More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1525 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_1774  Na+/solute symporter  49.86 
 
 		 687 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0630  solute/sodium symporter (SSS) family protein  52.72 
 
 		 671 aa  672    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.449761  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1951  solute:Na+ symporter permease transmembrane protein  51.37 
 
 		 688 aa  664    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.788395  normal  0.806133 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2098  SSS sodium solute transporter superfamily  50.65 
 
 		 687 aa  663    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.275416 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3139  Na+ symporter  52.55 
 
 		 637 aa  664    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1792  sodium:solute symporter family protein  53.17 
 
 		 671 aa  673    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.415447  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1637  Na+/solute symporter  55.69 
 
 		 678 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.75635 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1525  putative membrane transport protein  100 
 
 		 713 aa  1430    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.11543 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2228  Na+/solute symporter  52.31 
 
 		 683 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0866  putative membrane transport protein  57.27 
 
 		 699 aa  710    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.201818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2877  Na+/solute symporter  56.21 
 
 		 695 aa  687    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.81009  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1940  sodium:solute symporter family protein  53.02 
 
 		 807 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2831  Na+/solute symporter  59.68 
 
 		 703 aa  810    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5518  Na+/solute symporter  52.43 
 
 		 671 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.703917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2052  solute/sodium symporter (SSS) family protein  53.17 
 
 		 671 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.483179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2107  Na+/solute symporter  51.69 
 
 		 671 aa  646    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.911895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2364  Calcium-binding EF-hand-containing protein  55.91 
 
 		 695 aa  688    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.267814  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0786  solute/sodium symporter (SSS) family protein  53.17 
 
 		 671 aa  673    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1936  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  51.25 
 
 		 672 aa  660    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2015  sodium:solute symporter family protein  53.02 
 
 		 671 aa  674    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.168656  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2192  Na+/solute symporter  58.25 
 
 		 769 aa  702    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.560167  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2214  Na+/solute symporter  52.58 
 
 		 671 aa  667    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.397969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3039  Na+/solute symporter  72.36 
 
 		 703 aa  986    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4144  Na+/solute symporter  76.18 
 
 		 705 aa  984    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.269765  normal  0.051822 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5062  Na+/solute symporter  54.62 
 
 		 699 aa  724    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37773 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3111  solute/Na+ symporter  51.84 
 
 		 672 aa  654    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0392033  decreased coverage  0.0000204813 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2269  Na+/solute symporter  51.37 
 
 		 683 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0596593  normal  0.278439 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2647  SSS sodium solute transporter superfamily  58.07 
 
 		 681 aa  761    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.81017  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5888  Na+/solute symporter  52.43 
 
 		 671 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1418  Na+/solute symporter  51.84 
 
 		 672 aa  656    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.181341 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0532  solute/sodium symporter (SSS) family protein  53.17 
 
 		 671 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2228  Na+/solute symporter  51.69 
 
 		 671 aa  642    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2396  Na+/solute symporter  71.66 
 
 		 726 aa  957    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.79359 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2189  Na+/solute symporter  52.43 
 
 		 671 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1079  sodium:solute symporter family protein  53.17 
 
 		 671 aa  673    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105225  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2052  Na+/solute symporter  54.77 
 
 		 702 aa  725    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.698797  normal  0.324787 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1087  Na+/solute symporter  53.01 
 
 		 671 aa  648    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.215072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1384  Na+/solute symporter  54.41 
 
 		 676 aa  631  1e-179  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.604499  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1628  Na+/solute symporter  44.65 
 
 		 722 aa  585  1e-166  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2264  Na+/solute symporter  44.78 
 
 		 722 aa  561  1e-158  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000152914 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3462  Na+/solute symporter  44.05 
 
 		 719 aa  527  1e-148  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0141049  normal  0.192987 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1022  SSF family Na(+)/solute symporter  48.92 
 
 		 614 aa  285  3.0000000000000004e-75  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.12655  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0245  SSS sodium solute transporter superfamily  45.78 
 
 		 729 aa  279  1e-73  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0351  Na+/solute symporter  55.2 
 
 		 759 aa  248  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.572111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0112  Na+/solute symporter  51.49 
 
 		 760 aa  243  7.999999999999999e-63  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2479  putative sodium symporter protein  38.46 
 
 		 593 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.025526 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0555  Na+/solute symporter  41.33 
 
 		 591 aa  229  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0630  sodium:solute symporter family protein  38.86 
 
 		 591 aa  226  2e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0525  Na+/solute symporter  37.35 
 
 		 573 aa  226  2e-57  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2278  putative sodium/solute symporter  45.45 
 
 		 567 aa  215  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1298  SSS sodium solute transporter superfamily  39.88 
 
 		 575 aa  214  3.9999999999999995e-54  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.883366 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1547  Na+/solute symporter  46.06 
 
 		 572 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1523  sodium/solute symporter family protein  45.97 
 
 		 572 aa  213  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2857  sodium/solute symporter family protein  51.24 
 
 		 578 aa  212  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1496  Na+/solute symporter  47.79 
 
 		 558 aa  211  3e-53  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.289055  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2838  Na+/solute symporter  50.99 
 
 		 572 aa  211  3e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000149628 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0319  Na+/solute symporter  39.1 
 
 		 566 aa  211  3e-53  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal  0.0129001 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1575  Na+/solute symporter  51.24 
 
 		 578 aa  211  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000206657 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1514  Na+/solute symporter  51.24 
 
 		 578 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136717 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1581  Na+/solute symporter  51.24 
 
 		 578 aa  211  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.292931  normal  0.0106381 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1746  Na+/solute symporter  45.42 
 
 		 572 aa  211  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000905196 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1177  Na+/solute symporter  37.92 
 
 		 559 aa  210  6e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2358  Na+/solute symporter  50.75 
 
 		 578 aa  210  6e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00721  Na+/solute symporter, Ssf family protein  45.04 
 
 		 568 aa  210  6e-53  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2752  Na+/solute symporter  49.28 
 
 		 578 aa  210  7e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2673  Na+/solute symporter  49.28 
 
 		 578 aa  210  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2638  Na+/solute symporter  49.28 
 
 		 578 aa  210  8e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1711  Na+/solute symporter  49.28 
 
 		 578 aa  210  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.18634  hitchhiker  0.000000238348 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1696  Na+/solute symporter  50.25 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2828  putative sodium/solute symporter  44.21 
 
 		 567 aa  209  1e-52  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2371  Na+/solute symporter  44.96 
 
 		 572 aa  209  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000181178 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1771  Na+/solute symporter  53.09 
 
 		 589 aa  209  1e-52  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.509872 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3406  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  47.41 
 
 		 560 aa  207  4e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.210868 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1651  Na+/solute symporter  50.75 
 
 		 590 aa  206  2e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.466603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0263  Na+/solute symporter  48.76 
 
 		 572 aa  205  2e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1439  Na+ symporter  38.68 
 
 		 588 aa  204  3e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3832  symporter  47.52 
 
 		 586 aa  204  4e-51  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.539605 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3696  SSS family solute/sodium (Na+) symporter  44.68 
 
 		 582 aa  204  5e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1794  Na+/solute symporter  38.14 
 
 		 594 aa  203  8e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0136163  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3837  SSS sodium solute transporter superfamily  46.26 
 
 		 582 aa  202  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0088  sodium:solute symporter family protein  49.5 
 
 		 604 aa  202  9.999999999999999e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.208798 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0486  sodium:solute symporter family protein  38.76 
 
 		 594 aa  203  9.999999999999999e-51  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.355483  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4552  Na+/solute symporter  49.5 
 
 		 603 aa  202  9.999999999999999e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3754  SSS sodium solute transporter superfamily  46.26 
 
 		 582 aa  202  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.40696  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5743  putative sodium symporter protein  53.14 
 
 		 619 aa  201  3.9999999999999996e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002207  acetate permease ActP (cation/acetate symporter)  48.57 
 
 		 575 aa  200  7.999999999999999e-50  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1865  putative sodium symporter protein  36.23 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.151601  normal  0.340772 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2050  Na+/solute symporter  48.26 
 
 		 593 aa  199  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.500291 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00160  sodium/solute symporter  48.1 
 
 		 575 aa  199  2.0000000000000003e-49  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0900  Na+/solute symporter  39.41 
 
 		 588 aa  199  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1263  Na+/solute symporter  46.53 
 
 		 618 aa  198  4.0000000000000005e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.625499  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0871  Na+/solute symporter  37.11 
 
 		 593 aa  197  5.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1042  Na+/solute symporter  48.79 
 
 		 609 aa  197  8.000000000000001e-49  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.972047  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4101  Na+/solute symporter  43.61 
 
 		 589 aa  196  1e-48  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3556  sodium/solute symporter family protein  47.09 
 
 		 598 aa  196  1e-48  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4040  putative sodium symporter protein  37.58 
 
 		 551 aa  195  2e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.824873  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3155  ribonuclease E and G  39.13 
 
 		 589 aa  195  3e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0279  Na+/solute symporter  48.76 
 
 		 622 aa  192  1e-47  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0772633  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1570  Na+/solute symporter  25.97 
 
 		 693 aa  192  2e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4952  sodium/solute symporter family protein  44.44 
 
 		 596 aa  192  2.9999999999999997e-47  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>