More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0947 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0947  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  100 
 
 		 337 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0929  cobalamin synthesis protein P47K  47.37 
 
 		 349 aa  323  3e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.363072  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0846  cobalamin synthesis protein, P47K  47.26 
 
 		 353 aa  319  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.136084 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4831  cobalamin synthesis protein, P47K  47.23 
 
 		 350 aa  317  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.293757  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  48.09 
 
 		 347 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.107913  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1304  cobalamin synthesis protein, P47K  47.29 
 
 		 320 aa  316  3e-85  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.405141  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3685  cobalamin synthesis protein P47K  50.76 
 
 		 335 aa  312  4.999999999999999e-84  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.444598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1342  putative cobalamin synthesis protein/P47K family protein  48.08 
 
 		 345 aa  312  6.999999999999999e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.245031 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2842  cobalamin synthesis protein, P47K  46.13 
 
 		 354 aa  311  7.999999999999999e-84  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0756  cobalamin synthesis protein, CobW  45.04 
 
 		 353 aa  311  1e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1731  cobalamin synthesis protein P47K  50.91 
 
 		 329 aa  311  1e-83  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.425021 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4562  cobalamin synthesis protein P47K  49.55 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00110113 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0917  cobalamin synthesis protein, CobW  45.69 
 
 		 350 aa  310  2e-83  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.191872  normal  0.446046 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4494  cobalamin synthesis protein P47K  49.4 
 
 		 320 aa  310  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0590812  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3021  cobalamin synthesis protein P47K  45.81 
 
 		 358 aa  309  4e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3468  cobalamin synthesis protein, P47K  44.51 
 
 		 355 aa  308  9e-83  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.246587  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1778  cobalamin synthesis protein P47K  50.3 
 
 		 328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.468449  normal  0.647209 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2114  cobalamin synthesis protein P47K  50.3 
 
 		 328 aa  306  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.56186 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2276  putative CobW protein involved in cobalamin synthesis  48.93 
 
 		 326 aa  306  3e-82  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0913619  normal  0.150937 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0929  low affinity zinc transport membrane protein  48.94 
 
 		 343 aa  305  7e-82  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.426813  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4710  cobalamin synthesis protein P47K  46.31 
 
 		 355 aa  304  1.0000000000000001e-81  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.149594 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3425  cobalamin synthesis protein, P47K  44.41 
 
 		 361 aa  305  1.0000000000000001e-81  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0953309  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3663  cobalamin synthesis protein P47K  45.63 
 
 		 363 aa  302  7.000000000000001e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.234992 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0196  cobalamin synthesis protein P47K  45.1 
 
 		 364 aa  296  3e-79  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.174465  normal  0.775043 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0611  cobalamin synthesis protein P47K  46.06 
 
 		 332 aa  292  7e-78  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.71741  normal  0.0611069 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3682  cobalamin synthesis protein P47K  44.66 
 
 		 367 aa  291  8e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.296986 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0987  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  43.16 
 
 		 374 aa  291  9e-78  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32175  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3384  cobalamin synthesis protein P47K  45.85 
 
 		 360 aa  291  9e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.162909  normal  0.200467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3189  cobalamin synthesis protein P47K  44.11 
 
 		 323 aa  291  1e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0646926 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3796  hypothetical protein  42.47 
 
 		 365 aa  288  8e-77  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.213041  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0888  cobalamin synthesis protein P47K  45.26 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.908618 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0862  cobalamin synthesis protein P47K  45.26 
 
 		 323 aa  284  1.0000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0285  cobalamin synthesis protein/P47K  44.41 
 
 		 323 aa  284  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.980872  normal  0.42321 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1909  cobalamin synthesis protein P47K  45.26 
 
 		 323 aa  279  5e-74  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3457  cobalamin synthesis protein P47K  47.72 
 
 		 322 aa  276  3e-73  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5187  cobalamin synthesis protein P47K  42.12 
 
 		 323 aa  272  7e-72  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.491695  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4708  cobalamin synthesis protein P47K  42.12 
 
 		 324 aa  256  3e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.455189  normal  0.404578 
 
 
-
 
NC_011699  PHATRDRAFT_41508  predicted protein  41.12 
 
 		 394 aa  256  6e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.328338  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6978  cobalamin synthesis protein P47K  42.25 
 
 		 324 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.227526  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1833  cobalamin synthesis protein  39.82 
 
 		 319 aa  249  6e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1883  cobalamin synthesis protein P47K  40.3 
 
 		 316 aa  248  7e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.327033  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1373  cobalamin synthesis protein P47K  59.9 
 
 		 393 aa  248  9e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1879  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.22 
 
 		 319 aa  247  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2023  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  40 
 
 		 316 aa  248  2e-64  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2056  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.39 
 
 		 316 aa  245  6e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2021  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.39 
 
 		 316 aa  245  6.999999999999999e-64  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.53794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1524  cobalamin synthesis protein P47K  38.92 
 
 		 319 aa  244  9.999999999999999e-64  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2101  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.39 
 
 		 316 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1849  cobalamin synthesis protein  39.39 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.443827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2134  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  39.39 
 
 		 316 aa  243  3e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3286  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  38.97 
 
 		 316 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2767  cobalamin synthesis protein P47K  57.5 
 
 		 369 aa  241  1e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.469353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3432  cobalamin synthesis protein/P47K  38.12 
 
 		 347 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.432548  normal  0.426246 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3607  cobalamin synthesis protein P47K  38.16 
 
 		 375 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.734261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29990  predicted protein  38.24 
 
 		 339 aa  233  5e-60  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.120572  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7138  cobalamin synthesis protein P47K  38.95 
 
 		 360 aa  232  7.000000000000001e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.775863  normal  0.480911 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40657  predicted protein  38.94 
 
 		 404 aa  230  3e-59  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15891  normal  0.0463328 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4002  cobalamin synthesis protein P47K  38.17 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.242709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2305  cobalamin synthesis protein, P47K  39.14 
 
 		 329 aa  223  3e-57  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.394905  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3078  cobalamin synthesis protein/P47K:cobalamin synthesis CobW, C-terminal  37.03 
 
 		 360 aa  220  1.9999999999999999e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.361866  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0634  cobalamin synthesis protein/P47K  37.5 
 
 		 369 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0291  cobalamin synthesis protein P47K  38.44 
 
 		 328 aa  219  7e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5092  cobalamin synthesis protein P47K  39.7 
 
 		 327 aa  218  2e-55  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.2571  normal  0.304684 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1724  cobalamin synthesis protein P47K  51.5 
 
 		 493 aa  212  7.999999999999999e-54  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.651527 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1037  G3E family GTPase  41.98 
 
 		 460 aa  211  2e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_11161  cobalamin synthesis protein/P47K  43.2 
 
 		 457 aa  210  3e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3439  cobalamin synthesis protein, P47K  36.1 
 
 		 351 aa  210  3e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.745732  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19071  cobalamin synthesis protein/P47K  42.31 
 
 		 460 aa  209  5e-53  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_15201  cobalamin synthesis protein/P47K  42.86 
 
 		 460 aa  206  3e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.527171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1044  cobalamin synthesis protein/P47K  46.34 
 
 		 449 aa  202  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.936945  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  45.37 
 
 		 449 aa  199  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11351  cobalamin synthesis protein/P47K  45.37 
 
 		 449 aa  199  5e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.593368  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11271  cobalamin synthesis protein/P47K  40.87 
 
 		 452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3429  cobalamin synthesis protein, P47K  34.2 
 
 		 350 aa  197  2.0000000000000003e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.85314  normal  0.828912 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3834  cobalamin synthesis protein P47K  35.5 
 
 		 343 aa  195  1e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.739189 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3386  hypothetical protein  35.26 
 
 		 347 aa  194  3e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.414408 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05471  G3E family GTPase  35.03 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.304233  normal  0.295768 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0904  cobalamin synthesis protein P47K  34.49 
 
 		 349 aa  193  5e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1063  cobalamin synthesis protein, P47K  34.18 
 
 		 352 aa  192  6e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.941707 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3846  cobalamin synthesis protein P47K  36.23 
 
 		 341 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1769  cobalamin synthesis protein P47K  36.23 
 
 		 313 aa  191  2e-47  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.48374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1456  cobalamin synthesis protein P47K  32.97 
 
 		 384 aa  190  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2421  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.67 
 
 		 355 aa  190  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.877489  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1823  hypothetical protein  35.12 
 
 		 344 aa  189  4e-47  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0970938  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41587  predicted protein  36.47 
 
 		 339 aa  190  4e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0182638  normal  0.0311879 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0807  cobalamin synthesis protein, P47K  33.24 
 
 		 359 aa  188  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.591841  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1690  hypothetical protein  35.34 
 
 		 349 aa  188  1e-46  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3380  cobalamin synthesis protein P47K  33.61 
 
 		 359 aa  188  1e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3508  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.67 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3150  cobalamin synthesis protein/P47K family protein  37.57 
 
 		 354 aa  187  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.43472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2774  cobalamin biosynthesis protein CobW  37.95 
 
 		 355 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0672  hypothetical protein  32.89 
 
 		 379 aa  185  1.0000000000000001e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.177765  normal  0.336631 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4556  cobalamin synthesis protein, P47K  34.46 
 
 		 356 aa  185  1.0000000000000001e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1570  hypothetical protein  32.53 
 
 		 372 aa  184  2.0000000000000003e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0281678 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2268  cobalamin biosynthesis protein CobW  36.99 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1732  cobalamin synthesis protein P47K  32.68 
 
 		 352 aa  182  5.0000000000000004e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2015  cobalamin synthesis protein, P47K  31.96 
 
 		 353 aa  182  6e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2392  cobalamin synthesis protein P47K  31.82 
 
 		 378 aa  182  7e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0198  cobalamin synthesis protein, P47K  35.24 
 
 		 322 aa  182  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.659431 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1081  cobalamin synthesis protein P47K  32.6 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.640909 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>