008  50S ribosomal protein L35  67.69 
 
 		 65 aa  91.7  3e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2675  50S ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 65 aa  90.5  6e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.227493 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  66.15 
 
 		 65 aa  89  2e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3023  50S ribosomal protein L35  63.08 
 
 		 65 aa  80.9  0.000000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0831  50S ribosomal protein L35  67.69 
 
 		 65 aa  77.4  0.00000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.227484  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  63.08 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2306  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0184658  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1665  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  68.6  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2217  ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 94 aa  68.6  0.00000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000246908  normal  0.126884 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  55.56 
 
 		 65 aa  67.4  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  51.56 
 
 		 65 aa  66.2  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2001  50S ribosomal protein L35P  55.56 
 
 		 65 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0130394  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2051  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 65 aa  65.1  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0770661  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0940  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  64.3  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000354984  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2497  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00340395  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  53.12 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02483  50S ribosomal protein L35  52.31 
 
 		 65 aa  63.9  0.0000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00760288  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  63.9  0.0000000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2122  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000215801  normal  0.0294636 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02081  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2182  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0779373  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2150  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000191739  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1953  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.215037  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2328  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000825235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1890  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 65 aa  63.5  0.000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2489  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000637036  hitchhiker  0.0000746157 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1707  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0213276  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003714  LSU ribosomal protein L35p  53.85 
 
 		 64 aa  63.5  0.000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000181829  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2026  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0783263  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2220  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000230929  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2186  50S ribosomal protein L35  55.38 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000722256  normal  0.0355999 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17871  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.262265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  62.4  0.000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0695  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0980955  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  46.88 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2261  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000246297  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1957  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  normal  0.347549 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2019  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000101706  normal  0.0487659 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  47.69 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  62  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  61.6  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2030  50S ribosomal protein L35  53.85 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000722543  hitchhiker  0.0000219314 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1757  50S ribosomal protein L35P  48.48 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000556581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 		 65 aa  61.2  0.000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2995  ribosomal protein L35  51.56 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  50 
 
 		 66 aa  61.2  0.000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2623  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000143878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1822  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000837501  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1714  50S ribosomal protein L35  50.77 
 
 		 65 aa  60.8  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000406642  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0714  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 		 79 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.391408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  48.44 
 
 		 65 aa  60.1  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  58.9  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  50 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1881  50S ribosomal protein L35  45.31 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387064  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1758  50S ribosomal protein L35  49.23 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00368421  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>