More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0844 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  100 
 
 
386 aa  764    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  65.19 
 
 
379 aa  503  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2959  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  63.33 
 
 
380 aa  489  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528569  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  65.71 
 
 
379 aa  485  1e-136  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  64.49 
 
 
386 aa  473  1e-132  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  63.21 
 
 
383 aa  468  1.0000000000000001e-131  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2932  HTRA-like serine protease signal peptide protein  59.49 
 
 
403 aa  455  1e-127  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  62.85 
 
 
388 aa  456  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  59.03 
 
 
401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  58.73 
 
 
407 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.03 
 
 
401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0412  putative exported serine protease, HtrA/AlgW-like  58.59 
 
 
407 aa  451  1.0000000000000001e-126  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.78 
 
 
401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  58.78 
 
 
401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  59.03 
 
 
401 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  58.78 
 
 
401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3709  serine protease  58.78 
 
 
402 aa  450  1e-125  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2750  serine protease  58.52 
 
 
402 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  61.21 
 
 
398 aa  451  1e-125  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2862  protease Do  59.34 
 
 
404 aa  450  1e-125  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.167767 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3254  serine protease  58.52 
 
 
402 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  61.7 
 
 
384 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  60.21 
 
 
398 aa  450  1e-125  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  58.52 
 
 
402 aa  449  1e-125  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1803  serine protease  58.52 
 
 
402 aa  448  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3209  protease Do  59.09 
 
 
404 aa  448  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3652  serine protease  58.78 
 
 
402 aa  449  1e-125  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  62.47 
 
 
385 aa  445  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2745  2-alkenal reductase  57.58 
 
 
403 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.526629  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2979  serine protease  59.26 
 
 
387 aa  434  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3678  DegQ protease  58.73 
 
 
388 aa  429  1e-119  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.320686  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2700  serine protease  58.2 
 
 
388 aa  425  1e-118  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  61.52 
 
 
385 aa  423  1e-117  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0916  HtrA2 peptidase  59.11 
 
 
383 aa  420  1e-116  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3371  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  56.04 
 
 
383 aa  421  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0133  2-alkenal reductase  52.67 
 
 
392 aa  414  1e-114  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.14619 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  57.03 
 
 
396 aa  409  1e-113  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.308143 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0123  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.69 
 
 
390 aa  407  1.0000000000000001e-112  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0807  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  53.58 
 
 
398 aa  402  1e-111  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.94 
 
 
396 aa  404  1e-111  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0875  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  49.23 
 
 
385 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  54.76 
 
 
385 aa  350  2e-95  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.03 
 
 
408 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0908  2-alkenal reductase  53.27 
 
 
386 aa  342  4e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.544315  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57760  AlgW protein  55.14 
 
 
389 aa  342  7e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0888  2-alkenal reductase  55.69 
 
 
380 aa  342  8e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1301  2-alkenal reductase  52.75 
 
 
402 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4424  2-alkenal reductase  53.27 
 
 
386 aa  341  1e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.377382 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4435  trypsin domain protein  50.53 
 
 
386 aa  340  2e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00143811  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.08 
 
 
412 aa  340  2e-92  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4548  2-alkenal reductase  49.34 
 
 
386 aa  340  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5018  trypsin domain-containing protein  54.52 
 
 
389 aa  339  5.9999999999999996e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4130  peptidase S1, chymotrypsin:PDZ/DHR/GLGF  50 
 
 
386 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52 
 
 
417 aa  321  1.9999999999999998e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0560997  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  52.92 
 
 
372 aa  318  1e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2688  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  52.15 
 
 
391 aa  312  4.999999999999999e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.383027 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2343  protease DO  48.19 
 
 
465 aa  309  5.9999999999999995e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12950  Htr-like protease  51.52 
 
 
383 aa  308  1.0000000000000001e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1505  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  46.68 
 
 
387 aa  306  4.0000000000000004e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.98947  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1726  protease Do  47.4 
 
 
513 aa  305  6e-82  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.618401  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2953  2-alkenal reductase  52.19 
 
 
460 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1270  serine protease  42.3 
 
 
442 aa  293  4e-78  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000478038  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1115  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  43.62 
 
 
442 aa  291  9e-78  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0193596  normal  0.0193298 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  48.79 
 
 
496 aa  290  4e-77  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1580  2-alkenal reductase  45.2 
 
 
443 aa  289  6e-77  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0204264 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1572  peptidase S1C, Do  48.79 
 
 
468 aa  287  2e-76  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0853453  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2338  protease Do  47.73 
 
 
471 aa  283  5.000000000000001e-75  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.206121  normal  0.0104866 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3417  peptidase S1C, Do  48.04 
 
 
467 aa  281  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.966592  normal  0.139479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2404  2-alkenal reductase  42.28 
 
 
350 aa  281  2e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.993946  normal  0.0754706 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1383  protease Do  45.69 
 
 
472 aa  279  5e-74  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  48.02 
 
 
463 aa  278  8e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3148  protease Do  49.69 
 
 
458 aa  276  3e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.398511  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2662  peptidase S1C, Do  50.99 
 
 
491 aa  276  6e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0530  protease Do  44.71 
 
 
457 aa  275  7e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.61451 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2323  peptidase S1C, Do  44.06 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.052989  normal  0.164438 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0806  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  45.51 
 
 
468 aa  274  2.0000000000000002e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00374438  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2139  peptidase S1C, Do  43.36 
 
 
479 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0865536  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1718  protease Do  48.04 
 
 
471 aa  273  3e-72  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0759509  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  45.22 
 
 
474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  45.22 
 
 
474 aa  273  4.0000000000000004e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3156  peptidase S1C, Do  43.32 
 
 
464 aa  273  5.000000000000001e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.967436  normal  0.845897 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0779  periplasmic serine protease DO; heat shock protein HtrA  42.94 
 
 
472 aa  273  5.000000000000001e-72  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3616  protease Do  43.6 
 
 
467 aa  272  7e-72  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0184725  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1037  protease Do  49.32 
 
 
458 aa  272  9e-72  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0470  protease Do  48.04 
 
 
471 aa  271  1e-71  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.102018  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  46.67 
 
 
464 aa  269  7e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6606  HtrA2 peptidase  48.34 
 
 
393 aa  269  8e-71  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.211294  normal  0.127864 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0504  peptidase S1C, Do  46.13 
 
 
453 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0524175  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0690  peptidase Do  46.13 
 
 
450 aa  268  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0142597  hitchhiker  0.0000515523 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3271  peptidase Do  46.13 
 
 
450 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.137957  hitchhiker  0.000509076 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0676  peptidase Do  43.91 
 
 
450 aa  268  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.30411  hitchhiker  0.00175979 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0905  protease Do  43.15 
 
 
502 aa  267  2e-70  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3942  serine protease  46.13 
 
 
450 aa  267  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3140  hypothetical protein  45.92 
 
 
483 aa  268  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.673481  normal  0.234219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4225  protease Do  45.37 
 
 
450 aa  267  2e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000611786  hitchhiker  0.000372275 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3242  putative trypsin-like serine protease  46.53 
 
 
483 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.263085  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3978  protease Do  46.53 
 
 
483 aa  267  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0104728  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4790  protease Do  53.52 
 
 
511 aa  267  2.9999999999999995e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.914829  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3296  protease Do  45.51 
 
 
450 aa  266  4e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0128319  hitchhiker  0.00139389 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1363  protease DO  40.55 
 
 
472 aa  265  8e-70  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>