More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1557 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007948  Bpro_2817  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP-binding  60.28 
 
 		 570 aa  691    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.109002 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2213  Fis family transcriptional regulator  61.03 
 
 		 580 aa  697    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.851331  normal  0.770524 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1865  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  62.19 
 
 		 572 aa  697    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1557  acetolactate synthase large subunit  100 
 
 		 564 aa  1127    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0153426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1228  thiamine pyrophosphate protein  53.9 
 
 		 575 aa  596  1e-169  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.299499  normal  0.940009 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1410  thiamine pyrophosphate protein  53.17 
 
 		 564 aa  588  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.372474  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1291  thiamine pyrophosphate protein  53.62 
 
 		 575 aa  591  1e-167  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0542091  normal  0.167198 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1353  thiamine pyrophosphate protein  55.44 
 
 		 581 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5548  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding  54.46 
 
 		 568 aa  572  1.0000000000000001e-162  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0945  thiamine pyrophosphate protein  50.98 
 
 		 561 aa  563  1.0000000000000001e-159  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.252392  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0138  thiamine pyrophosphate protein  55.05 
 
 		 567 aa  559  1e-158  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3054  thiamine pyrophosphate protein  54.89 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2989  thiamine pyrophosphate protein  54.89 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3933  thiamine pyrophosphate protein  54.89 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4004  thiamine pyrophosphate protein  54.89 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3250  thiamine pyrophosphate protein  54.71 
 
 		 567 aa  561  1e-158  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.492745  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0128  thiamine pyrophosphate protein  54.86 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0427824  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3316  thiamine pyrophosphate protein  54.89 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0136  thiamine pyrophosphate protein  54.86 
 
 		 567 aa  559  1e-158  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1548  thiamine pyrophosphate protein  54.89 
 
 		 567 aa  560  1e-158  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0133  thiamine pyrophosphate protein  54.71 
 
 		 567 aa  558  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.377635  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2917  thiamine pyrophosphate protein  53.79 
 
 		 567 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0138  thiamine pyrophosphate protein  53.79 
 
 		 567 aa  553  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0152  thiamine pyrophosphate protein  53.43 
 
 		 567 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3318  thiamine pyrophosphate protein  54.68 
 
 		 567 aa  546  1e-154  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3016  thiamine pyrophosphate protein  51.71 
 
 		 566 aa  544  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0882  thiamine pyrophosphate protein  51.97 
 
 		 558 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2263  thiamine pyrophosphate protein  53.41 
 
 		 572 aa  534  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  unclonable  0.00000136096  unclonable  0.000000016429 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0051  thiamine pyrophosphate protein  50.54 
 
 		 574 aa  528  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2037  thiamine pyrophosphate protein  50.09 
 
 		 549 aa  530  1e-149  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3885  thiamine pyrophosphate protein  51.08 
 
 		 572 aa  528  1e-149  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1340  thiamine pyrophosphate protein  51.68 
 
 		 565 aa  523  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114748  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0789  thiamine pyrophosphate protein  51.88 
 
 		 564 aa  522  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000306468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0313  thiamine pyrophosphate protein  50.98 
 
 		 557 aa  525  1e-147  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2795  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  52.2 
 
 		 572 aa  521  1e-146  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.595093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3250  thiamine pyrophosphate protein  52.9 
 
 		 552 aa  521  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0654784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2885  thiamine pyrophosphate protein  49.37 
 
 		 552 aa  519  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1062  acetolactate synthase, large subunit  50 
 
 		 556 aa  520  1e-146  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2520  thiamine pyrophosphate protein  51.5 
 
 		 565 aa  521  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00121235 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1643  thiamine pyrophosphate protein  52.9 
 
 		 559 aa  517  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.147049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2625  thiamine pyrophosphate protein  49.19 
 
 		 555 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5061  thiamine pyrophosphate protein  50.27 
 
 		 567 aa  515  1.0000000000000001e-145  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  0.490143 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4600  thiamine pyrophosphate protein  50.27 
 
 		 567 aa  514  1e-144  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0879686 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2121  thiamine pyrophosphate protein  49.91 
 
 		 548 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.299662 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2933  thiamine pyrophosphate protein  48.38 
 
 		 550 aa  509  1e-143  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1264  thiamine pyrophosphate protein  52.69 
 
 		 558 aa  511  1e-143  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.197192  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1636  thiamine pyrophosphate protein  50.54 
 
 		 559 aa  511  1e-143  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.929542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38200  thiamine pyrophosphate protein  51.81 
 
 		 552 aa  509  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00112999 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2117  thiamine pyrophosphate protein  52.44 
 
 		 556 aa  506  9.999999999999999e-143  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.925616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1932  acetolactate synthase, large subunit  48.83 
 
 		 570 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.461619 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6522  thiamine pyrophosphate protein  52.42 
 
 		 561 aa  498  1e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.037846 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0284  thiamine pyrophosphate protein  49.19 
 
 		 576 aa  497  1e-139  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0633  thiamine pyrophosphate protein  51.55 
 
 		 553 aa  498  1e-139  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.151923  normal  0.532094 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6728  thiamine pyrophosphate protein  49.82 
 
 		 566 aa  498  1e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.988038  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0998  thiamine pyrophosphate protein  48.31 
 
 		 559 aa  493  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.79453  normal  0.343483 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1497  thiamine pyrophosphate protein  51.3 
 
 		 582 aa  488  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3275  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  49.38 
 
 		 559 aa  485  1e-135  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000365661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1101  thiamine pyrophosphate protein  47.79 
 
 		 559 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.805378  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1620  thiamine pyrophosphate protein  46.22 
 
 		 567 aa  475  1e-132  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.738779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2607  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  47.67 
 
 		 558 aa  449  1e-125  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.614627 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0382  thiamine pyrophosphate protein  41.89 
 
 		 552 aa  428  1e-118  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0137  thiamine pyrophosphate protein  44.48 
 
 		 538 aa  423  1e-117  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.239979  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1163  thiamine pyrophosphate protein  42.65 
 
 		 568 aa  425  1e-117  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.256596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4942  thiamine pyrophosphate protein  42.07 
 
 		 567 aa  422  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1252  thiamine pyrophosphate protein  41.42 
 
 		 551 aa  409  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21480  thiamine pyrophosphate-dependent enzyme, possible carboligase or decarboxylase  37.43 
 
 		 551 aa  347  5e-94  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3550  acetolactate synthase, large subunit  40.15 
 
 		 583 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2477  thiamine pyrophosphate enzyme-like TPP binding region  42.65 
 
 		 543 aa  335  1e-90  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.374586  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0664  putative pyruvate decarboxylase  37.96 
 
 		 561 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0915  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  41.71 
 
 		 560 aa  327  4.0000000000000003e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.634895 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1115  putative acetolactate synthase large subunit  40.64 
 
 		 586 aa  312  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0471394  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0036  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40.2 
 
 		 543 aa  306  5.0000000000000004e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1114  putative pyruvate decarboxylase  41.05 
 
 		 587 aa  299  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2955  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  39.68 
 
 		 565 aa  296  8e-79  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.836437  normal  0.0528961 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3681  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.1 
 
 		 586 aa  261  2e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.358413  normal  0.114348 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3776  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.02 
 
 		 548 aa  253  8.000000000000001e-66  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4032  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.13 
 
 		 548 aa  251  2e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.965417  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4221  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.94 
 
 		 548 aa  250  5e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0138  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.4 
 
 		 548 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4183  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.4 
 
 		 548 aa  246  8e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.224573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4291  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.4 
 
 		 548 aa  246  9.999999999999999e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.700125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.09 
 
 		 566 aa  245  9.999999999999999e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5914  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.59 
 
 		 588 aa  245  1.9999999999999999e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4232  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.21 
 
 		 548 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.351874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5202  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.21 
 
 		 548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3329  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  34.89 
 
 		 578 aa  244  3.9999999999999997e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.591323 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4111  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.84 
 
 		 548 aa  244  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4279  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.65 
 
 		 548 aa  243  6e-63  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4126  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.21 
 
 		 548 aa  243  6e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4152  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.21 
 
 		 548 aa  243  7e-63  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4234  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.46 
 
 		 548 aa  242  2e-62  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.194744  normal  0.310929 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3985  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.46 
 
 		 548 aa  242  2e-62  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03646  acetolactate synthase II, valine insensitive, large subunit  33.46 
 
 		 548 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0646243  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0147  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  32.04 
 
 		 558 aa  241  2.9999999999999997e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03595  hypothetical protein  33.46 
 
 		 548 aa  241  2.9999999999999997e-62  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0633614  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0717  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  34.25 
 
 		 574 aa  240  4e-62  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4134  acetolactate synthase 2 catalytic subunit  33.27 
 
 		 548 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.82212  normal  0.957886 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  31.44 
 
 		 560 aa  238  2e-61  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.68 
 
 		 581 aa  237  3e-61  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.19 
 
 		 552 aa  236  7e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>