More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0781 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0781  putative permease transmembrane protein  100 
 
 		 533 aa  1041    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.654089  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  73.55 
 
 		 499 aa  682    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  68.87 
 
 		 490 aa  685    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  63.3 
 
 		 495 aa  630  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  61.86 
 
 		 495 aa  615  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  61.1 
 
 		 494 aa  613  9.999999999999999e-175  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  60.37 
 
 		 496 aa  608  1e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  61.86 
 
 		 495 aa  596  1e-169  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  61.86 
 
 		 495 aa  595  1e-169  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  59.69 
 
 		 493 aa  545  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  51.03 
 
 		 469 aa  465  1e-129  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  51.64 
 
 		 469 aa  462  1e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  63.69 
 
 		 463 aa  370  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  65.52 
 
 		 465 aa  366  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  64.95 
 
 		 466 aa  363  3e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  64.95 
 
 		 466 aa  362  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  63.96 
 
 		 466 aa  351  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  68.03 
 
 		 465 aa  335  1e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  58.11 
 
 		 468 aa  333  5e-90  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  63.42 
 
 		 466 aa  331  2e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  59.29 
 
 		 482 aa  329  9e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  58.42 
 
 		 469 aa  325  2e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  59.57 
 
 		 458 aa  320  3e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  60.29 
 
 		 457 aa  317  4e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  59.41 
 
 		 468 aa  316  8e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  58.51 
 
 		 458 aa  316  8e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  58.51 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  57.45 
 
 		 457 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  57.8 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  57.8 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  58.42 
 
 		 469 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  59.19 
 
 		 458 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  59.56 
 
 		 471 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  58.82 
 
 		 457 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  58.82 
 
 		 457 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  58.82 
 
 		 479 aa  312  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  53.71 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  53.71 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  53.71 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  53.71 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  53.71 
 
 		 525 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  53.71 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  53.71 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  53.71 
 
 		 482 aa  305  1.0000000000000001e-81  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  52.23 
 
 		 463 aa  295  2e-78  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  48.31 
 
 		 457 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  52.61 
 
 		 475 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  52.61 
 
 		 475 aa  283  7.000000000000001e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  50 
 
 		 463 aa  279  1e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  51.12 
 
 		 431 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  48.85 
 
 		 449 aa  249  1e-64  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  49.82 
 
 		 463 aa  247  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  53.47 
 
 		 469 aa  240  4e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  53.06 
 
 		 469 aa  239  9e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  45.02 
 
 		 440 aa  239  1e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  45.02 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  45.02 
 
 		 440 aa  238  1e-61  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  44.67 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  44.67 
 
 		 440 aa  237  4e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  44.67 
 
 		 440 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  44.67 
 
 		 440 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  44.67 
 
 		 440 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  44.67 
 
 		 440 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  44.67 
 
 		 440 aa  237  5.0000000000000005e-61  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  48.15 
 
 		 455 aa  236  9e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  48.15 
 
 		 455 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  47.17 
 
 		 489 aa  233  6e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  47.18 
 
 		 452 aa  230  5e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  43.38 
 
 		 446 aa  229  6e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  47.17 
 
 		 458 aa  226  9e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  45.42 
 
 		 501 aa  225  2e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  42.5 
 
 		 444 aa  224  3e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  43.35 
 
 		 457 aa  224  4e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  42.96 
 
 		 440 aa  223  4.9999999999999996e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  46.76 
 
 		 459 aa  223  7e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  44.36 
 
 		 487 aa  221  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  42.86 
 
 		 503 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  43.01 
 
 		 493 aa  222  1.9999999999999999e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  46.3 
 
 		 451 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  42.39 
 
 		 505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  42.55 
 
 		 485 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  42.91 
 
 		 446 aa  220  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  46.26 
 
 		 640 aa  220  6e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  45.2 
 
 		 451 aa  219  8.999999999999998e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  42.75 
 
 		 460 aa  219  1e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  42.03 
 
 		 505 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  41.22 
 
 		 509 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  45.2 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  47.79 
 
 		 633 aa  218  2e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  43.68 
 
 		 497 aa  217  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  44.84 
 
 		 451 aa  217  5e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  41.67 
 
 		 505 aa  216  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  42.51 
 
 		 442 aa  215  1.9999999999999998e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1085  xanthine permease  41.11 
 
 		 424 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  44.09 
 
 		 500 aa  213  4.9999999999999996e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  44.7 
 
 		 448 aa  213  5.999999999999999e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  40.94 
 
 		 505 aa  212  1e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  42.45 
 
 		 825 aa  212  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  41.18 
 
 		 457 aa  209  9e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  41.9 
 
 		 506 aa  209  9e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>