124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1080 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A1080  putative nuclease  100 
 
 		 168 aa  332  1e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1306  nuclease (SNase-like)  46.71 
 
 		 175 aa  127  6e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0873  nuclease (SNase-like)  50 
 
 		 178 aa  127  1.0000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.591352 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1682  nuclease (SNase-like)  42.75 
 
 		 153 aa  87  1e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0199869  normal  0.0644244 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1061  thermonuclease family protein  29.27 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.374796  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0998  thermonuclease family protein  28.4 
 
 		 175 aa  83.2  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.580638  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0051  ATP-dependent hsl protease ATP-binding subunit HslU  34.68 
 
 		 148 aa  82.8  0.000000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.176892  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2932  nuclease  33.33 
 
 		 244 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000967854  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1637  nuclease (SNase domain protein)  29.7 
 
 		 192 aa  83.2  0.000000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000037358  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0811  thermonuclease family protein  27.78 
 
 		 175 aa  82.4  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.392245  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0563  thermonuclease family protein (Snase-like)  30.37 
 
 		 174 aa  81.3  0.000000000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3053  SNase-like nuclease  33.12 
 
 		 180 aa  77.4  0.00000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  1.1276200000000001e-18  normal  0.298628 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3744  nuclease  34.42 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000150292  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3663  nuclease  30.97 
 
 		 187 aa  75.5  0.0000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000641477  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2395  nuclease (SNase domain protein)  32.95 
 
 		 179 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.82521e-33 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0779  nuclease (SNase domain protein)  31.85 
 
 		 169 aa  73.9  0.0000000000009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2575  nuclease  31.55 
 
 		 232 aa  73.6  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  unclonable  0.0000000542657  unclonable  0.0000125169 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0021  nuclease domain-containing protein  34.34 
 
 		 175 aa  73.6  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0439144  hitchhiker  0.0000334812 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2407  nuclease (SNase domain protein)  35.95 
 
 		 158 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000492982 
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0011  protein ParB  34.23 
 
 		 166 aa  73.9  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_51840  nuclease  34.97 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010657  SbBS512_0052  protein ParB  31.29 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0810303  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0371  nuclease (SNase domain protein)  34.55 
 
 		 171 aa  71.2  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.079056  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1572  hypothetical protein  27.78 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0428303  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2003  nuclease (SNase-like)  35.37 
 
 		 227 aa  70.9  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0376173  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2942  prophage MuMc02, nuclease, putative  33.95 
 
 		 216 aa  70.1  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.375298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2377  SNase-like nuclease  39.31 
 
 		 185 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0106322  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1380  nuclease (SNase domain protein)  32.09 
 
 		 238 aa  70.5  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0309494  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2029  nuclease (SNase-like)  42.86 
 
 		 161 aa  70.1  0.00000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1147  nuclease (SNase-like)  29.34 
 
 		 206 aa  68.9  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0321179  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0845  nuclease (SNase domain protein)  28.06 
 
 		 153 aa  68.2  0.00000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311247  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3662  nuclease (SNase domain protein)  33.33 
 
 		 175 aa  67.8  0.00000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.808999  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47870  SNase-like protein  35.94 
 
 		 225 aa  66.6  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1593  nuclease-like protein  34.48 
 
 		 196 aa  66.2  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0068  nuclease  33.56 
 
 		 169 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0693  thermonuclease family protein  29.17 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.739462  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2340  nuclease (SNase domain protein)  35 
 
 		 162 aa  65.1  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41180  nuclease  27.54 
 
 		 138 aa  64.7  0.0000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.804446  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2501  nuclease  37.41 
 
 		 205 aa  65.1  0.0000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.080015  normal  0.0413796 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2364  nuclease (SNase domain protein)  37.5 
 
 		 171 aa  63.5  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000986149  hitchhiker  0.0000256205 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1359  nuclease (SNase domain protein)  36.69 
 
 		 191 aa  63.5  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.104697  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0084  nuclease homolog  34.04 
 
 		 153 aa  62.8  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.381949  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1900  nuclease (SNase-like)  32.56 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.898699  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0966  nuclease  27.22 
 
 		 185 aa  62.4  0.000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797979  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3683  nuclease  31.9 
 
 		 153 aa  62  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29232  predicted protein  25.53 
 
 		 235 aa  62.4  0.000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.39353 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0193  nuclease  28.48 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0952  nuclease (SNase-like)  31.88 
 
 		 157 aa  61.2  0.000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1199  nuclease, putative  33.79 
 
 		 187 aa  60.8  0.000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.000552466  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0006  nuclease homolog  33.33 
 
 		 153 aa  60.5  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00328656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2526  SNase-like nuclease  32.14 
 
 		 171 aa  57.8  0.00000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0971838  normal  0.0202736 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2800  nuclease  39.44 
 
 		 194 aa  57.4  0.00000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0144279 
 
 
-
 
NC_013224  Dret_2515  nuclease (SNase domain protein)  30.3 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.893874 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1039  nuclease (SNase domain protein)  27.74 
 
 		 161 aa  57.4  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1456  nuclease (SNase domain protein)  27.41 
 
 		 184 aa  57  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1627  nuclease (SNase domain protein)  30.3 
 
 		 221 aa  56.6  0.0000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.839518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1464  micrococcal nuclease  32.58 
 
 		 150 aa  55.8  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.895174  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_08950  nuclease  38.46 
 
 		 208 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.870151  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3244  nuclease (SNase domain protein)  31.78 
 
 		 163 aa  54.7  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.731503 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25810  nuclease  33.33 
 
 		 169 aa  53.9  0.0000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.823432  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0143  putative nuclease  31.82 
 
 		 193 aa  53.5  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  unclonable  0.000000000478675  hitchhiker  0.000499621 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5017  nuclease  32.62 
 
 		 167 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.177044 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19010  nuclease  28.12 
 
 		 167 aa  53.1  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.461402  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0111  nuclease  32.62 
 
 		 227 aa  52  0.000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1190  nuclease  29.59 
 
 		 166 aa  52  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0870678  normal  0.0174729 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0317  nuclease (SNase domain protein)  32.62 
 
 		 227 aa  52  0.000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.183306  normal  0.136686 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2309  nuclease  32.86 
 
 		 214 aa  51.6  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1599  nuclease  32.84 
 
 		 195 aa  51.6  0.000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.798842  normal  0.295978 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0658  nuclease (SNase domain protein)  28.78 
 
 		 171 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688137  normal  0.0991066 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1969  nuclease (SNase-like)  32.65 
 
 		 172 aa  51.2  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6820  nuclease (SNase domain protein)  30.88 
 
 		 226 aa  50.1  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.398913 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2357  nuclease  28.65 
 
 		 221 aa  50.4  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2245  nuclease (SNase domain protein)  26.16 
 
 		 183 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.184004  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1570  nuclease family protein  25.47 
 
 		 115 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.30531  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2046  nuclease (SNase-like)  30.14 
 
 		 233 aa  48.5  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.879712  normal  0.484882 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0065  nuclease  31.82 
 
 		 227 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0594  Excalibur domain-containing protein  32 
 
 		 211 aa  48.5  0.00005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.535797  normal  0.187659 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0891  thermonuclease precursor family protein  26.28 
 
 		 178 aa  48.1  0.00006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000025104  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0516  nuclease  24.05 
 
 		 189 aa  47.8  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.439646  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0870  nuclease domain-containing protein  32.33 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0805  nuclease (SNase-like)  30.72 
 
 		 165 aa  47.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0862  nuclease domain-containing protein  32.33 
 
 		 189 aa  47.4  0.0001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2576  nuclease (SNase domain protein)  30.08 
 
 		 358 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.901293  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00242  transcription factor (Snd1/p100), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G09250)  32.73 
 
 		 882 aa  46.2  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.15453  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02570  mitochondrion protein, putative  26.04 
 
 		 282 aa  46.2  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.514055  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3090  nuclease (SNase-like)  36.84 
 
 		 201 aa  46.2  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906098  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03631  hypothetical protein  30 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0857  nuclease  31.43 
 
 		 214 aa  46.2  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1591  nuclease (SNase-like)  30.67 
 
 		 158 aa  45.4  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0848  nuclease-like protein  26.36 
 
 		 184 aa  45.1  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0898613  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0794  nuclease  32.22 
 
 		 327 aa  45.1  0.0004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0454  nuclease (SNase domain protein)  29.1 
 
 		 192 aa  45.4  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4558  nuclease (SNase domain protein)  28.45 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2144  nuclease (SNase-like)  33.1 
 
 		 162 aa  44.7  0.0006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.149778  normal  0.293408 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2736  Micrococcal nuclease  28.91 
 
 		 258 aa  44.7  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.000000195344  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2185  nuclease (SNase-like)  31.43 
 
 		 226 aa  44.7  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0156  nuclease (SNase-like)  25 
 
 		 228 aa  44.3  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0216151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1385  thermonuclease  28.7 
 
 		 190 aa  44.3  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000128794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1412  thermonuclease  28.7 
 
 		 190 aa  44.3  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000099778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2235  nuclease (SNase domain protein)  25.48 
 
 		 193 aa  44.3  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.197015 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>