More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1076 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_1826  TonB-dependent receptor  51.31 
 
 		 723 aa  662    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0185611 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1076  iron transporter  100 
 
 		 743 aa  1499    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.337763 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1125  TonB-dependent receptor  44.35 
 
 		 709 aa  499  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03467  TonB-dependent outer membrane Receptor  42.91 
 
 		 712 aa  500  1e-140  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3353  TonB-dependent receptor plug  43.09 
 
 		 736 aa  487  1e-136  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.130298  normal  0.417052 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2926  TonB-dependent receptor  41.12 
 
 		 715 aa  481  1e-134  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000198793  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1573  probable TonB-dependent receptor yncD  40.11 
 
 		 706 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000253157  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1702  putative TonB-dependent receptor yncD  39.89 
 
 		 706 aa  461  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.770108  normal  0.940102 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1766  TonB-dependent receptor yncD  39.89 
 
 		 706 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1754  TonB-dependent receptor YncD  40.11 
 
 		 721 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.460893  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2195  TonB-dependent receptor  39.89 
 
 		 700 aa  458  1e-127  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0192314  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1705  probable TonB-dependent receptor yncD  40.25 
 
 		 706 aa  458  1e-127  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.714131  normal  0.179613 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0022  TonB-dependent receptor  42.63 
 
 		 697 aa  458  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000255766 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1720  TonB-dependent receptor  39.89 
 
 		 700 aa  456  1e-127  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000201404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1426  TonB-dependent receptor  39.3 
 
 		 720 aa  456  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.51849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1632  TonB-dependent receptor  40.03 
 
 		 700 aa  459  1e-127  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01408  predicted iron outer membrane transporter  40.05 
 
 		 700 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01419  hypothetical protein  40.05 
 
 		 700 aa  454  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1538  TonB-dependent receptor  40.05 
 
 		 700 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2057  TonB-dependent receptor  39.76 
 
 		 700 aa  453  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.980298  hitchhiker  0.0003174 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1723  TonB-dependent receptor  39.76 
 
 		 700 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2208  TonB-dependent receptor  40.05 
 
 		 700 aa  455  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.346262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2099  TonB-dependent siderophore receptor  40.37 
 
 		 728 aa  452  1e-125  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0104822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1044  TonB-dependent receptor:TonB box, N-terminal  40.32 
 
 		 726 aa  449  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2869  TonB-dependent receptor  41.83 
 
 		 742 aa  448  1.0000000000000001e-124  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0872507  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2570  TonB-dependent receptor  39.42 
 
 		 694 aa  424  1e-117  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00469469  hitchhiker  0.000000281684 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2952  putative lipoprotein  39.06 
 
 		 710 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.130559  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34990  putative TonB-dependent receptor  38.72 
 
 		 706 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.275223  normal  0.836539 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4866  TonB-dependent receptor  38.83 
 
 		 731 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3519  TonB-dependent siderophore receptor  37.93 
 
 		 681 aa  413  1e-114  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.302801  normal  0.288365 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3005  TonB-dependent receptor  37.21 
 
 		 705 aa  405  1e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2301  TonB-dependent receptor  34.8 
 
 		 706 aa  382  1e-104  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2598  TonB-dependent receptor  39.24 
 
 		 723 aa  379  1e-103  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  hitchhiker  0.00053771  normal  0.180731 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0241  TonB-dependent receptor  31.79 
 
 		 675 aa  287  4e-76  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.571494  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2795  TonB-dependent receptor  30.12 
 
 		 701 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0094  TonB-dependent receptor  31.81 
 
 		 678 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0917922  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0021  TonB-dependent receptor  30.14 
 
 		 705 aa  262  2e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.225049 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2728  TonB-dependent receptor  29.04 
 
 		 688 aa  257  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.811385  normal  0.575129 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1061  TonB-dependent receptor, plug  31.2 
 
 		 691 aa  252  2e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2188  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 680 aa  194  4e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1025  TonB-dependent receptor  25.79 
 
 		 791 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1763  TonB-dependent receptor plug  24.73 
 
 		 703 aa  123  9.999999999999999e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0187171  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4534  putative TonB-dependent receptor protein  25.55 
 
 		 797 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.38874  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5774  TonB-dependent receptor plug  24.31 
 
 		 690 aa  121  4.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.872771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3112  TonB-dependent receptor  28.42 
 
 		 687 aa  118  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2953  TonB-dependent receptor  23.82 
 
 		 700 aa  117  6e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.191776  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2902  TonB-dependent receptor  25.15 
 
 		 791 aa  117  7.999999999999999e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.119413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2498  TonB-dependent receptor  24.71 
 
 		 770 aa  114  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.111731 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1372  TonB-dependent receptor plug  20.48 
 
 		 701 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000623394  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1868  TonB-dependent receptor  23.66 
 
 		 734 aa  111  6e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.155376  normal  0.191225 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3267  putative outer membrane receptor for iron transport  25.35 
 
 		 712 aa  107  8e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.598995  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2201  TonB-dependent receptor  23.93 
 
 		 736 aa  107  1e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.407628  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  25.29 
 
 		 722 aa  106  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1468  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 682 aa  103  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2019  TonB-dependent receptor  25.51 
 
 		 742 aa  102  4e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.850916  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  21.73 
 
 		 780 aa  100  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5609  putative TonB-dependent receptor protein  24.76 
 
 		 727 aa  98.2  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.232583  normal  0.195075 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21730  putative TonB-dependent receptor  25.19 
 
 		 721 aa  98.2  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1994  TonB-dependent receptor  23.41 
 
 		 698 aa  94.4  7e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3709  TonB-dependent receptor  22.7 
 
 		 681 aa  94  9e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0423  TonB-dependent receptor  20.3 
 
 		 696 aa  92.4  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2473  putative TonB-dependent siderophore receptor  23.56 
 
 		 788 aa  92.8  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.805537 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1853  TonB-dependent receptor  24.62 
 
 		 721 aa  90.9  9e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4030  TonB-dependent receptor:Lipocalin  24.68 
 
 		 713 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4674  TonB-dependent receptor  25.69 
 
 		 692 aa  89  3e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.396726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4462  TonB-dependent siderophore receptor  24.07 
 
 		 757 aa  87.8  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0705188 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3034  TonB-dependent receptor  23.57 
 
 		 741 aa  86.7  0.000000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0831829  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3552  TonB-dependent receptor  24.55 
 
 		 737 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0127436  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12568  probable TonB-dependent receptor YncD precursor  21.2 
 
 		 762 aa  86.7  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4090  TonB-dependent receptor  22.59 
 
 		 705 aa  85.9  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01120  TonB-dependent siderophore receptor  25.19 
 
 		 793 aa  84.7  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22830  TonB-dependent receptor  23.8 
 
 		 678 aa  84.3  0.000000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0688062  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6944  TonB-dependent receptor  21.43 
 
 		 757 aa  82.4  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1253  TonB-dependent receptor  23.39 
 
 		 778 aa  82.4  0.00000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.393341 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3728  TonB-dependent siderophore receptor  26.77 
 
 		 733 aa  81.6  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0317837  normal  0.454435 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5156  TonB-dependent receptor  23.67 
 
 		 777 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2433  TonB-dependent receptor  35.45 
 
 		 704 aa  81.6  0.00000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.1738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2993  TonB-dependent receptor  21.72 
 
 		 705 aa  81.3  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.162079  normal  0.156503 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2453  TonB-dependent siderophore receptor  23.94 
 
 		 720 aa  81.3  0.00000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.591762  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3243  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 777 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00716389  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01870  putative TonB-dependent receptor  23.92 
 
 		 795 aa  80.5  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.554245 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5125  TonB-dependent receptor  23.53 
 
 		 777 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.381355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09350  TonB-dependent siderophore receptor  23.19 
 
 		 704 aa  79.3  0.0000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4484  TonB-dependent receptor  23.83 
 
 		 726 aa  79.3  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.429644  normal  0.265878 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4565  TonB-dependent receptor  24.95 
 
 		 733 aa  79.7  0.0000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.372815  normal  0.147883 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 757 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  24.31 
 
 		 722 aa  79.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  23.42 
 
 		 709 aa  79.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5169  TonB-dependent siderophore receptor  23.91 
 
 		 723 aa  78.6  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2439  TonB-dependent siderophore receptor  24.62 
 
 		 860 aa  77.8  0.0000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000275089 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4246  TonB-dependent receptor  24.82 
 
 		 698 aa  77.8  0.0000000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286559  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3980  TonB-dependent siderophore receptor  24.46 
 
 		 719 aa  77  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.348977  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0909  putative TonB-dependent receptor  23.49 
 
 		 711 aa  77  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.622893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0229  putative TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 795 aa  76.6  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0571  TonB-dependent receptor  22.6 
 
 		 778 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010335  Caul_5256  TonB-dependent receptor  26.14 
 
 		 731 aa  76.6  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.650389  hitchhiker  0.000349677 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2924  TonB-dependent receptor  30.88 
 
 		 776 aa  76.6  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753718  normal  0.115907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4755  TonB-dependent siderophore receptor  23.03 
 
 		 797 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.251254  hitchhiker  0.00353592 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2625  TonB-dependent receptor  22.25 
 
 		 657 aa  75.9  0.000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.980205  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4311  TonB-dependent siderophore receptor  24.35 
 
 		 809 aa  75.5  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0939329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>