More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0651 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0651  putative GTP-binding protein  100 
 
 		 312 aa  634    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.181354  normal  0.422678 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0597  GTP-binding protein Era  80.95 
 
 		 348 aa  501  1e-141  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00117321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3266  GTP-binding protein Era  72.31 
 
 		 337 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0242334 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2619  GTP-binding protein Era  72.31 
 
 		 337 aa  458  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1197  GTP-binding protein Era  73 
 
 		 344 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.194461  normal  0.0122322 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5260  GTP-binding protein Era  70.66 
 
 		 344 aa  457  9.999999999999999e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.678388  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3060  GTP-binding protein Era  70.42 
 
 		 357 aa  457  1e-127  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.547585  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3634  GTP-binding protein Era  69.87 
 
 		 314 aa  454  1.0000000000000001e-126  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.407522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1744  GTP-binding protein Era  68.55 
 
 		 314 aa  447  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000728906  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1403  GTP-binding protein Era  67.18 
 
 		 321 aa  439  9.999999999999999e-123  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3237  GTP-binding protein Era  68.91 
 
 		 340 aa  436  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0752084  normal  0.147355 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4247  GTP-binding protein Era  66.33 
 
 		 299 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0655  GTP-binding protein Era  66.33 
 
 		 299 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1011  GTP-binding protein Era  66.67 
 
 		 299 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.262432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1135  GTP-binding protein Era  66.33 
 
 		 299 aa  412  1e-114  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1731  GTP-binding protein Era  66.67 
 
 		 299 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.379458  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2251  GTP-binding protein Era  63.73 
 
 		 311 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.41102  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2169  GTP-binding protein Era  64.97 
 
 		 299 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0368513  normal  0.378234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2898  GTP-binding protein Era  64.97 
 
 		 299 aa  404  1e-111  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.22233  normal  0.295103 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2465  GTP-binding protein Era  63.75 
 
 		 311 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1064  GTP-binding protein Era  66.56 
 
 		 298 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0212543  normal  0.0907756 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1093  GTP-binding protein Era  65.98 
 
 		 287 aa  404  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.324542  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0544  GTP-binding protein Era  65.65 
 
 		 299 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.439886  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2894  GTP-binding protein Era  65.65 
 
 		 299 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0929  GTP-binding protein Era  63.61 
 
 		 312 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.163867  normal  0.15052 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2839  GTP-binding protein Era  65.65 
 
 		 299 aa  404  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1015  GTP-binding protein Era  66.32 
 
 		 287 aa  403  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1788  GTP-binding protein Era  65.65 
 
 		 299 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0994  GTP-binding protein Era  63.61 
 
 		 312 aa  403  1e-111  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.307835  normal  0.0847852 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1086  GTP-binding protein Era  64.63 
 
 		 299 aa  404  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2417  GTP-binding protein Era  66.22 
 
 		 312 aa  404  1e-111  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.262207 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2816  GTP-binding protein Era  65.65 
 
 		 299 aa  404  1e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.989072  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2778  GTP-binding protein Era  65.31 
 
 		 299 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0842  GTP-binding protein Era  64.95 
 
 		 287 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0615921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0407  GTP-binding protein Era  59.11 
 
 		 311 aa  371  1e-102  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2311  GTP-binding protein Era  59.18 
 
 		 309 aa  350  2e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.254696  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2085  GTPase  56.76 
 
 		 297 aa  349  3e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.965881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0414  GTP-binding protein Era  56.81 
 
 		 297 aa  341  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2030  GTP-binding protein Era  56.71 
 
 		 294 aa  337  1.9999999999999998e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0924182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0864  GTP-binding protein Era  55.97 
 
 		 296 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0183856 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1008  GTP-binding protein Era  55.97 
 
 		 296 aa  333  2e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.028746 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1754  GTP-binding protein Era  51.18 
 
 		 302 aa  318  5e-86  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.141942  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1160  GTP-binding protein Era  49.84 
 
 		 338 aa  308  5e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.15184  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3111  GTP-binding protein Era  49.84 
 
 		 338 aa  308  8e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00956624  hitchhiker  0.00355255 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1279  GTP-binding protein Era  49.84 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.446406  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0973  GTP-binding protein Era  49.66 
 
 		 311 aa  307  1.0000000000000001e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1202  GTP-binding protein Era  49.84 
 
 		 338 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0677572  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1246  GTP-binding protein Era  49.84 
 
 		 338 aa  308  1.0000000000000001e-82  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1349  GTP-binding protein Era  49.52 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2847  GTP-binding protein Era  49.52 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.410629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2929  GTP-binding protein Era  49.52 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.275755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3025  GTP-binding protein Era  49.52 
 
 		 339 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.118015  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1004  GTP-binding protein Era  49.32 
 
 		 311 aa  303  2.0000000000000002e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1244  GTP-binding protein Era  49.19 
 
 		 329 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000178109  unclonable  0.0000000143866 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2765  GTP-binding protein Era  49.19 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00576917  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2928  GTP-binding protein Era  48.54 
 
 		 334 aa  300  2e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0641  GTP-binding protein Era  51.69 
 
 		 300 aa  300  2e-80  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0881  GTP-binding protein Era  50.68 
 
 		 332 aa  299  5e-80  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.427391  normal  0.11596 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1149  GTP-binding protein Era  48.86 
 
 		 335 aa  298  9e-80  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.28675  normal  0.946741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02997  GTP-binding protein Era  50.8 
 
 		 314 aa  297  2e-79  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.249422  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3148  GTP-binding protein Era  51.36 
 
 		 300 aa  295  5e-79  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0159525  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1038  GTP-binding protein Era  48.53 
 
 		 330 aa  295  5e-79  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00137835  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1239  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 300 aa  294  1e-78  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.680465  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1055  GTP-binding protein Era  48.2 
 
 		 331 aa  293  3e-78  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.305359  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4121  GTP-binding protein Era  52.22 
 
 		 305 aa  290  2e-77  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.383616  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2457  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 306 aa  287  2e-76  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1348  GTP-binding protein Era  49.33 
 
 		 315 aa  285  5.999999999999999e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.136623  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02460  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1102  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0130588  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2721  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3802  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02424  hypothetical protein  50.51 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1111  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 301 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3053  GTP-binding protein Era  49.5 
 
 		 301 aa  283  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.23462  normal  0.0104922 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2719  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0551516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2852  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0251331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2931  GTP-binding protein Era  50.51 
 
 		 301 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.163008  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1387  GTP-binding protein Era  50.66 
 
 		 308 aa  283  3.0000000000000004e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.263237  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1247  GTP-binding protein Era  46.18 
 
 		 300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.734456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3612  GTP-binding protein Era  48.34 
 
 		 303 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.387158  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1190  GTP-binding protein Era  48.34 
 
 		 303 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.442285  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1137  GTP-binding protein Era  48.34 
 
 		 303 aa  282  6.000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472293  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2958  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2823  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0482  GTP-binding protein Era  47.51 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2742  GTP-binding protein Era  50.17 
 
 		 301 aa  280  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0288239  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1632  GTP-binding protein Era  46.98 
 
 		 299 aa  280  2e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.392106  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2524  GTP-binding protein Era  46.15 
 
 		 321 aa  280  3e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00258575  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2783  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2846  GTP-binding protein Era  49.83 
 
 		 301 aa  279  4e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal  0.818064 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3070  GTP-binding protein Era  47.65 
 
 		 301 aa  276  4e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.129104  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1069  GTP-binding protein Era  48.81 
 
 		 301 aa  276  4e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1205  GTP-binding protein Era  47.99 
 
 		 301 aa  276  5e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.745594  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1685  GTP-binding protein Era  46.84 
 
 		 295 aa  275  9e-73  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2784  GTP-binding protein Era  48.14 
 
 		 301 aa  274  1.0000000000000001e-72  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.731152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3668  GTP-binding protein Era  48.32 
 
 		 302 aa  274  2.0000000000000002e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0995  GTP-binding protein Era  50.34 
 
 		 300 aa  273  3e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0611001 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0735  GTP-binding protein Era  45.31 
 
 		 314 aa  273  3e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.222854  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2974  GTP-binding protein Era  47.18 
 
 		 298 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0899132  hitchhiker  0.00507105 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1476  GTP-binding protein Era  51.52 
 
 		 299 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.881887  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>