More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1649 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.61 
 
 		 1054 aa  697    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.61 
 
 		 1053 aa  682    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  42.43 
 
 		 1023 aa  814    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.47 
 
 		 1034 aa  736    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  43.24 
 
 		 1039 aa  816    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  84.12 
 
 		 1039 aa  1766    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  96.63 
 
 		 1039 aa  1964    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  86.24 
 
 		 1039 aa  1806    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  81.11 
 
 		 1048 aa  1707    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.46 
 
 		 1092 aa  886    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.43 
 
 		 1037 aa  1066    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.14 
 
 		 1066 aa  720    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.3 
 
 		 1071 aa  741    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  39.42 
 
 		 1066 aa  724    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.16 
 
 		 1048 aa  1115    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  36.76 
 
 		 1052 aa  636    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  55.52 
 
 		 1049 aa  1067    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  55.14 
 
 		 1047 aa  1060    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  86.14 
 
 		 1039 aa  1801    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  55.01 
 
 		 1043 aa  1111    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  84.79 
 
 		 1039 aa  1780    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  52.27 
 
 		 1066 aa  1035    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  91.63 
 
 		 1039 aa  1895    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  37.68 
 
 		 1036 aa  667    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  60.66 
 
 		 1034 aa  1249    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.19 
 
 		 1061 aa  733    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  42.63 
 
 		 1041 aa  764    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  54.37 
 
 		 1075 aa  1072    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  57.93 
 
 		 1043 aa  1184    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  55.22 
 
 		 1031 aa  1083    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  58.71 
 
 		 1047 aa  1196    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  52.25 
 
 		 1058 aa  1017    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.08 
 
 		 1049 aa  1068    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.52 
 
 		 1049 aa  1101    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  51.98 
 
 		 1058 aa  1027    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  55.86 
 
 		 1049 aa  1092    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  54.84 
 
 		 1043 aa  1083    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.62 
 
 		 1026 aa  741    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.01 
 
 		 1037 aa  1087    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  41.94 
 
 		 1040 aa  723    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  86.24 
 
 		 1039 aa  1806    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1039 aa  2068    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  42.87 
 
 		 1045 aa  816    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  41.03 
 
 		 1030 aa  632  1e-180  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  36.37 
 
 		 1065 aa  610  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.56 
 
 		 1033 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.72 
 
 		 1029 aa  593  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  34.59 
 
 		 1077 aa  587  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  34.19 
 
 		 1043 aa  588  1e-166  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  36.09 
 
 		 1069 aa  585  1.0000000000000001e-165  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  34 
 
 		 1077 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  33.78 
 
 		 1070 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  34 
 
 		 1077 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  34.16 
 
 		 1070 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  34.16 
 
 		 1070 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  34 
 
 		 1077 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  34.16 
 
 		 1070 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  34.16 
 
 		 1070 aa  585  1.0000000000000001e-165  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  33.9 
 
 		 1077 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  33.9 
 
 		 1077 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  33.9 
 
 		 1077 aa  581  1e-164  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  37.16 
 
 		 1052 aa  580  1e-164  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  33.81 
 
 		 1077 aa  578  1.0000000000000001e-163  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  34.7 
 
 		 1054 aa  574  1.0000000000000001e-162  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  33.68 
 
 		 1053 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  34.16 
 
 		 1064 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  35.45 
 
 		 1032 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  33.68 
 
 		 1053 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.58 
 
 		 1063 aa  575  1.0000000000000001e-162  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  33.58 
 
 		 1063 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  33.68 
 
 		 1053 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  33.68 
 
 		 1053 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  35.28 
 
 		 1040 aa  569  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  35.79 
 
 		 1082 aa  571  1e-161  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.27 
 
 		 1066 aa  568  1e-160  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  35.23 
 
 		 1076 aa  566  1e-160  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  35.39 
 
 		 1031 aa  568  1e-160  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  35.83 
 
 		 1023 aa  567  1e-160  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  36.64 
 
 		 1038 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.22 
 
 		 1070 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  34.76 
 
 		 1034 aa  561  1e-158  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  35.42 
 
 		 1068 aa  561  1e-158  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  35.98 
 
 		 1075 aa  559  1e-158  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  32.29 
 
 		 1049 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  33.46 
 
 		 1059 aa  562  1e-158  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  33.55 
 
 		 1064 aa  562  1e-158  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  33.27 
 
 		 1062 aa  561  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  33.66 
 
 		 1040 aa  560  1e-158  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  35.42 
 
 		 1068 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  35.17 
 
 		 1070 aa  560  1e-158  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  35.53 
 
 		 1075 aa  560  1e-158  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  36.04 
 
 		 1062 aa  560  1e-158  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  34.14 
 
 		 1062 aa  561  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  35.25 
 
 		 1048 aa  561  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  34.54 
 
 		 1076 aa  561  1e-158  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.08 
 
 		 1070 aa  559  1e-158  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  33.87 
 
 		 1032 aa  558  1e-157  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1079  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.92 
 
 		 1022 aa  556  1e-157  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0885781  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  32.99 
 
 		 1083 aa  558  1e-157  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  33.27 
 
 		 1051 aa  557  1e-157  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>