More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0617 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0617  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  100 
 
 		 232 aa  478  1e-134  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.48837 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5912  methyltransferase type 11  37.75 
 
 		 706 aa  115  5e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7834  Methyltransferase type 11  33.62 
 
 		 316 aa  102  4e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.26678  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  36.97 
 
 		 194 aa  75.5  0.0000000000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  35.37 
 
 		 285 aa  73.9  0.000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  37.32 
 
 		 276 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  37.37 
 
 		 213 aa  69.7  0.00000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5589  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 275 aa  68.9  0.00000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.251711  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 270 aa  68.9  0.00000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1664  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 271 aa  68.6  0.00000000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10857  hypothetical protein  36.36 
 
 		 270 aa  65.9  0.0000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.530808  hitchhiker  0.000000211273 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1168  Methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 267 aa  65.5  0.0000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1806  methyltransferase type 11  29.68 
 
 		 310 aa  65.1  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  32.28 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0630  hypothetical protein  31.35 
 
 		 240 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1761  DNA topoisomerase II  40 
 
 		 658 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.271812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 		 272 aa  63.5  0.000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 239 aa  63.5  0.000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.35 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3244  methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 280 aa  62.8  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  36.56 
 
 		 293 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10980  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.82 
 
 		 296 aa  62  0.000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 281 aa  62  0.000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0965  Methyltransferase type 11  34.42 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0162273  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  37.93 
 
 		 194 aa  61.2  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  40.35 
 
 		 634 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3984  methyltransferase type 11  40 
 
 		 245 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.237178  normal  0.931629 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4181  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0254  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 		 273 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0228  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 		 243 aa  60.1  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000960813  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0833  Methyltransferase type 11  32.43 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.741572  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4893  hypothetical protein  31.43 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.148209  normal  0.270235 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 		 242 aa  59.7  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6478  methyltransferase type 11  34.55 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0560724  normal  0.10851 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0899  methyltransferase  32.65 
 
 		 328 aa  59.7  0.00000004  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2082  Methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0250363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2634  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.162625  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.81 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2709  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 204 aa  59.3  0.00000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.690891  normal  0.954825 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 225 aa  59.3  0.00000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3815  methyltransferase type 11  35.09 
 
 		 271 aa  58.9  0.00000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.577541  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2595  methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.133869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1751  Methyltransferase type 11  33 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.190561  hitchhiker  0.00369788 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  36.43 
 
 		 232 aa  58.9  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4779  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766265 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 196 aa  58.5  0.00000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3630  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 272 aa  58.5  0.00000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  33.86 
 
 		 313 aa  57.8  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2546  hypothetical protein  26.85 
 
 		 280 aa  58.2  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.346853  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 256 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0189  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.82 
 
 		 275 aa  57.8  0.0000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2754  biotin biosynthesis protein BioC  31.13 
 
 		 272 aa  58.2  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.32969  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4588  Methyltransferase type 12  29.85 
 
 		 457 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.28526  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 244 aa  57.4  0.0000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3428  Methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 267 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.512533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1561  Methyltransferase type 11  32.82 
 
 		 283 aa  57  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.160915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2400  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 330 aa  57  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00744372 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  31.25 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3711  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.157205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5793  Methyltransferase type 11  30.99 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  42.73 
 
 		 291 aa  56.6  0.0000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  29.67 
 
 		 215 aa  57  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3127  methyltransferase type 11  36.73 
 
 		 261 aa  57  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.484844  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3753  methyltransferase type 11  34.92 
 
 		 2490 aa  57  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  27.64 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0427  hypothetical protein  34.31 
 
 		 241 aa  56.2  0.0000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.142898  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2147  methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3059  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 238 aa  56.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  31 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3259  hypothetical protein  32.58 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2320  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 205 aa  55.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.107701  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0579  methyltransferase type 11  31.82 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0658  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 233 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.382141  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1413  methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 402 aa  55.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2252  methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2745  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 482 aa  55.5  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4269  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 332 aa  55.8  0.0000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.589079  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2874  type 11 methyltransferase  35.04 
 
 		 237 aa  55.5  0.0000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.35 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  34.69 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1100  methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.613335  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  32 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2090  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 341 aa  55.5  0.0000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1457  methyltransferase type 11  28.81 
 
 		 344 aa  55.1  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.33 
 
 		 255 aa  55.1  0.0000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2999  methyltransferase type 11  34.71 
 
 		 246 aa  55.1  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0921858  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13054  hypothetical protein  36.89 
 
 		 327 aa  54.7  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.100828 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 		 214 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  31 
 
 		 200 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  30.43 
 
 		 242 aa  54.7  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  34.86 
 
 		 711 aa  54.3  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1859  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 328 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.48002  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.06 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1906  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 328 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3153  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 295 aa  54.3  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.205722  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1840  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 328 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>