272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1559 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1559  putative transmembrane protein  100 
 
 		 307 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.436342  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2135  protein of unknown function DUF6 transmembrane  70.44 
 
 		 308 aa  310  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2810  hypothetical protein  55.92 
 
 		 310 aa  284  1.0000000000000001e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.834647  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2864  hypothetical protein  51.29 
 
 		 319 aa  229  5e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4675  hypothetical protein  48.53 
 
 		 292 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4465  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.37 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.164822  normal  0.648078 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4599  protein of unknown function DUF6 transmembrane  44.37 
 
 		 295 aa  187  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112434  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01886  hypothetical protein  42.31 
 
 		 292 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5505  hypothetical protein  43.37 
 
 		 296 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_63230  hypothetical protein  42.71 
 
 		 296 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4921  hypothetical protein  41.84 
 
 		 316 aa  177  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.876528  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2858  hypothetical protein  40.21 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2779  hypothetical protein  40.21 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.399846  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1323  hypothetical protein  40.21 
 
 		 296 aa  176  4e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4642  hypothetical protein  43.16 
 
 		 306 aa  169  4e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0734055  normal  0.0123004 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4767  hypothetical protein  43.16 
 
 		 306 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0878197  hitchhiker  0.00351087 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4780  hypothetical protein  43.16 
 
 		 304 aa  169  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.119859  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0377  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.63 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4298  hypothetical protein  39.86 
 
 		 304 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.528973  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0653  hypothetical protein  43.54 
 
 		 306 aa  166  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.005138  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0992  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.94 
 
 		 299 aa  159  8e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.106894  normal  0.426816 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2149  hypothetical protein  41.13 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.327458 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2206  hypothetical protein  41.13 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.500007 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1129  hypothetical protein  41.13 
 
 		 306 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2153  hypothetical protein  41.13 
 
 		 306 aa  152  8.999999999999999e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0413496 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1225  hypothetical protein  40.43 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.157758  normal  0.931863 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0924  hypothetical protein  40.43 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1251  hypothetical protein  40.78 
 
 		 306 aa  150  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.948426 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1580  hypothetical protein  45.58 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1451  hypothetical protein  39.55 
 
 		 307 aa  146  4.0000000000000006e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.680814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1832  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.45 
 
 		 306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.429903  normal  0.305907 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0248  hypothetical protein  40.73 
 
 		 301 aa  145  7.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0458948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3672  DMT family permease  35.64 
 
 		 311 aa  145  8.000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.199096  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1690  carboxylate/amino acid/amine transporter  40.43 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00295335  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2737  hypothetical protein  40.43 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.147206  normal  0.370656 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1684  hypothetical protein  40.43 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0157316 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2061  hypothetical protein  40.43 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0126346  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2192  hypothetical protein  40.43 
 
 		 306 aa  140  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000992606  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1516  hypothetical protein  35.52 
 
 		 306 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.979192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2549  hypothetical protein  38.41 
 
 		 304 aa  124  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.167273  normal  0.466657 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1451  DMT family permease  35.86 
 
 		 309 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.218216 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5590  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.33 
 
 		 314 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0480903  normal  0.681853 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4054  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.62 
 
 		 309 aa  120  3e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0278904  normal  0.0935667 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2664  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.17 
 
 		 309 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0382  hypothetical protein  37.5 
 
 		 312 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.318207  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4000  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.25 
 
 		 321 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1376  hypothetical protein  36.07 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0284  hypothetical protein  33.21 
 
 		 296 aa  106  5e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2045  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.75 
 
 		 315 aa  104  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0682839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0439  hypothetical protein  32.06 
 
 		 325 aa  100  3e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0956  peptide methionine sulfoxide reductase  35.59 
 
 		 519 aa  99.8  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.890834  normal  0.773597 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0659  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.09 
 
 		 321 aa  95.9  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6954  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.35 
 
 		 299 aa  93.2  4e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.850807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1941  hypothetical protein  35.44 
 
 		 299 aa  93.6  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000469065 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2080  hypothetical protein  32.57 
 
 		 494 aa  93.2  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.50066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1183  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.43 
 
 		 309 aa  92.4  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.351558 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0726  hypothetical protein  32.17 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.583386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0709  hypothetical protein  32.17 
 
 		 298 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4337  hypothetical protein  31.52 
 
 		 414 aa  87  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3163  integral membrane protein  31.71 
 
 		 296 aa  85.9  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.08673  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2045  hypothetical protein  32.18 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.225054  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3217  membrane protein  32.29 
 
 		 395 aa  85.9  8e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000559917  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1908  hypothetical protein  32.18 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.760547  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0868  hypothetical protein  32.18 
 
 		 296 aa  85.9  8e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3202  integral membrane protein  32.18 
 
 		 296 aa  85.9  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1110  hypothetical protein  32.06 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2702  hypothetical protein  32.18 
 
 		 316 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.475299  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1729  hypothetical protein  23.84 
 
 		 301 aa  82  0.00000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.520137  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1111  hypothetical protein  32.05 
 
 		 392 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.948246  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10038  transporter, putative  25.95 
 
 		 302 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1406  hypothetical protein  31.12 
 
 		 414 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0104528  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3083  hypothetical protein  33.08 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1535  integral membrane protein  33.08 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0489  hypothetical protein  33.08 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.701558  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1407  integral membrane protein  33.08 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1402  integral membrane protein  33.08 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1203  hypothetical protein  33.08 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0889205  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0663  hypothetical protein  33.08 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.467844  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2838  hypothetical protein  32.95 
 
 		 311 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2188  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.19 
 
 		 295 aa  79  0.00000000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.723736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0799  hypothetical protein  32.22 
 
 		 296 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.818356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1201  hypothetical protein  31.13 
 
 		 402 aa  78.6  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.204073  normal  0.800505 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0346  hypothetical protein  32.22 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.548669  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0747  hypothetical protein  31.13 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.530667  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0830  hypothetical protein  32.22 
 
 		 296 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.100508  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1228  hypothetical protein  31.13 
 
 		 400 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.881059  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02859  integral membrane protein  37.74 
 
 		 159 aa  77.8  0.0000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3922  hypothetical protein  31.11 
 
 		 296 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4022  hypothetical protein  30.04 
 
 		 303 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.486719 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4259  hypothetical protein  29.62 
 
 		 299 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5619  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.37 
 
 		 348 aa  72.4  0.000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.226332 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3994  DMT family permease  29.12 
 
 		 318 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.3 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2908  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.51 
 
 		 300 aa  69.3  0.00000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.450588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2926  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.1 
 
 		 305 aa  69.3  0.00000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5209  hypothetical protein  29.17 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.549002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2022  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.24 
 
 		 312 aa  67.8  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4075  hypothetical protein  29.53 
 
 		 294 aa  67  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5524  hypothetical protein  27.89 
 
 		 298 aa  67  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.895083  normal  0.458924 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2554  hypothetical protein  31.12 
 
 		 296 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>