More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1703 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1703  carbonate dehydratase  100 
 
 		 228 aa  463  9.999999999999999e-131  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.326564  normal  0.109582 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1114  carbonate dehydratase  78.87 
 
 		 230 aa  340  1e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0441  carbonate dehydratase  77 
 
 		 225 aa  338  4e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.295258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0432  Carbonate dehydratase  77 
 
 		 225 aa  338  4e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0666  carbonate dehydratase  77 
 
 		 237 aa  332  3e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.780913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  70.62 
 
 		 230 aa  310  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4590  carbonate dehydratase  64.29 
 
 		 255 aa  305  3e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  45.18 
 
 		 233 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  41.55 
 
 		 216 aa  171  1e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  41.15 
 
 		 225 aa  167  9e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  39.91 
 
 		 214 aa  166  2.9999999999999998e-40  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  40.5 
 
 		 207 aa  165  5e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  44.83 
 
 		 787 aa  162  3e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  39.11 
 
 		 213 aa  157  1e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  39.13 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  43.9 
 
 		 236 aa  156  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2975  carbonate dehydratase  41.87 
 
 		 210 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.901133  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  40.31 
 
 		 234 aa  155  5.0000000000000005e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  43 
 
 		 213 aa  155  6e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  39.22 
 
 		 210 aa  154  1e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  40 
 
 		 235 aa  153  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  40 
 
 		 242 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  36.87 
 
 		 210 aa  150  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  39.02 
 
 		 258 aa  151  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  36.14 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  36.14 
 
 		 211 aa  150  1e-35  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4148  carbonate dehydratase  41.24 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.803619 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  40.38 
 
 		 242 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  36.14 
 
 		 211 aa  150  2e-35  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2307  carbonic anhydrase  42.42 
 
 		 211 aa  149  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.89227  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  37.62 
 
 		 210 aa  149  3e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  40.38 
 
 		 242 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  41.03 
 
 		 243 aa  149  4e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  38.54 
 
 		 251 aa  149  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  38.94 
 
 		 214 aa  149  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  40.2 
 
 		 267 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  41.41 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  41.41 
 
 		 239 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  40.2 
 
 		 267 aa  148  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1806  Carbonate dehydratase  41.33 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.661091  normal  0.0837383 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1526  carbonate dehydratase  41.33 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0561548 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  40.38 
 
 		 221 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0464  Carbonate dehydratase  37.31 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  38.1 
 
 		 225 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  39.41 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0287  carbonic anhydrase  37.31 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  41.51 
 
 		 230 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  38.05 
 
 		 248 aa  146  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  40.82 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  41.41 
 
 		 239 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1988  carbonic anhydrase  39.61 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  40.8 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  39.29 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  39.42 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  35.18 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  39.7 
 
 		 227 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  39.29 
 
 		 231 aa  143  3e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 227 aa  142  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2289  carbonate dehydratase  41.12 
 
 		 221 aa  142  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1526  Carbonate dehydratase  41.33 
 
 		 228 aa  141  8e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0449173  normal  0.543544 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0231  Carbonate dehydratase  37.56 
 
 		 214 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2705  carbonate dehydratase  38.35 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  38.81 
 
 		 207 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  38.73 
 
 		 230 aa  140  1.9999999999999998e-32  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  38.05 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  42.18 
 
 		 244 aa  139  4.999999999999999e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  40.57 
 
 		 230 aa  137  8.999999999999999e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0495  carbonate dehydratase  37.25 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  39.32 
 
 		 216 aa  137  1e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  38.89 
 
 		 219 aa  137  2e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0108  carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 216 aa  136  2e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.032472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2491  carbonate dehydratase  35.35 
 
 		 218 aa  137  2e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.184929  normal  0.235188 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0666  carbonate dehydratase  39.27 
 
 		 207 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.48747  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  36.27 
 
 		 356 aa  136  3.0000000000000003e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  38.12 
 
 		 278 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0234  carbonate dehydratase  38 
 
 		 216 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0192853 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  39.06 
 
 		 272 aa  135  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  39.41 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7378  carbonic anhydrase  39.63 
 
 		 225 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  37.93 
 
 		 739 aa  135  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  39.69 
 
 		 234 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  35.92 
 
 		 229 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0067  carbonic anhydrase  37.98 
 
 		 218 aa  132  5e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0346  putative carbonic anhydrase 2  36.95 
 
 		 214 aa  132  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.103822 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  37.55 
 
 		 234 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  39.72 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  39.72 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  39.72 
 
 		 219 aa  131  6.999999999999999e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3911  Carbonate dehydratase  38.73 
 
 		 213 aa  131  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.121235 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  36.2 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  36.2 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  36.2 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  36.2 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  36.2 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  36.2 
 
 		 219 aa  130  1.0000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  40.89 
 
 		 219 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0340  carbonate dehydratase  34.98 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3061  carbonate dehydratase  37.37 
 
 		 213 aa  130  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1268  Carbonate dehydratase  45.45 
 
 		 211 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7207  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  35.91 
 
 		 219 aa  129  4.0000000000000003e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>