More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1712 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1931  hypothetical protein  62.68 
 
 
478 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0640277  unclonable  0.000000458124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3317  transposase IS4 family protein  62.47 
 
 
478 aa  636    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.404334  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3556  transposase, IS4 family protein  67.78 
 
 
497 aa  660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4498  transposase IS4 family protein  72.77 
 
 
482 aa  742    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2740  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  999    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.761456  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1712  hypothetical protein  100 
 
 
481 aa  999    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0865922 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5936  IS4 family transposase  73.39 
 
 
481 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6071  IS4 family transposase  72.77 
 
 
481 aa  758    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4801  transposase, IS4 family protein  67.78 
 
 
497 aa  660    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00542003  normal  0.0251535 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5089  IS4 family transposase  74.48 
 
 
482 aa  734    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00232664  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2108  transposase IS4  61.84 
 
 
493 aa  613  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.661967 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3824  transposase IS4  61.64 
 
 
493 aa  613  9.999999999999999e-175  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.431291 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3824  transposase IS4 family protein  60.8 
 
 
478 aa  587  1e-166  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8727  transposase IS4 family protein  57.11 
 
 
479 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8609  transposase IS4 family protein  57.11 
 
 
479 aa  537  1e-151  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5780  transposase IS4 family protein  70.98 
 
 
351 aa  514  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.268012  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3375  ISCps6, transposase  50 
 
 
477 aa  479  1e-134  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.272785  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1199  transposase, IS4  73.15 
 
 
334 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3726  transposase, IS4 family protein  52.74 
 
 
390 aa  397  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0758  putative transposase IS4  68.36 
 
 
275 aa  392  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0860229 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0033  IS4 family transposase  42.86 
 
 
472 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0505315  normal  0.376694 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2794  IS4 family transposase  42.86 
 
 
472 aa  388  1e-106  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2713  hypothetical protein  44.12 
 
 
499 aa  385  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0095  transposase IS4  42.83 
 
 
472 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0968  ISPsy6, transposase  41.6 
 
 
486 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.761396  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1418  ISPsy6, transposase  41.6 
 
 
486 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1439  ISPsy6, transposase  41.6 
 
 
486 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.969212  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1477  ISPsy6, transposase  41.6 
 
 
486 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0568677  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1567  ISPsy6, transposase  41.6 
 
 
486 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1929  ISPsy6, transposase  41.6 
 
 
486 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.931098  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2204  ISPsy6, transposase  41.6 
 
 
486 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3808  ISPsy6, transposase  41.6 
 
 
486 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4060  ISPsy6, transposase  41.6 
 
 
486 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4485  ISPsy6, transposase  41.6 
 
 
486 aa  376  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.935909  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4792  ISPsy6, transposase  41.6 
 
 
486 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0358  ISPsy6, transposase  41.39 
 
 
486 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3734  ISPsy6, transposase  41.39 
 
 
486 aa  375  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.165994  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0759  putative transposase  78.72 
 
 
195 aa  323  6e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.13183 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3039  transposase IS4 family protein  36.67 
 
 
473 aa  291  2e-77  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.409496 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2404  hypothetical protein  56.57 
 
 
251 aa  280  6e-74  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.616396 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3565  hypothetical protein  53.94 
 
 
249 aa  275  2.0000000000000002e-72  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.582404  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2433  transposase, IS4  72.66 
 
 
150 aa  229  6e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.119357  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0914  hypothetical protein  55 
 
 
124 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.770836  normal  0.101303 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0139  ISPsy6 transposase  69.23 
 
 
94 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4843  transposase IS4 family protein  27.99 
 
 
444 aa  134  3e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0683585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1480  transposase, IS4 family protein  25.93 
 
 
452 aa  132  9e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000216314  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2688  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7502  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.121497  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8135  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.36028  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6465  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6804  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0645  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8347  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.553537  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2029  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.843963  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2233  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7792  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.275885  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7909  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0378825  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7856  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8169  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8445  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0788  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.140519  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8505  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7596  transposase IS4 family protein  27.72 
 
 
444 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.729893  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1169  transposase IS4 family protein  28.11 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.0000000000912267  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0625  transposase IS4 family protein  27.51 
 
 
445 aa  132  1.0000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000035382  unclonable  0.0000000000654827 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1107  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000102477  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3601  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227766  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3504  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000103535  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3534  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000144429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0019  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000185671  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0526  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000180348  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0861  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000191702  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0874  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0896  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000120479  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1013  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000243207  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1108  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00911863  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1128  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000155023  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1649  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000032724  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1836  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000324968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2120  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000261492  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2241  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000418169  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2580  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000022544  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2682  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000383398  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2763  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000207771  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3228  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000223138  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3479  transposase, IS4 family protein  25.73 
 
 
452 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.0000000173185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0106  transposase, IS4 family protein  25.54 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000024097  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3154  transposase, IS4 family protein  25.54 
 
 
452 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000034185  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1496  transposase IS4 family protein  27.22 
 
 
445 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000517789  hitchhiker  0.0000000823353 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2634  transposase, IS4 family protein  24.6 
 
 
509 aa  127  3e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1571  transposase IS4 family protein  24.95 
 
 
513 aa  123  6e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0160489  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3408  transposase, IS4 family protein  25.15 
 
 
452 aa  123  6e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00103338  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1576  transposase IS4 family protein  24.25 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0562343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0227  transposase IS4 family protein  24.25 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2272  transposase IS4 family protein  24.25 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2261  transposase IS4 family protein  24.25 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2464  transposase IS4 family protein  24.25 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0786  transposase IS4 family protein  24.25 
 
 
455 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.980261  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0574  transposase IS4 family protein  24.45 
 
 
455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0340  transposase IS4 family protein  24.4 
 
 
455 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.258207  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>