More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0860 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_0340  putative molybdopterin oxidoreductase family protein  66.8 
 
 
969 aa  1342    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2047  molybdopterin oxidoreductase family protein  68.68 
 
 
978 aa  1360    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0144  Nitrate reductase  56.34 
 
 
968 aa  1074    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.20864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0570  DMSO reductase chain A  54.53 
 
 
958 aa  1049    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.345051  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1445  molybdopterin oxidoreductase family protein  68.68 
 
 
978 aa  1361    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2001  molybdopterin oxidoreductase  69.17 
 
 
978 aa  1362    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.754637  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4940  molybdopterin oxidoreductase  70.18 
 
 
974 aa  1384    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.335021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1443  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 protein  49.37 
 
 
932 aa  895    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1743  molybdopterin oxidoreductase  69.66 
 
 
974 aa  1376    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.216268  normal  0.286341 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1238  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  48.94 
 
 
928 aa  878    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.389489  normal  0.0809066 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1675  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  53.42 
 
 
974 aa  1016    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3815  molybdopterin oxidoreductase  87.24 
 
 
981 aa  1786    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.336583  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1801  molybdopterin oxidoreductase  62.36 
 
 
961 aa  1241    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4524  molybdopterin oxidoreductase  69.49 
 
 
978 aa  1366    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.556057 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2646  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  51.54 
 
 
935 aa  924    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0950035  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1071  molybdopterin oxidoreductase family protein  68.57 
 
 
973 aa  1357    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3996  molybdopterin oxidoreductase  83.84 
 
 
979 aa  1734    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.290267  normal  0.0213209 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1936  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  53.75 
 
 
973 aa  1003    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0860  molybdopterin oxidoreductase family protein  100 
 
 
981 aa  2035    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1356  molybdopterin oxidoreductase family protein  68.68 
 
 
973 aa  1359    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0059  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  68.37 
 
 
953 aa  1344    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3221  molybdopterin oxidoreductase  68.72 
 
 
973 aa  1360    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.461579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3106  molybdopterin oxidoreductase  68.68 
 
 
973 aa  1361    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2338  molybdopterin oxidoreductase  68.68 
 
 
973 aa  1359    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.941239  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0767  molybdopterin oxidoreductase Fe4S4 region  48.22 
 
 
923 aa  832    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6214  molybdopterin oxidoreductase  69.29 
 
 
978 aa  1368    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492261  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0814  anaerobic dehydrogenase  26.65 
 
 
1434 aa  272  2.9999999999999997e-71  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0197792  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3094  molybdopterin oxidoreductase  25.78 
 
 
858 aa  207  8e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.799457  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2042  twin-arginine translocation pathway signal  25.32 
 
 
930 aa  191  5.999999999999999e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.607166  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1863  molybdopterin oxidoreductase  27 
 
 
932 aa  186  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0514904 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1560  molybdopterin oxidoreductase  25 
 
 
917 aa  186  3e-45  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.444202 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1335  molybdopterin oxidoreductase  26.48 
 
 
928 aa  184  8.000000000000001e-45  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374333  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2453  molybdopterin oxidoreductase  26.34 
 
 
909 aa  181  7e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.154365  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0216  molybdopterin oxidoreductase  26.13 
 
 
837 aa  179  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0938  molybdopterin oxidoreductase  27.47 
 
 
817 aa  178  5e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0255421  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2385  molybdopterin oxidoreductase  24.39 
 
 
839 aa  176  1.9999999999999998e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0793925 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4198  molybdopterin oxidoreductase  25.16 
 
 
1155 aa  175  2.9999999999999996e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.320615  normal  0.676689 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1121  molybdopterin oxidoreductase  27.37 
 
 
812 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.721348  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0619  molybdopterin oxidoreductase  23.68 
 
 
911 aa  172  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0607  molydopterin dinucleotide-binding region  25.26 
 
 
910 aa  172  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.408169 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0954  twin-arginine translocation pathway signal  25.08 
 
 
927 aa  171  6e-41  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.323124  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11280  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.88 
 
 
864 aa  169  2.9999999999999998e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0612  conserved hypothetical protein  33.72 
 
 
1426 aa  165  5.0000000000000005e-39  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02584  hypothetical protein  23.26 
 
 
992 aa  163  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1197  molybdopterin oxidoreductase  22.96 
 
 
934 aa  162  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1646  molybdopterin oxidoreductase  24.61 
 
 
807 aa  162  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.165657  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6878  molybdopterin oxidoreductase  23.13 
 
 
1148 aa  160  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0354139  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2304  molybdopterin oxidoreductase  26.76 
 
 
803 aa  159  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1500  molybdopterin oxidoreductase  27.26 
 
 
856 aa  157  8e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000790574 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3287  molybdopterin oxidoreductase  25.52 
 
 
781 aa  154  8e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.239512  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0353  molybdopterin oxidoreductase  27.47 
 
 
805 aa  154  1e-35  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.127927 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1078  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.26 
 
 
814 aa  154  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.965114 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.26 
 
 
814 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1029  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.26 
 
 
814 aa  152  2e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0163  molybdopterin oxidoreductase  23.17 
 
 
851 aa  153  2e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1063  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.26 
 
 
814 aa  152  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0105709  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1567  molybdopterin oxidoreductase  24.2 
 
 
803 aa  152  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0162  molybdopterin oxidoreductase  27.13 
 
 
805 aa  152  3e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0998  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.15 
 
 
814 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.181006  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1668  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.48 
 
 
811 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1841  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.4 
 
 
811 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1418  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.48 
 
 
814 aa  149  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1609  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.51 
 
 
811 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.356497  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1674  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.51 
 
 
811 aa  149  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.666152  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1600  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase chain a  24.51 
 
 
811 aa  148  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.573894  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0897  tetrathionate reductase, subunit A  25.17 
 
 
1029 aa  147  1e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0797102  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0307  molybdopterin oxidoreductase  24.06 
 
 
938 aa  146  2e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.0000000512628  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1869  molybdopterin oxidoreductase  31.78 
 
 
800 aa  146  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0325829 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_20860  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  23.43 
 
 
942 aa  145  3e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1613  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  24.06 
 
 
808 aa  145  3e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2297  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.75 
 
 
798 aa  145  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000563804 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01556  oxidoreductase subunit  24.06 
 
 
808 aa  145  5e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.56782  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0917  molybdopterin oxidoreductase  22.66 
 
 
1022 aa  145  5e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.2527  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01546  hypothetical protein  24.06 
 
 
808 aa  145  5e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.838194  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2296  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.84 
 
 
808 aa  144  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000246763 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1660  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  23.95 
 
 
808 aa  144  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17920  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  26.08 
 
 
826 aa  143  9.999999999999999e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.194946  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1149  molybdopterin oxidoreductase  22.69 
 
 
856 aa  144  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000213682  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01557  oxidoreductase subunit  23.73 
 
 
807 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.405121  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2055  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.78 
 
 
798 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.95 
 
 
808 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01547  hypothetical protein  23.73 
 
 
807 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.475009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2043  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.95 
 
 
808 aa  143  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1795  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.73 
 
 
807 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2042  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  23.73 
 
 
807 aa  142  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1661  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  23.59 
 
 
807 aa  142  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2226  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.53 
 
 
814 aa  142  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.982689 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1773  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  24.07 
 
 
808 aa  141  4.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22240  anaerobic dehydrogenase, typically selenocysteine-containing  21.87 
 
 
836 aa  141  6e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.17201 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1056  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.27 
 
 
814 aa  141  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00898  dimethyl sulfoxide reductase, anaerobic, subunit A  25.27 
 
 
814 aa  141  7e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0778088  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2749  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  25.27 
 
 
814 aa  141  7e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00905  hypothetical protein  25.27 
 
 
814 aa  141  7e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0839348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0999  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.27 
 
 
814 aa  141  7e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2702  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase subunit A  25.27 
 
 
814 aa  141  7e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.98868 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1794  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit YnfE  24.06 
 
 
808 aa  140  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0969  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit  25.27 
 
 
814 aa  140  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0470  molybdopterin oxidoreductase  21.59 
 
 
855 aa  140  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2478  molybdopterin oxidoreductase  23.46 
 
 
820 aa  139  3.0000000000000003e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.495104  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0422  anaerobic dimethyl sulfoxide reductase, A subunit, DmsA/YnfE family  23.92 
 
 
806 aa  139  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0580651  decreased coverage  0.000000000595111 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>