42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0790 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0790  malonate decarboxylase  100 
 
 		 229 aa  435  1e-121  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00220342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2892  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  42.68 
 
 		 252 aa  137  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.0710753 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3188  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  38.03 
 
 		 245 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.605974 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2046  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  41.82 
 
 		 222 aa  105  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0050  hypothetical protein  39.15 
 
 		 219 aa  104  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.390549  normal  0.0698555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3155  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  42.51 
 
 		 218 aa  104  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0028  hypothetical protein  42.26 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.920505  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6853  hypothetical protein  40.74 
 
 		 218 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4016  malonate decarboxylase  39.07 
 
 		 222 aa  100  2e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0029  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  40.36 
 
 		 219 aa  100  3e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0520843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1245  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  41.81 
 
 		 222 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0753275 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0792  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  41.81 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.147641  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1273  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  41.81 
 
 		 222 aa  95.9  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0280828  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4416  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  41.57 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.356238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0171  hypothetical protein  40.88 
 
 		 219 aa  90.5  2e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.846138 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1163  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  43.03 
 
 		 222 aa  89.7  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.707422  normal  0.167545 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1151  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.85 
 
 		 222 aa  89  6e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4290  hypothetical protein  41.18 
 
 		 209 aa  84.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1077  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  35.81 
 
 		 213 aa  82.4  0.000000000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2799  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  44.25 
 
 		 294 aa  80.1  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0976082  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0075  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  37.56 
 
 		 253 aa  79.3  0.00000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1764  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  35.94 
 
 		 237 aa  74.7  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0610  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.36 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.785994  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1260  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.36 
 
 		 296 aa  72.8  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.199636  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0543  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.36 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.39768  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3033  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.36 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.623128  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1486  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.36 
 
 		 308 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.876381  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1587  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.46 
 
 		 307 aa  72.4  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1456  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  38.46 
 
 		 308 aa  72  0.000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0184396  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5370  holo-ACP synthase, malonate decarboxylase-specific  39.15 
 
 		 229 aa  69.3  0.00000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0548916  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1847  malonate decarboxylase  30.81 
 
 		 231 aa  63.9  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.705884  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3293  hypothetical protein  31.14 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4946  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  35.11 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.11637 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3870  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  35.11 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2443  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  42.86 
 
 		 204 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.216095  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10330  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  36.07 
 
 		 212 aa  49.3  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.460318  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2496  hypothetical protein  24.43 
 
 		 207 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1142  putative malonate decarboxylase, subunit E  23.18 
 
 		 234 aa  47.8  0.0001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0172841  normal  0.360178 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5297  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  29.31 
 
 		 206 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.364033  normal  0.458128 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1062  hypothetical protein  32.04 
 
 		 244 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1241  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  32.07 
 
 		 205 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.136886  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0447  phosphoribosyl-dephospho-CoA transferase  41.94 
 
 		 213 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>