More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1097 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1097  putative binding-dependent transport protein (periplasmic)  100 
 
 		 528 aa  1080    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1303  extracellular solute-binding protein  46.39 
 
 		 544 aa  479  1e-134  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.949785 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1091  extracellular solute-binding protein family 5  44.78 
 
 		 528 aa  481  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.264739  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0663  extracellular solute-binding protein family 5  46 
 
 		 526 aa  476  1e-133  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.373149  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2113  extracellular solute-binding protein  45.27 
 
 		 527 aa  474  1e-132  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.142361  normal  0.0512396 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0685  extracellular solute-binding protein  45.36 
 
 		 526 aa  474  1e-132  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429103 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4792  extracellular solute-binding protein  44.16 
 
 		 528 aa  462  1e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3541  extracellular solute-binding protein family 5  44.1 
 
 		 528 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0936  extracellular solute-binding protein  44.49 
 
 		 526 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4139  extracellular solute-binding protein  44.29 
 
 		 528 aa  461  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.414652 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1300  extracellular solute-binding protein  45.78 
 
 		 526 aa  457  1e-127  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.901266 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0255  extracellular solute-binding protein  45.58 
 
 		 531 aa  441  9.999999999999999e-123  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.146115  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4474  extracellular solute-binding protein  44.38 
 
 		 538 aa  434  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.225694 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3551  extracellular solute-binding protein family 5  43.2 
 
 		 531 aa  411  1e-113  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.186732  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2857  putative oligopeptide ABC transporter (substrate-binding protein)  41.35 
 
 		 532 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.207734 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0666  extracellular solute-binding protein family 5  43.42 
 
 		 523 aa  392  1e-107  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.404568  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1815  extracellular solute-binding protein  41.99 
 
 		 532 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0688  extracellular solute-binding protein  43.22 
 
 		 523 aa  390  1e-107  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.110035  normal  0.066295 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0422  extracellular solute-binding protein  42.23 
 
 		 527 aa  386  1e-106  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.147362  normal  0.173861 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0872  extracellular solute-binding protein family 5  40.04 
 
 		 527 aa  382  1e-104  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.625735 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2819  extracellular solute-binding protein  36.6 
 
 		 529 aa  365  2e-99  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  decreased coverage  0.000112764  normal  0.172306 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3144  extracellular solute-binding protein  38.51 
 
 		 526 aa  364  2e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.000116165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0423  extracellular solute-binding protein  40.27 
 
 		 527 aa  361  2e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.204725  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1240  extracellular solute-binding protein  38.74 
 
 		 530 aa  357  3.9999999999999996e-97  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7194  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  39.41 
 
 		 528 aa  353  2.9999999999999997e-96  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.169026  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4426  extracellular solute-binding protein  39.47 
 
 		 556 aa  350  4e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.169116  normal  0.480332 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3143  extracellular solute-binding protein  37.71 
 
 		 524 aa  343  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0573017  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5794  extracellular solute-binding protein  35.73 
 
 		 520 aa  326  6e-88  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  decreased coverage  0.000436692  decreased coverage  0.000177852 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0877  4-phytase  38.68 
 
 		 460 aa  322  7e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.612179 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2822  extracellular solute-binding protein  35.26 
 
 		 517 aa  314  2.9999999999999996e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.687608  normal  0.0566169 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5796  extracellular solute-binding protein  37.67 
 
 		 526 aa  310  4e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00815808  hitchhiker  0.00391201 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0044  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  35.71 
 
 		 530 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2564  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  32.43 
 
 		 542 aa  265  1e-69  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0172077  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1792  extracellular solute-binding protein family 5  32.94 
 
 		 514 aa  265  2e-69  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0136295  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0095  transport protein, extracellular solute-binding protein  32.68 
 
 		 517 aa  262  1e-68  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0865281  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0275  oligopeptide/dipeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide/dipeptide-binding protein  31.94 
 
 		 595 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1361  extracellular solute-binding protein family 5  31.1 
 
 		 516 aa  259  1e-67  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.000000000166548  normal  0.279813 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001974  peptide ABC transporter peptide-binding protein  31.64 
 
 		 517 aa  256  8e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3706  extracellular solute-binding protein family 5  34.1 
 
 		 533 aa  256  9e-67  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00493  ABC-type dipeptide transporter periplasmic component  32.03 
 
 		 519 aa  256  1.0000000000000001e-66  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1686  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.898408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1873  extracellular solute-binding protein  30.75 
 
 		 526 aa  255  1.0000000000000001e-66  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.021803  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3383  extracellular solute-binding protein family 5  33.58 
 
 		 533 aa  255  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2532  extracellular solute-binding protein  31.77 
 
 		 535 aa  254  4.0000000000000004e-66  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00384928 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0562  oligopeptide ABC transporter extracellular solute-binding family 5 protein  29.5 
 
 		 518 aa  250  4e-65  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3006  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 528 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.165169  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2335  extracellular solute-binding protein  32.05 
 
 		 531 aa  246  6e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913035  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1829  extracellular solute-binding protein family 5  31.39 
 
 		 520 aa  245  9.999999999999999e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2799  extracellular solute-binding protein  31 
 
 		 520 aa  244  1.9999999999999999e-63  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.741108 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2870  periplasmic dipeptide transport protein  30.68 
 
 		 509 aa  237  4e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00619899  normal  0.837363 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2496  extracellular solute-binding protein  31.13 
 
 		 538 aa  237  4e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0292957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3158  extracellular solute-binding protein  30.21 
 
 		 535 aa  234  2.0000000000000002e-60  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1764  extracellular solute-binding protein family 5  31.65 
 
 		 526 aa  234  3e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.295464 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1440  extracellular solute-binding protein family 5  31.79 
 
 		 514 aa  233  8.000000000000001e-60  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136539  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1886  periplasmic dipeptide transport protein precursor  31.59 
 
 		 525 aa  231  2e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.105927  normal  0.91526 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2619  extracellular solute-binding protein family 5  31.06 
 
 		 512 aa  230  4e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.181451  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2006  transport binding transmembrane protein  31.36 
 
 		 528 aa  230  5e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0304834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1240  extracellular solute-binding protein  31.2 
 
 		 544 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.602045  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2087  extracellular solute-binding protein family 5  31.46 
 
 		 522 aa  228  2e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.159106  normal  0.621098 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4690  extracellular solute-binding protein family 5  32.05 
 
 		 524 aa  226  6e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2161  extracellular solute-binding protein family 5  30.59 
 
 		 532 aa  226  6e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.283164 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1837  extracellular solute-binding protein family 5  30.53 
 
 		 532 aa  225  2e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.350378  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6297  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 		 537 aa  223  9e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.346111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0449  extracellular solute-binding protein  29.48 
 
 		 520 aa  222  9.999999999999999e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2474  extracellular solute-binding protein  30.15 
 
 		 525 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2542  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 		 521 aa  220  6e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0150221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0817  extracellular solute-binding protein  30.28 
 
 		 549 aa  219  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.22663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0015  extracellular solute-binding protein family 5  28 
 
 		 516 aa  218  2e-55  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2814  peptide ABC transporter, periplasmic peptide-binding protein  31.14 
 
 		 521 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.1277  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0015  extracellular solute-binding protein family 5  27.81 
 
 		 516 aa  212  1e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.406265  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3881  extracellular solute-binding protein  30.65 
 
 		 515 aa  207  3e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.441306  normal  0.0413131 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5416  extracellular solute-binding protein  30.9 
 
 		 534 aa  200  3.9999999999999996e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.604179 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5037  extracellular solute-binding protein  30.84 
 
 		 534 aa  197  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4089  normal  0.963466 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1352  extracellular solute-binding protein family 5  28.28 
 
 		 534 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2408  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 505 aa  179  9e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  decreased coverage  0.000286915  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0479  4-phytase  26.48 
 
 		 535 aa  169  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0187568  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0252  extracellular solute-binding protein family 5  27.52 
 
 		 546 aa  162  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3713  putative ABC transporter (substrate binding component)  32.45 
 
 		 516 aa  162  2e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0184  extracellular solute-binding protein family 5  27.53 
 
 		 518 aa  161  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5070  extracellular solute-binding protein  27.84 
 
 		 495 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.27843  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3737  extracellular solute-binding protein  26.32 
 
 		 517 aa  156  7e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4390  solute-binding family 5 protein  27.35 
 
 		 521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4231  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.35 
 
 		 521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4243  solute-binding family 5 protein  27.35 
 
 		 521 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4729  solute-binding family 5 protein  27.35 
 
 		 521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4608  extracellular solute-binding protein  27.35 
 
 		 521 aa  154  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1445  extracellular solute-binding protein family 5  27.46 
 
 		 495 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777078 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1189  extracellular solute-binding protein family 5  27.24 
 
 		 497 aa  147  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4225  extracellular solute-binding protein  28.22 
 
 		 520 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1803  extracellular solute-binding protein family 5  27.1 
 
 		 499 aa  147  6e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.0045678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5265  ABC transporter, periplasmic solute-binding protein  27.78 
 
 		 515 aa  146  9e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.154423  normal  0.0706788 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  27.78 
 
 		 532 aa  143  7e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4052  extracellular solute-binding protein  28.24 
 
 		 520 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.544759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2405  extracellular solute-binding protein family 5  26.34 
 
 		 532 aa  141  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000184044  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5067  extracellular solute-binding protein  27.71 
 
 		 495 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.68424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2375  twin-arginine translocation pathway signal  28.6 
 
 		 514 aa  141  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3571  extracellular solute-binding protein  28.03 
 
 		 520 aa  140  6e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.57508  normal  0.258108 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1867  dipeptide/oligopeptide/nickel ABC periplasmic ligand-binding protein  28.92 
 
 		 520 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.30378  normal  0.527518 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4203  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.237738  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4163  extracellular solute-binding protein  28.26 
 
 		 520 aa  139  1e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0633493  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>