More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1410 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1410  NADH-ubiquinone oxidoreductase, chain H  100 
 
 
354 aa  696    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0192046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1508  NADH dehydrogenase (quinone)  84.42 
 
 
352 aa  607  9.999999999999999e-173  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00230102 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1431  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  82.84 
 
 
347 aa  576  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3249  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  79.67 
 
 
359 aa  572  1.0000000000000001e-162  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal  0.99493 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3503  NADH dehydrogenase (quinone)  78.61 
 
 
358 aa  562  1.0000000000000001e-159  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2806  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  74.17 
 
 
360 aa  540  9.999999999999999e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.18008 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1500  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  73.33 
 
 
360 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.407622  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1270  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  76.54 
 
 
358 aa  536  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577463  normal  0.231678 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0879  NADH dehydrogenase (quinone)  76.63 
 
 
358 aa  533  1e-150  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0964  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  76.25 
 
 
358 aa  530  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.890655  normal  0.0815435 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5173  NADH dehydrogenase (quinone)  71.67 
 
 
358 aa  523  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2055  NADH dehydrogenase subunit H  67.23 
 
 
354 aa  510  1e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.845348  normal  0.111844 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1884  NADH dehydrogenase subunit H  67.51 
 
 
354 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.499476 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2207  NADH dehydrogenase subunit H  67.8 
 
 
354 aa  509  1e-143  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0828  NADH dehydrogenase (quinone)  68.21 
 
 
357 aa  499  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.508833  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1044  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  67.63 
 
 
357 aa  497  1e-139  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0934  NADH dehydrogenase subunit H  64.69 
 
 
354 aa  488  1e-137  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.284795  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0968  NADH dehydrogenase subunit H  64.69 
 
 
354 aa  485  1e-136  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.000216716  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1822  NADH dehydrogenase subunit H  64.97 
 
 
354 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1297  NADH dehydrogenase subunit H  64.97 
 
 
354 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0730  NADH dehydrogenase subunit H  65.25 
 
 
352 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1068  NADH dehydrogenase subunit H  64.97 
 
 
354 aa  478  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.393482  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1137  NADH dehydrogenase subunit H  65.25 
 
 
352 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.21954  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1306  NADH dehydrogenase subunit H  64.97 
 
 
354 aa  478  1e-134  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310295  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1749  NADH dehydrogenase (quinone)  65.54 
 
 
349 aa  481  1e-134  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.658277  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0420  NADH dehydrogenase subunit H  65.25 
 
 
352 aa  478  1e-134  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1035  NADH dehydrogenase subunit H  66.29 
 
 
355 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.262933  normal  0.291469 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5570  NADH dehydrogenase subunit H  65.72 
 
 
355 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.171146 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2159  NADH dehydrogenase subunit H  65.44 
 
 
355 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.367995  normal  0.780318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2280  NADH dehydrogenase subunit H  65.44 
 
 
355 aa  465  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421689  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1442  NADH dehydrogenase subunit H  66.47 
 
 
333 aa  462  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.583863  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1350  NADH dehydrogenase subunit H  64.97 
 
 
354 aa  463  1e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0612742  hitchhiker  0.00613103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2266  NADH dehydrogenase subunit H  65.16 
 
 
355 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.553652  normal  0.191599 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3207  NADH dehydrogenase subunit H  64.69 
 
 
354 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.010712  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1630  NADH dehydrogenase subunit H  65.16 
 
 
355 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2242  NADH dehydrogenase subunit H  65.16 
 
 
355 aa  458  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0956  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  65.54 
 
 
349 aa  457  1e-127  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0350312  normal  0.369744 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2002  NADH dehydrogenase subunit H  63.84 
 
 
354 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.4994  normal  0.0583966 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1098  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  60.11 
 
 
366 aa  417  9.999999999999999e-116  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2623  NADH-quinone oxidoreductase, H subunit  61.61 
 
 
341 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.434757  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2054  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  63.48 
 
 
339 aa  410  1e-113  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.470094  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2250  NADH dehydrogenase (quinone)  61.61 
 
 
341 aa  411  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.6256  hitchhiker  0.0000133524 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2558  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  63.69 
 
 
344 aa  403  1e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.59058  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1149  NADH dehydrogenase I chain H  63.8 
 
 
343 aa  394  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3628  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  54.07 
 
 
343 aa  378  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.154077 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2824  NADH dehydrogenase subunit H  55.26 
 
 
364 aa  372  1e-102  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00869776  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1610  NADH dehydrogenase (ubiquinone), H subunit  55.96 
 
 
340 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0247  NADH dehydrogenase subunit H  54.57 
 
 
363 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1957  NADH dehydrogenase (quinone)  55.65 
 
 
352 aa  368  1e-101  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.206938  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0553  NADH-quinone oxidoreductase chain H  55.96 
 
 
340 aa  371  1e-101  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01294  NADH dehydrogenase subunit H  54.63 
 
 
363 aa  369  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.31889  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0276  NADH dehydrogenase subunit H  54.57 
 
 
363 aa  367  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1562  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  53.05 
 
 
337 aa  366  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1963  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  57.73 
 
 
339 aa  367  1e-100  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.787687  normal  0.0372303 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2829  NADH-quinone oxidoreductase chain H  56.27 
 
 
340 aa  362  4e-99  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2698  NADH-quinone oxidoreductase chain H  55.96 
 
 
340 aa  362  5.0000000000000005e-99  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1758  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  59.63 
 
 
337 aa  361  8e-99  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.482564  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0824  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  56.39 
 
 
354 aa  360  2e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.877991  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0993  NADH dehydrogenase (quinone)  60.29 
 
 
354 aa  354  1e-96  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0422  NADH dehydrogenase subunit H  52.85 
 
 
369 aa  348  1e-94  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  hitchhiker  0.00267889  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0715  NADH dehydrogenase (quinone)  59.77 
 
 
354 aa  348  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.567288  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2416  NADH dehydrogenase subunit H  55.23 
 
 
347 aa  347  2e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.792289  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1029  NADH dehydrogenase subunit H  55.96 
 
 
347 aa  347  2e-94  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.182867  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0804  NADH dehydrogenase subunit H  54.9 
 
 
347 aa  345  7e-94  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0897  NADH dehydrogenase subunit H  53.72 
 
 
347 aa  343  2e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.135331  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0809  NADH dehydrogenase subunit H  54.9 
 
 
347 aa  344  2e-93  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.519776  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0785  NADH dehydrogenase subunit H  55.48 
 
 
348 aa  343  2e-93  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.181346  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3335  NADH dehydrogenase (quinone)  54.79 
 
 
341 aa  342  7e-93  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.214759  normal  0.324573 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0928  NADH dehydrogenase (quinone)  55.45 
 
 
338 aa  342  8e-93  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.546214  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0617  NADH dehydrogenase subunit H  51.51 
 
 
367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  decreased coverage  0.00942155  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1721  NADH dehydrogenase subunit H  53.07 
 
 
347 aa  339  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1360  NADH dehydrogenase subunit H  53.4 
 
 
347 aa  338  5.9999999999999996e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0549439  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1268  NADH dehydrogenase subunit H  53.07 
 
 
347 aa  337  1.9999999999999998e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.279404  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0159  NADH dehydrogenase subunit H  49.7 
 
 
341 aa  336  3.9999999999999995e-91  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3219  NADH dehydrogenase subunit H  52.61 
 
 
337 aa  333  3e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2581  NADH dehydrogenase subunit H  47.76 
 
 
341 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.393278  normal  0.135958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4554  NADH dehydrogenase subunit H  49.56 
 
 
356 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.212256 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1880  NADH dehydrogenase subunit H  48.73 
 
 
356 aa  323  2e-87  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.517536  normal  0.265736 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0054  NADH dehydrogenase I, H subunit  49.25 
 
 
336 aa  323  3e-87  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2213  NADH dehydrogenase subunit H  50.32 
 
 
356 aa  322  9.000000000000001e-87  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0909649  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1207  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2391  NADH dehydrogenase subunit H  51.79 
 
 
342 aa  320  1.9999999999999998e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.0000491536  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1078  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.425523 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1012  NADH dehydrogenase subunit H  49.69 
 
 
340 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.850491 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2878  NADH dehydrogenase subunit H  49.35 
 
 
341 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.67433  normal  0.171106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2925  NADH dehydrogenase subunit H  52.51 
 
 
342 aa  320  3e-86  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2052  NADH dehydrogenase subunit H  48 
 
 
340 aa  318  1e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3291  NADH dehydrogenase subunit H  50.16 
 
 
341 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.347185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4133  NADH dehydrogenase subunit H  49.2 
 
 
340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196856  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2411  NADH dehydrogenase subunit H  50.33 
 
 
341 aa  311  7.999999999999999e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.21924  hitchhiker  0.00524741 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4397  NADH dehydrogenase subunit H  50.16 
 
 
340 aa  311  9e-84  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1302  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.48 
 
 
347 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0656687  normal  0.344257 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4626  NADH dehydrogenase subunit H  48.7 
 
 
339 aa  305  8.000000000000001e-82  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0842951 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2293  respiratory-chain NADH dehydrogenase, subunit 1  50.8 
 
 
347 aa  302  5.000000000000001e-81  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2992  NADH dehydrogenase (quinone)  50.77 
 
 
348 aa  300  2e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.857355 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3919  respiratory-chain NADH dehydrogenase subunit 1  45.76 
 
 
349 aa  300  3e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1281  NADH dehydrogenase (quinone)  46.18 
 
 
447 aa  299  6e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.522555 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4003  NADH dehydrogenase (quinone)  45.15 
 
 
349 aa  298  8e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.90654e-20 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1537  NADH dehydrogenase (quinone)  47.53 
 
 
341 aa  294  1e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03230  NADH dehydrogenase subunit H  46.39 
 
 
441 aa  291  1e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.332103  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>