289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1788 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1788  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  497  1e-140  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.377991 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3292  integral membrane protein TerC  61.38 
 
 		 248 aa  286  2e-76  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.604318 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0052  integral membrane protein TerC  59.27 
 
 		 253 aa  277  1e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.418667 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2105  integral membrane protein TerC  59.5 
 
 		 250 aa  274  1.0000000000000001e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6267  hypothetical protein  60.58 
 
 		 254 aa  271  1e-71  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49600  Integral membrane protein TerC family  60.96 
 
 		 248 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1926  integral membrane protein TerC  57.68 
 
 		 249 aa  268  5e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.615249  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0032  integral membrane protein TerC  57.48 
 
 		 255 aa  268  8.999999999999999e-71  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43134  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0162  integral membrane protein TerC  60.56 
 
 		 256 aa  267  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1356  integral membrane protein TerC  60.58 
 
 		 255 aa  267  1e-70  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.764248  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0238  integral membrane protein TerC  57.85 
 
 		 252 aa  266  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.606793  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0164  integral membrane protein TerC  60 
 
 		 256 aa  265  5e-70  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.665926 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0038  Integral membrane protein TerC  57.32 
 
 		 249 aa  265  5.999999999999999e-70  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5081  integral membrane protein TerC  58.53 
 
 		 256 aa  265  8e-70  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0792895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1782  integral membrane protein TerC  56.56 
 
 		 248 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.72493 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2234  integral membrane protein TerC  56.28 
 
 		 247 aa  261  6e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0146  integral membrane protein TerC  59.58 
 
 		 265 aa  261  8e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.125302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3668  integral membrane protein TerC  57.44 
 
 		 259 aa  261  8e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.424271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0273  integral membrane protein TerC  53.66 
 
 		 241 aa  260  1e-68  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1919  Integral membrane protein TerC  57.92 
 
 		 253 aa  259  2e-68  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.996169 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1601  integral membrane protein TerC  53.69 
 
 		 250 aa  259  4e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.351996  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0901  Integral membrane protein TerC  54.69 
 
 		 238 aa  258  5.0000000000000005e-68  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00975959  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1180  integral membrane protein TerC  57.38 
 
 		 241 aa  257  1e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000873859 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0655  Integral membrane protein TerC  55.65 
 
 		 253 aa  256  2e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0299  hypothetical protein  56.61 
 
 		 251 aa  255  4e-67  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.481455  hitchhiker  0.0000710089 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72180  putative membrane protein TerC  61.41 
 
 		 254 aa  254  9e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.559812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1686  TerC protein  53.5 
 
 		 239 aa  253  2.0000000000000002e-66  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5995  hypothetical protein  61.83 
 
 		 252 aa  252  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0026  protein YegH  53.06 
 
 		 238 aa  251  6e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4337  Integral membrane protein TerC  55.33 
 
 		 295 aa  251  6e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69320  putative integral membrane transport protein  61.83 
 
 		 252 aa  251  6e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1336  TerC family membrane protein  56.97 
 
 		 245 aa  251  1e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.120091  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3020  Integral membrane protein TerC  55.19 
 
 		 238 aa  251  1e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000258386  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2706  integral membrane protein TerC  56.45 
 
 		 255 aa  250  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000024631  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1936  Integral membrane protein TerC  53.75 
 
 		 250 aa  249  2e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00215857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0055  Integral membrane protein TerC  57.09 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0067  Integral membrane protein TerC  57.09 
 
 		 253 aa  249  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.645865  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1787  S-adenosylmethionine synthetase (methionineadenosyltransferase; AdoMet synthetase; MAT)  53.53 
 
 		 241 aa  248  6e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0051  integral membrane protein TerC  56.68 
 
 		 253 aa  248  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.653903  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2223  Integral membrane protein TerC  55.74 
 
 		 259 aa  247  1e-64  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0786  integral membrane protein TerC  56.67 
 
 		 253 aa  246  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0111606  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1505  protein YegH  50.8 
 
 		 246 aa  244  9e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.0000614006  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3094  integral membrane protein TerC  48.79 
 
 		 518 aa  244  9e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.403437  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47510  integral membrane protein  56.22 
 
 		 252 aa  244  9e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2326  integral membrane protein TerC  47.81 
 
 		 523 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2281  Integral membrane protein TerC  53.53 
 
 		 250 aa  243  1.9999999999999999e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000295379 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3826  integral membrane protein TerC  55.47 
 
 		 238 aa  242  3e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000678399  normal  0.474132 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5729  Integral membrane protein TerC  59.27 
 
 		 249 aa  242  3e-63  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0899  integral membrane protein TerC  57.08 
 
 		 257 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000407273  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3437  CBS domain-containing protein  47.41 
 
 		 523 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527422  normal  0.559328 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2499  integral membrane protein TerC  47.41 
 
 		 523 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0124068  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3200  Integral membrane protein TerC  55.33 
 
 		 238 aa  242  5e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00482853  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2436  integral membrane protein TerC  47.01 
 
 		 523 aa  242  5e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1471  integral membrane protein, TerC family  54.55 
 
 		 240 aa  241  6e-63  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.848938  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2220  Integral membrane protein TerC  51.44 
 
 		 518 aa  241  9e-63  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1942  integral membrane protein TerC  50.4 
 
 		 247 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0501852  hitchhiker  0.0073147 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3219  hypothetical protein  56.85 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0516172  hitchhiker  0.00113241 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3153  protein YegH  56.85 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000196217  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3234  hypothetical protein  56.85 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00228616  hitchhiker  0.000000995784 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3171  protein YegH  56.85 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00710454  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3334  hypothetical protein  56.85 
 
 		 237 aa  240  2e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00486837  hitchhiker  0.00634804 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2187  Integral membrane protein TerC  54.46 
 
 		 245 aa  239  4e-62  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.574145  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2445  integral membrane protein TerC  49.8 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3248  integral membrane protein TerC  49.8 
 
 		 250 aa  238  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.152861  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1753  hypothetical protein  55.19 
 
 		 253 aa  238  6.999999999999999e-62  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3418  Integral membrane protein TerC  49.18 
 
 		 249 aa  238  9e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.232908  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01786  fused predicted membrane protein/conserved protein  49.58 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1827  Integral membrane protein TerC  49.58 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015366  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01774  hypothetical protein  49.58 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1332  CBS domain-containing protein  49.59 
 
 		 518 aa  237  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1372  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.58 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0696189  normal  0.0303689 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2545  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.58 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000249241  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2044  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.58 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00018059  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2082  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  49.58 
 
 		 516 aa  238  1e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000129507  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1906  TerC family/CBS/transporter associated domain-containing protein  49.58 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000647451  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1817  integral membrane protein TerC  49.58 
 
 		 518 aa  238  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.770392  normal  0.565533 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0656  Integral membrane protein TerC  51.19 
 
 		 249 aa  237  1e-61  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0892415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1292  CBS domain-containing protein  49.59 
 
 		 522 aa  237  1e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3180  integral membrane protein TerC  49.21 
 
 		 250 aa  237  2e-61  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.492128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47040  TerC family protein  47.64 
 
 		 515 aa  236  3e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.53321  normal  0.423392 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2342  CBS:transporter-associated region:integral membrane protein TerC  47.79 
 
 		 522 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.112753 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4056  hypothetical protein  47.64 
 
 		 515 aa  235  5.0000000000000005e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.618902  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1303  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.75 
 
 		 519 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0344709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1972  membrane protein, TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.75 
 
 		 519 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0865703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1487  hypothetical protein  48.75 
 
 		 519 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.32064  normal  0.853347 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2029  TerC family/CBS/transporter membrane protein  48.75 
 
 		 519 aa  234  7e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.34644  normal  0.965687 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2385  integral membrane protein TerC  49.59 
 
 		 518 aa  234  7e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2148  Integral membrane protein TerC  49.39 
 
 		 250 aa  234  8e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.252885  normal  0.0306348 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1968  membrane protein TerC family/CBS/transporter associated domain protein  48.75 
 
 		 519 aa  234  8e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0339939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2806  integral membrane protein TerC  49.79 
 
 		 242 aa  234  8e-61  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.225648  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1927  Integral membrane protein TerC  50.61 
 
 		 518 aa  234  1.0000000000000001e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11570  Integral membrane protein, TerC family  49.22 
 
 		 518 aa  233  2.0000000000000002e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4909  Integral membrane protein TerC  53.59 
 
 		 250 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240908  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2532  membrane protein, TerC family  46.99 
 
 		 522 aa  233  3e-60  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3527  integral membrane protein TerC  49.41 
 
 		 250 aa  233  3e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.183926  normal  0.16998 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02680  predicted inner membrane protein  55.6 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000474889  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2980  TerC family integral membrane protein  55.6 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000029602  normal  0.0103566 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3152  TerC family integral membrane protein  55.6 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251436  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02641  hypothetical protein  55.6 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000421681  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0883  integral membrane protein TerC  55.6 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0104396  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>