295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1141 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1141  putative transferase  100 
 
 		 266 aa  541  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0928367 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0717  peptidase C26  56.7 
 
 		 479 aa  297  1e-79  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.777258  normal  0.355316 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3033  peptidase C26  57.31 
 
 		 493 aa  297  1e-79  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.998523  decreased coverage  0.0021965 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1617  glutamine amidotransferase, class I  56.32 
 
 		 444 aa  296  2e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2970  peptidase C26  55.34 
 
 		 442 aa  295  6e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.397336  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0973  glutamine amidotransferase, class I  55.34 
 
 		 444 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3017  glutamine amidotransferase, class I  55.34 
 
 		 442 aa  295  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2602  peptidase C26  55.34 
 
 		 444 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.160668  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0173  peptidase C26  55.34 
 
 		 444 aa  295  7e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2910  peptidase C26  55.34 
 
 		 442 aa  295  8e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.486072  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0455  glutamine amidotransferase, class I  55.13 
 
 		 356 aa  293  1e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0888  peptidase C26  56.15 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2371  peptidase C26  55.94 
 
 		 405 aa  291  6e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.167921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0900  peptidase C26  56.15 
 
 		 399 aa  291  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.332784  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0983  peptidase C26  55.94 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290196  normal  0.093467 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0545  peptidase C26  55.94 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.839837  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1024  peptidase C26  55.94 
 
 		 396 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0954  putative amidotransferase  56.64 
 
 		 251 aa  289  3e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.716357 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4137  peptidase C26  55.86 
 
 		 251 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2112  glutamine amidotransferase class-I:peptidase C26  55.77 
 
 		 260 aa  278  6e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0486861  normal  0.283308 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1549  peptidase C26  53.79 
 
 		 258 aa  266  2e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3226  peptidase C26  51.34 
 
 		 285 aa  254  1.0000000000000001e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3960  peptidase C26  50.94 
 
 		 313 aa  252  4.0000000000000004e-66  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0591478 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4701  peptidase C26  50 
 
 		 272 aa  250  2e-65  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3313  peptidase C26  51.32 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3963  peptidase C26  51.32 
 
 		 305 aa  242  5e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0830128  normal  0.322468 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0917  peptidase C26  49.07 
 
 		 293 aa  236  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.119037  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5208  peptidase C26  48.31 
 
 		 295 aa  234  8e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4597  peptidase C26  49.44 
 
 		 307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0108  peptidase C26  49.06 
 
 		 258 aa  228  1e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0730  peptidase C26  31.33 
 
 		 238 aa  141  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0444  glutamine amidotransferase class I  35.68 
 
 		 241 aa  139  3.9999999999999997e-32  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000517  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2164  peptidase C26  39.11 
 
 		 233 aa  137  1e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000115799  hitchhiker  0.0000699279 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2428  peptidase C26  40.65 
 
 		 248 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0394761 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3050  peptidase C26  44.32 
 
 		 250 aa  132  7.999999999999999e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0053  peptidase C26  39.69 
 
 		 256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4207  peptidase C26  44.97 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.914824 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1945  glutamine amidotransferase, class I  38.93 
 
 		 313 aa  130  3e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0746135  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0943  putative glutamine amidotransferase  34.89 
 
 		 264 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.889039 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2523  peptidase C26  41.28 
 
 		 252 aa  129  5.0000000000000004e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.186536 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1017  putative glutamine amidotransferase  42.37 
 
 		 238 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0361  peptidase C26  43.93 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21880  peptidase C26  40.12 
 
 		 231 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1072  peptidase C26  35.42 
 
 		 259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2987  peptidase C26  40 
 
 		 274 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0319  peptidase C26  40.82 
 
 		 233 aa  126  4.0000000000000003e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4667  peptidase C26  34.8 
 
 		 264 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2528  glutamine amidotransferase, class I  41.26 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2155  peptidase C26  41.26 
 
 		 250 aa  125  7e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000159832 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0438  peptidase C26  43.79 
 
 		 255 aa  125  1e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4215  peptidase C26  39.55 
 
 		 253 aa  123  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2023  glutamine amidotransferase, class I  39.75 
 
 		 266 aa  122  4e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1822  peptidase C26  39.89 
 
 		 245 aa  123  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0803389 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0799  peptidase C26  43.71 
 
 		 235 aa  123  4e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0637  glutamine amidotransferase  39.75 
 
 		 266 aa  122  5e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1878  hypothetical protein  33.49 
 
 		 230 aa  122  9e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2021  peptidase C26  36.11 
 
 		 250 aa  120  3e-26  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3248  peptidase C26  42.51 
 
 		 251 aa  120  3e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1031  glutamine amidotransferase  38.29 
 
 		 245 aa  120  3e-26  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000341197  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2162  peptidase C26  32.46 
 
 		 238 aa  119  4.9999999999999996e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0729  glutamine amidotransferase  38.93 
 
 		 266 aa  119  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30779  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1789  glutamine amidotransferase  35 
 
 		 241 aa  118  7.999999999999999e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000030649  hitchhiker  5.3956e-25 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1477  peptidase C26  39.3 
 
 		 237 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2182  peptidase C26  37.92 
 
 		 279 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.418745  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0063  peptidase C26  35.35 
 
 		 242 aa  118  9.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.542911  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1349  peptidase C26  40.12 
 
 		 240 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000385212  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2379  peptidase C26  38.5 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.732768  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5913  peptidase C26  37.92 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2164  peptidase C26  37.92 
 
 		 279 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2993  peptidase C26  38.5 
 
 		 261 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3356  peptidase C26  28.44 
 
 		 238 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.95955  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0075  peptidase C26  36.59 
 
 		 244 aa  117  1.9999999999999998e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.70164  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0570  peptidase C26  36.11 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0083889  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3012  peptidase C26  38.5 
 
 		 261 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.90022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3571  peptidase C26  36.36 
 
 		 247 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6342  peptidase C26  37.61 
 
 		 262 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0954  peptidase C26  34.33 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.000028221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0143  peptidase C26  37.65 
 
 		 238 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5474  peptidase C26  37.5 
 
 		 268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1775  glutamine amidotransferase  35.96 
 
 		 227 aa  116  3.9999999999999997e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000113696 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3947  peptidase C26  38.36 
 
 		 261 aa  115  7.999999999999999e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0505393  normal  0.911745 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0616  peptidase C26  37.93 
 
 		 245 aa  115  7.999999999999999e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.206585  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2718  peptidase C26  39.02 
 
 		 242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0577548  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0794  hypothetical protein  36.21 
 
 		 267 aa  113  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2902  peptidase C26  39.11 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2202  peptidase C26  38.67 
 
 		 268 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2893  peptidase C26  32.99 
 
 		 233 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.220365  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0349  peptidase C26  37 
 
 		 273 aa  110  2.0000000000000002e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.232683  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2671  peptidase C26  33.33 
 
 		 229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0625878 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2009  peptidase C26  40 
 
 		 245 aa  110  3e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2184  peptidase C26  36.23 
 
 		 275 aa  110  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.297323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2080  peptidase C26  38.67 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.285654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3742  peptidase C26  37.35 
 
 		 237 aa  109  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00011892  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1852  peptidase C26  34.72 
 
 		 238 aa  109  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.197074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3195  peptidase C26  41.97 
 
 		 241 aa  108  6e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0076  peptidase C26  39.79 
 
 		 236 aa  108  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.0652283 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2887  peptidase C26  34.09 
 
 		 268 aa  108  8.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2261  peptidase C26  34.97 
 
 		 312 aa  108  9.000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1106  peptidase C26  37.28 
 
 		 268 aa  107  1e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.442866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2058  peptidase C26  33.76 
 
 		 251 aa  107  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>