130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0730 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0730  putative polysaccharide transport protein  100 
 
 
505 aa  992    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  28.13 
 
 
487 aa  209  1e-52  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6553  polysaccharide biosynthesis protein  28.75 
 
 
484 aa  178  2e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.413404 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3680  polysaccharide biosynthesis protein  29.58 
 
 
515 aa  148  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3101  polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 
489 aa  146  9e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0405344  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.54 
 
 
486 aa  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0176  polysaccharide biosynthesis protein  28.68 
 
 
503 aa  144  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.15145  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1570  polysaccharide biosynthesis protein  26.86 
 
 
497 aa  141  3e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.482446 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0155  ATPase  25.75 
 
 
483 aa  140  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.76 
 
 
476 aa  139  1e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2240  polysaccharide biosynthesis protein  24.43 
 
 
487 aa  131  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2338  colanic acid exporter  24.53 
 
 
492 aa  129  9.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1611  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 
492 aa  129  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000161996  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1591  polysaccharide biosynthesis protein  23.68 
 
 
479 aa  129  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.267568  normal  0.0585541 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4470  polysaccharide biosynthesis protein  26.84 
 
 
493 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1016  colanic acid exporter  24.29 
 
 
492 aa  128  3e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.6233  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2328  colanic acid exporter  24.51 
 
 
510 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.663239  normal  0.0902335 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2442  colanic acid exporter  24.51 
 
 
510 aa  128  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000846764 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2980  colanic acid exporter  24.29 
 
 
492 aa  128  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.638348  hitchhiker  0.000245488 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1595  colanic acid exporter  24.29 
 
 
492 aa  127  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.14866  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2284  colanic acid exporter  24.51 
 
 
510 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000490639 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2335  colanic acid exporter  24.51 
 
 
510 aa  127  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.673501  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01952  colanic acid exporter  24.06 
 
 
492 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0109189  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01941  hypothetical protein  24.06 
 
 
492 aa  127  6e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0074842  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2335  polysaccharide biosynthesis protein  23.2 
 
 
490 aa  127  7e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000025001  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2227  colanic acid exporter  24.51 
 
 
503 aa  126  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.125419  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1186  colanic acid exporter  24.29 
 
 
492 aa  126  9e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3104  polysaccharide biosynthesis protein  26.19 
 
 
502 aa  126  1e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2660  colanic acid exporter  24.06 
 
 
492 aa  125  1e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.267405  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3930  polysaccharide biosynthesis protein  24.84 
 
 
480 aa  124  4e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1128  polysaccharide biosynthesis protein  26.97 
 
 
508 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  25.37 
 
 
493 aa  123  7e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0174  colanic acid exporter  24.68 
 
 
483 aa  123  9e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.83222  normal  0.572056 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01943  O antigen translocase (Wzx)  21.09 
 
 
475 aa  117  3e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3580  polysaccharide biosynthesis protein  24.65 
 
 
488 aa  118  3e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01932  hypothetical protein  21.09 
 
 
474 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6454  polysaccharide biosynthesis protein  21.73 
 
 
508 aa  117  5e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.24308 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0755  polysaccharide biosynthesis protein  27.02 
 
 
509 aa  114  3e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208479  hitchhiker  0.000633755 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3325  capsular polysaccharide synthesis protein  23.74 
 
 
501 aa  111  4.0000000000000004e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0402719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3901  polysaccharide biosynthesis protein  24.29 
 
 
498 aa  109  1e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  25.61 
 
 
503 aa  108  2e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1408  polysaccharide biosynthesis protein  26.06 
 
 
482 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3719  capsular polysaccharide synthesis protein  24.57 
 
 
504 aa  104  4e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.660756  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1083  polysaccharide biosynthesis protein  24.27 
 
 
484 aa  103  6e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.945146  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4527  polysaccharide biosynthesis protein  28.36 
 
 
514 aa  103  6e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0212681  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0292  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 
499 aa  103  8e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.53568  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5251  polysaccharide biosynthesis protein  29.53 
 
 
490 aa  103  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.179793 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8492  polysaccharide biosynthesis protein  25.67 
 
 
533 aa  103  9e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.941649 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3234  hypothetical protein  24.31 
 
 
501 aa  103  9e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.851144 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1746  polysaccharide biosynthesis protein  26.67 
 
 
509 aa  102  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2706  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 
510 aa  103  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.513472 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1320  polysaccharide biosynthesis protein  22.12 
 
 
475 aa  103  1e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0368639 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5931  succinoglycan biosynthesis transport protein  25 
 
 
492 aa  102  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3244  polysaccharide biosynthesis protein  22.93 
 
 
487 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1209  polysaccharide biosynthesis protein  20.94 
 
 
492 aa  101  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4554  polysaccharide biosynthesis protein  25.22 
 
 
471 aa  101  3e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.184462  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3453  polysaccharide biosynthesis protein  25.4 
 
 
504 aa  101  4e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.231581  normal  0.276623 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4951  polysaccharide biosynthesis protein  26.9 
 
 
494 aa  100  5e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.656313  normal  0.110615 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1968  polysaccharide biosynthesis protein  18.64 
 
 
477 aa  99.4  1e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.901691  hitchhiker  0.000000136517 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
502 aa  98.2  3e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2012  polysaccharide biosynthesis protein  21.79 
 
 
483 aa  97.8  4e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.715057 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4019  polysaccharide biosynthesis protein  21.25 
 
 
483 aa  97.4  5e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4050  polysaccharide biosynthesis protein  23.8 
 
 
501 aa  97.1  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0232705  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02464  probable polysaccharide transport protein  21.77 
 
 
488 aa  96.3  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0454325  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0649  polysaccharide biosynthesis protein  23.54 
 
 
498 aa  95.9  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  21.49 
 
 
507 aa  95.5  2e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3247  hypothetical protein  24.94 
 
 
504 aa  94.4  5e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.443821 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  24.19 
 
 
497 aa  93.6  8e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1735  PST family polysaccharide transporter  22.19 
 
 
479 aa  91.7  3e-17  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.28 
 
 
488 aa  91.3  4e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02920  membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  28.28 
 
 
502 aa  91.3  4e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0641  polysaccharide biosynthesis protein, putative  25.5 
 
 
508 aa  89  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2620  polysaccharide biosynthesis protein  22.34 
 
 
503 aa  88.2  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.509429  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  22.27 
 
 
472 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  24.05 
 
 
510 aa  85.5  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  24.05 
 
 
510 aa  85.1  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0742  polysaccharide biosynthesis protein  32.3 
 
 
575 aa  84  0.000000000000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0990051  hitchhiker  0.00811883 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3346  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 
472 aa  83.2  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.176331  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3128  polysaccharide biosynthesis protein  25.06 
 
 
493 aa  82.8  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2888  polysaccharide biosynthesis protein  24.7 
 
 
494 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0315028 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4055  polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 
469 aa  82  0.00000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3684  polysaccharide biosynthesis protein  26.35 
 
 
490 aa  82  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0592169  normal  0.904888 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  23.62 
 
 
482 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1118  polysaccharide biosynthesis protein  22.2 
 
 
484 aa  81.3  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1187  polysaccharide biosynthesis protein  23.58 
 
 
488 aa  80.9  0.00000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1061  membrane protein  23.71 
 
 
512 aa  77.4  0.0000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.597487 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3216  polysaccharide biosynthesis protein  26.83 
 
 
500 aa  75.9  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0846  polysaccharide biosynthesis protein  21.99 
 
 
421 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.556284  hitchhiker  0.00594876 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 
504 aa  75.5  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2967  polysaccharide biosynthesis protein  26.21 
 
 
500 aa  75.9  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0892  polysaccharide biosynthesis protein  33.77 
 
 
484 aa  75.1  0.000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1004  polysaccharide biosynthesis protein  25.94 
 
 
514 aa  74.7  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0175607 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2414  polysaccharide biosynthesis protein  22.05 
 
 
492 aa  74.7  0.000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.217364  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3544  polysaccharide biosynthesis protein  24.44 
 
 
530 aa  73.9  0.000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2347  polysaccharide biosynthesis protein  21.45 
 
 
499 aa  70.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2629  polysaccharide biosynthesis protein  22.55 
 
 
504 aa  70.1  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01297  Polysaccharide biosynthesis protein  21.9 
 
 
483 aa  70.1  0.00000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.833887  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1890  polysaccharide biosynthesis protein  26.15 
 
 
507 aa  69.3  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.673288  normal  0.907682 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1942  polysaccharide biosynthesis protein  22.63 
 
 
491 aa  68.9  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0839  polysaccharide biosynthesis protein  20.18 
 
 
423 aa  67.4  0.0000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.305723  normal  0.0285529 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>