More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1495 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1495  TonB-dependent siderophore receptor, putative  100 
 
 		 711 aa  1438    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.454643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2394  TonB-dependent siderophore receptor  50.69 
 
 		 729 aa  694    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1993  TonB-dependent siderophore receptor  32.88 
 
 		 719 aa  344  4e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.811377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5420  TonB-dependent siderophore receptor  32.53 
 
 		 743 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00589363  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3576  TonB-dependent siderophore receptor  32.62 
 
 		 743 aa  327  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0391438 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4689  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 		 743 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.141202  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3674  TonB-dependent siderophore receptor  32.24 
 
 		 743 aa  318  2e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.450242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2436  TonB-dependent siderophore receptor  31.9 
 
 		 743 aa  317  5e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.849974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3848  TonB-dependent siderophore receptor  32.38 
 
 		 743 aa  317  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.617009 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5036  TonB-dependent siderophore receptor  32.48 
 
 		 751 aa  313  6.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.549683 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02690  TonB-dependent outer membrane Receptor  32.68 
 
 		 704 aa  307  5.0000000000000004e-82  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1847  TonB-dependent siderophore receptor  32.1 
 
 		 729 aa  297  6e-79  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.343723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3864  TonB-dependent siderophore receptor  32.09 
 
 		 710 aa  296  1e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0182976  normal  0.0196444 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0150  TonB-dependent siderophore receptor  30.89 
 
 		 729 aa  285  2.0000000000000002e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1424  TonB-dependent siderophore receptor  30.86 
 
 		 710 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.550485 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1460  TonB-dependent siderophore receptor  30.74 
 
 		 712 aa  276  9e-73  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0192209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3769  TonB-dependent siderophore receptor  29.42 
 
 		 724 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.503702  normal  0.128914 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1610  TonB-dependent siderophore receptor, putative  30.67 
 
 		 724 aa  264  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.317263  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4079  TonB-dependent siderophore receptor  27.8 
 
 		 727 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0531  TonB-dependent siderophore receptor  27.6 
 
 		 727 aa  215  1.9999999999999998e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.45334 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5029  TonB-dependent siderophore receptor  27.56 
 
 		 708 aa  206  1e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6693  TonB-dependent siderophore receptor  27.29 
 
 		 726 aa  204  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.907714  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1104  TonB-dependent siderophore receptor  27.03 
 
 		 728 aa  186  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0413225  normal  0.151659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0225  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 707 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0800  putative ferrisiderophore receptor signal peptide protein  28.02 
 
 		 705 aa  186  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2864  TonB-dependent siderophore receptor  29.18 
 
 		 707 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0243  TonB-dependent siderophore receptor  29.04 
 
 		 707 aa  184  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  27.24 
 
 		 698 aa  181  4e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3345  TonB-dependent siderophore receptor  28.93 
 
 		 738 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0747  TonB-dependent siderophore receptor  26.78 
 
 		 702 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.429786 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1819  TonB-dependent siderophore receptor  27.5 
 
 		 742 aa  167  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258829  decreased coverage  0.00296293 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0817  TonB-dependent siderophore receptor  26.43 
 
 		 702 aa  163  1e-38  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.682704 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3471  TonB-dependent siderophore receptor  25.52 
 
 		 728 aa  160  1e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2781  TonB-dependent siderophore receptor  26.61 
 
 		 805 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.150566  normal  0.217763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3225  TonB-dependent siderophore receptor  25.22 
 
 		 715 aa  155  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.251172  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3327  TonB-dependent siderophore receptor  27.34 
 
 		 804 aa  152  2e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.218834 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3084  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 819 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0746  TonB-dependent siderophore receptor  25.24 
 
 		 774 aa  148  3e-34  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.612883  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1736  TonB-dependent receptor protein  26.98 
 
 		 737 aa  146  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00567556  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4128  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 811 aa  146  1e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4499  TonB-dependent siderophore receptor  24.63 
 
 		 706 aa  145  3e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.883355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5515  TonB-dependent siderophore receptor  24.93 
 
 		 726 aa  143  9.999999999999999e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3864  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 811 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.952597 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0859  TonB-dependent siderophore receptor  23.74 
 
 		 716 aa  142  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.308459  normal  0.654986 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3798  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 809 aa  141  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.448814 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5891  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 772 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2186  TonB-dependent siderophore receptor  24.89 
 
 		 772 aa  140  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3007  TonB-dependent siderophore receptor  27.19 
 
 		 730 aa  140  1e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.796938 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1088  TonB-dependent siderophore receptor  24.71 
 
 		 737 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5451  TonB-dependent siderophore receptor  26.67 
 
 		 823 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.877438 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3575  TonB-dependent siderophore receptor  26.79 
 
 		 801 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3544  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 727 aa  135  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1028  TonB-dependent siderophore receptor  25.83 
 
 		 718 aa  135  3.9999999999999996e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.289591  normal  0.407367 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2339  TonB-dependent siderophore receptor  27.47 
 
 		 800 aa  134  6e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26410  TonB-dependent siderophore receptor  26.36 
 
 		 742 aa  132  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1003  TonB-dependent siderophore receptor  24.03 
 
 		 758 aa  132  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0946  TonB-dependent siderophore receptor  25.15 
 
 		 715 aa  131  4.0000000000000003e-29  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3374  putative tonB-dependent receptor protein  25.88 
 
 		 804 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.128787  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1110  TonB-dependent siderophore receptor  24.43 
 
 		 768 aa  131  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3692  TonB-dependent siderophore receptor  24.86 
 
 		 685 aa  130  6e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.235893  normal  0.294422 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2582  TonB-dependent siderophore receptor  26.11 
 
 		 802 aa  130  8.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.431715  normal  0.0101305 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  26.47 
 
 		 757 aa  130  8.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2196  TonB-dependent siderophore receptor  26.39 
 
 		 801 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.614035  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39820  putative tonB-dependent receptor protein  25.88 
 
 		 804 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4497  ferric siderophore receptor protein (TonB-dependent siderophore receptor)  25.34 
 
 		 744 aa  130  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00504252  normal  0.0702404 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1878  TonB-dependent siderophore receptor  26.52 
 
 		 722 aa  129  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3385  TonB-dependent siderophore receptor  25.53 
 
 		 730 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39890  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 708 aa  127  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.596471  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3561  TonB-dependent siderophore receptor  26.75 
 
 		 713 aa  127  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1108  TonB-dependent siderophore receptor  24.2 
 
 		 761 aa  125  3e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.441045 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0434  TonB-dependent siderophore receptor  22.8 
 
 		 753 aa  124  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1500  TonB-dependent siderophore receptor  23.56 
 
 		 755 aa  124  5e-27  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000356406  normal  0.318798 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30860  TonB-dependent siderophore receptor  25.65 
 
 		 710 aa  123  9.999999999999999e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.950998  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4496  ferric siderophore receptor protein  25.77 
 
 		 804 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.131724 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2068  TonB-dependent siderophore receptor  24.7 
 
 		 729 aa  121  4.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.839532  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3462  TonB-dependent siderophore receptor  25.36 
 
 		 728 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2858  TonB-dependent siderophore receptor  24.78 
 
 		 756 aa  118  3e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.578501  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0972  TonB-dependent siderophore receptor  25.45 
 
 		 762 aa  119  3e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.804591  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3029  TonB-dependent siderophore receptor  25.04 
 
 		 718 aa  118  3e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  24.61 
 
 		 722 aa  117  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3686  TonB-dependent siderophore receptor  25.25 
 
 		 754 aa  117  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00871  ferric siderophore receptor protein  25 
 
 		 746 aa  117  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.619675  normal  0.877748 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  28.32 
 
 		 722 aa  115  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0825  TonB-dependent siderophore receptor  22.08 
 
 		 759 aa  115  3e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.000404003  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4406  TonB-dependent siderophore receptor  27.35 
 
 		 709 aa  114  5e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.684267  normal  0.0387925 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1044  TonB-dependent siderophore receptor  24.68 
 
 		 724 aa  113  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00225756 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2590  outer membrane ferric siderophore receptor  25.75 
 
 		 771 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.238925 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0629  putative ferric siderophore receptor protein  24.82 
 
 		 700 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.466758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3800  TonB-dependent siderophore receptor  25.58 
 
 		 712 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.647138 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5758  TonB-dependent siderophore receptor  25.16 
 
 		 815 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0192  TonB-dependent siderophore receptor  25.5 
 
 		 710 aa  111  6e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3611  homoserine O-acetyltransferase  23.82 
 
 		 699 aa  110  9.000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000219924  decreased coverage  0.00028675 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3358  TonB-dependent siderophore receptor  24.45 
 
 		 808 aa  110  1e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.260724  normal  0.726447 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0979  TonB-dependent siderophore receptor  24.5 
 
 		 724 aa  108  2e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.16439 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0983  TonB-dependent siderophore receptor  24.32 
 
 		 723 aa  108  2e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.698273  normal  0.622732 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1156  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 715 aa  107  1e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3527  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 761 aa  106  1e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.650234 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1122  TonB-dependent siderophore receptor  24.19 
 
 		 701 aa  107  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.625422  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4103  TonB-dependent siderophore receptor  24.3 
 
 		 710 aa  105  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.615047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2049  TonB-dependent siderophore receptor  23.82 
 
 		 764 aa  106  2e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.379645  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>