More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0983 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0983  transferase  100 
 
 		 200 aa  402  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1239  phenylacetic acid degradation protein PaaY  73.87 
 
 		 200 aa  305  2.0000000000000002e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.55157  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2406  phenylacetic acid degradation protein PaaY  72.86 
 
 		 208 aa  288  5.0000000000000004e-77  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.572897 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0385  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.04 
 
 		 203 aa  256  2e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00144851  normal  0.0147726 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1515  phenylacetic acid degradation protein PaaY  59.8 
 
 		 205 aa  252  3e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.443467  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3084  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.44 
 
 		 198 aa  249  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.264252 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2474  phenylacetic acid degradation protein PaaY  62.5 
 
 		 199 aa  242  3e-63  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29781  normal  0.884241 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3285  phenylacetic acid degradation protein PaaY  60.94 
 
 		 199 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.521801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2611  phenylacetic acid degradation protein PaaY  61.46 
 
 		 199 aa  238  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.178031  normal  0.0643205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2624  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.85 
 
 		 199 aa  238  4e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0766069 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3223  carnitine operon protein CaiE  59.14 
 
 		 196 aa  237  6.999999999999999e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.143313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3102  regulatory PhaM protein  58.29 
 
 		 195 aa  237  8e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0237996  decreased coverage  0.0000286211 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0039  carnitine operon protein CaiE  58.29 
 
 		 196 aa  235  3e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2998  phenylacetic acid degradation protein PaaY  63.1 
 
 		 202 aa  234  5.0000000000000005e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1586  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.6 
 
 		 196 aa  234  6e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00039  predicted acyl transferase  58.29 
 
 		 196 aa  234  7e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00038  hypothetical protein  58.29 
 
 		 196 aa  234  7e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0039  carnitine operon protein CaiE  58.29 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0076  carnitine operon protein CaiE  57.75 
 
 		 198 aa  233  1.0000000000000001e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0037  carnitine operon protein CaiE  58.29 
 
 		 196 aa  233  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0077  carnitine operon protein CaiE  57.75 
 
 		 198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.81711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0073  carnitine operon protein CaiE  57.75 
 
 		 198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0073  carnitine operon protein CaiE  57.75 
 
 		 198 aa  233  2.0000000000000002e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0036  carnitine operon protein CaiE  58.29 
 
 		 196 aa  233  2.0000000000000002e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.89509  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2245  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.06 
 
 		 196 aa  232  3e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.3221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3620  carnitine operon protein CaiE  57.75 
 
 		 196 aa  232  3e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.29388 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0075  carnitine operon protein CaiE  57.75 
 
 		 198 aa  232  3e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.903191 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0225  regulatory PhaM protein  55.08 
 
 		 199 aa  232  3e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.436924 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1487  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.06 
 
 		 196 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2255  phenylacetic acid degradation protein PaaY  58.06 
 
 		 196 aa  232  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.438675  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3564  transferase hexapeptide repeat containing protein  57.75 
 
 		 196 aa  231  6e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4032  carnitine operon protein CaiE  56.15 
 
 		 222 aa  223  1e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0662  hexapeptide repeat-containing acetyltransferase  50.82 
 
 		 196 aa  207  8e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3897  carbonic anhydrase  56.32 
 
 		 176 aa  191  7e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.731828  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05255  phenylacetic acid degradation protein  44.5 
 
 		 204 aa  189  2e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.524726  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4358  hexapaptide repeat-containing transferase  57.31 
 
 		 171 aa  188  4e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1467  carbonic anhydrase  55.17 
 
 		 175 aa  186  2e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0618569  normal  0.711294 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1555  phenyl acetic acid degradation protein  45.96 
 
 		 205 aa  185  4e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0917  hexapaptide repeat-containing transferase  46.75 
 
 		 175 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000456928  normal  0.0606057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3189  hexapaptide repeat-containing transferase  41.04 
 
 		 175 aa  137  7.999999999999999e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0880  isoleucine cluster protein  46.99 
 
 		 166 aa  135  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35750  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  39.88 
 
 		 172 aa  134  7.000000000000001e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.457573  normal  0.431311 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1750  carbonic anhydrase  44.13 
 
 		 183 aa  134  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.293502  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28200  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  44.97 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2268  hypothetical protein  42.2 
 
 		 174 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0861  transferase hexapeptide repeat protein  41.72 
 
 		 173 aa  128  5.0000000000000004e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2851  hypothetical protein  37.13 
 
 		 173 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2918  ferripyochelin binding protein  41.76 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1562  ferripyochelin binding protein  41.76 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.190855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0598  hexapaptide repeat-containing transferase  39.26 
 
 		 171 aa  125  4.0000000000000003e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.815519  hitchhiker  0.000000000000309138 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2729  transferase  49.38 
 
 		 179 aa  123  2e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1105  carbonic anhydrase  40.59 
 
 		 172 aa  123  2e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.519901  normal  0.0228348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0926  ferripyochelin-binding protein  42.19 
 
 		 234 aa  123  2e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.24931 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1069  hypothetical protein  36.94 
 
 		 173 aa  122  4e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1854  hypothetical protein  32.74 
 
 		 175 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0466742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2209  hypothetical protein  43.59 
 
 		 172 aa  119  3e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.804393  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2096  hypothetical protein  38.24 
 
 		 173 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3589  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  38.73 
 
 		 177 aa  118  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1541  hexapaptide repeat-containing transferase  40.83 
 
 		 189 aa  118  6e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.113499  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0660  transferase hexapeptide repeat containing protein  32.6 
 
 		 182 aa  118  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3324  hexapeptide transferase family protein  39.08 
 
 		 186 aa  118  7e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0020  hexapeptide transferase family protein  40.44 
 
 		 179 aa  117  9e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0945686  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1111  siderophore binding protein  38.92 
 
 		 173 aa  117  9e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.791842  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0980  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  39.74 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.535757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3545  hexapaptide repeat-containing transferase  40.57 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000167215  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3520  carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  37.57 
 
 		 177 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0123178  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6433  transferase hexapeptide repeat containing protein  37.85 
 
 		 174 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0175522 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1203  putative regulator  36.02 
 
 		 175 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00319738  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2773  hypothetical protein  31.64 
 
 		 172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000332346  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3452  hypothetical protein  36.42 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1178  hexapaptide repeat-containing transferase  36.57 
 
 		 174 aa  116  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.928764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1064  carbonic anhydrase  37.84 
 
 		 162 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1727  ferripyochelin binding protein-like  38.89 
 
 		 177 aa  116  3e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0198  carbonic anhydrase  39.39 
 
 		 177 aa  116  3e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000371733  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0287  putative siderophore-binding protein  42.26 
 
 		 188 aa  115  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2479  carbonic anhydrase family 3  36.31 
 
 		 180 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0993  transferase hexapeptide protein  35.26 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2015  hypothetical protein  39.31 
 
 		 174 aa  115  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.755225  normal  0.649207 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0478  anhydrase family 3 protein  35.37 
 
 		 170 aa  115  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000849084  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1187  siderophore binding protein  37.72 
 
 		 172 aa  114  6.9999999999999995e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000944308 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3431  putative acetyltransferase/acyltransferase  36.55 
 
 		 170 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1461  carbonic anhydrase  37.01 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000178452  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13558  siderophore-binding protein  40.46 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000353278 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18170  isoleucine patch superfamily enzyme, carbonic anhydrase/acetyltransferase  42.14 
 
 		 177 aa  114  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.814927 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0900  carbonic anhydrase  33.77 
 
 		 157 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0435  hexapaptide repeat-containing transferase  37.93 
 
 		 174 aa  114  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1046  carbonic anhydrase  36.42 
 
 		 154 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1929  hexapaptide repeat-containing transferase  38.18 
 
 		 182 aa  114  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0000963233  hitchhiker  0.00946276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0500  transferase hexapeptide protein  39.16 
 
 		 191 aa  114  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0453  hexapaptide repeat-containing transferase  38.2 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.155636  normal  0.104163 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0426  Carbonic anhydrase/acetyltransferase isoleucine patch superfamily-like protein  36 
 
 		 176 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0535  transferase hexapeptide repeat containing protein  36.42 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000389901  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1599  acetyltransferase/acyltransferase  35.03 
 
 		 173 aa  113  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1318  hexapaptide repeat-containing transferase  37.65 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5112  hexapaptide repeat-containing transferase  36.42 
 
 		 174 aa  113  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846878 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2740  hexapaptide repeat-containing transferase  36.47 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0979  hypothetical protein  42.04 
 
 		 183 aa  112  3e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00195064 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2439  transferase hexapeptide protein  39.53 
 
 		 172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0020264 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2121  carbonic anhydrase  37.5 
 
 		 175 aa  112  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.551825  normal  0.249053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2083  putative acetyltransferase  38.1 
 
 		 180 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.185371  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>