287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0577 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0577  flagellar biosynthesis protein  100 
 
 
256 aa  491  1e-138  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.778054  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1028  flagellar biosynthetic protein FliR  65.62 
 
 
253 aa  328  7e-89  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3795  flagellar biosynthetic protein FliR  57.36 
 
 
256 aa  281  8e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3069  flagellar biosynthetic protein FliR  57.26 
 
 
247 aa  269  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.159103  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0650  flagellar biosynthetic protein FliR  53.33 
 
 
256 aa  266  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4383  flagellar biosynthetic protein FliR  52.65 
 
 
247 aa  259  2e-68  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1126  flagellar biosynthetic protein FliR  54.36 
 
 
256 aa  258  7e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0562  flagellar biosynthetic protein FliR  53.91 
 
 
240 aa  248  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.949104  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1612  flagellar biosynthesis protein FliR  47.13 
 
 
262 aa  200  2e-50  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0247066 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1357  flagellar biosynthetic protein FliR  43.7 
 
 
260 aa  198  9e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.811405  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2541  flagellar biosynthesis protein FliR  42.57 
 
 
264 aa  180  2e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00342215  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0054  flagellar biosynthetic protein FliR  40.86 
 
 
260 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  40.86 
 
 
260 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0035  flagellar biosynthetic protein FliR  40.86 
 
 
260 aa  180  2e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2912  flagellar biosynthetic protein FliR  41.84 
 
 
265 aa  179  3e-44  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.219958  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  43.53 
 
 
260 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0034  flagellar biosynthetic protein FliR  43.53 
 
 
260 aa  178  7e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1859  flagellar biosynthetic protein FliR  43.53 
 
 
260 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.352593  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2693  flagellar biosynthetic protein FliR  43.53 
 
 
260 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2684  flagellar biosynthetic protein FliR  43.53 
 
 
260 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.648177  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3268  flagellar biosynthetic protein FliR  43.53 
 
 
260 aa  178  9e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3782  flagellar biosynthetic protein FliR  39.37 
 
 
260 aa  177  2e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0245  flagellar biosynthetic protein FliR  43.14 
 
 
260 aa  176  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0761  flagellar biosynthesis protein FliR  38.96 
 
 
260 aa  174  1e-42  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.272612  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2943  flagellar biosynthetic protein FliR  37.8 
 
 
260 aa  174  1e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4180  flagellar biosynthetic protein FliR  41.57 
 
 
264 aa  172  3e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2587  flagellar biosynthesis protein FliR  39.92 
 
 
261 aa  172  6e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0032  flagellar biosynthetic protein FliR  41.18 
 
 
260 aa  171  9e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.413107  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1879  flagellar biosynthesis protein FliR  41.99 
 
 
261 aa  171  1e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5879  flagellar biosynthesis protein FliR  38.55 
 
 
261 aa  171  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.250463  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0038  flagellar biosynthetic protein FliR  40.54 
 
 
260 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0027  flagellar biosynthetic protein FliR  42.02 
 
 
260 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0036  flagellar biosynthetic protein FliR  42.02 
 
 
260 aa  169  3e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1966  flagellar biosynthetic protein FliR  37.89 
 
 
266 aa  169  4e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0222409  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3219  flagellar biosynthesis protein FliR  39.85 
 
 
260 aa  167  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.454549 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0153  flagellar biosynthesis protein FliR  38.04 
 
 
260 aa  166  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.800809 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5303  flagellar biosynthetic protein FliR  37.08 
 
 
261 aa  166  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.114912 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2304  flagellar biosynthesis protein FliR  40.7 
 
 
260 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2404  flagellar biosynthesis protein FliR  40.7 
 
 
260 aa  159  4e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.688451  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1967  flagellar biosynthetic protein FliR  37.75 
 
 
261 aa  155  6e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1564  flagellar biosynthetic protein FliR  40.73 
 
 
260 aa  150  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.16328  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1333  flagellar biosynthetic protein FliR  37.99 
 
 
257 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.762927  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1261  flagellar biosynthesis protein FliR  41.37 
 
 
264 aa  147  2e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0910889  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2144  flagellar biosynthesis protein FliR  41.37 
 
 
264 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0345603  hitchhiker  0.00457903 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2197  flagellar biosynthesis protein FliR  41.37 
 
 
264 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103622  normal  0.587287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2139  flagellar biosynthesis protein FliR  41.37 
 
 
264 aa  146  3e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.19844  normal  0.226973 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1138  flagellar biosynthesis protein FliR  40.96 
 
 
264 aa  146  4e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  9.10874e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2170  flagellar biosynthetic protein FliR  35.32 
 
 
261 aa  145  8e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2959  flagellar biosynthesis protein FliR  38.43 
 
 
260 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2727  flagellar biosynthesis protein FliR  43.78 
 
 
261 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00116197  normal  0.508279 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4759  flagellar biosynthetic protein FliR  39.16 
 
 
262 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0696365  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3682  flagellar biosynthetic protein FliR  39.16 
 
 
262 aa  142  5e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0756404  normal  0.879793 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1234  flagellar biosynthesis protein FliR  43.78 
 
 
261 aa  142  6e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  1.14634e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2183  flagellar biosynthesis protein FliR  43.78 
 
 
261 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  2.59397e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1071  flagellar biosynthesis protein FliR  43.37 
 
 
261 aa  141  8e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  3.09979e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2050  flagellar biosynthesis protein FliR  45.22 
 
 
261 aa  141  9e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  7.09328e-11  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1698  flagellar biosynthetic protein FliR  43.37 
 
 
261 aa  141  9e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  4.12821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1692  flagellar biosynthesis protein FliR  43.78 
 
 
261 aa  141  1e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  5.55568e-06  normal  0.0138418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0215  flagellar biosynthetic protein FliR  38.4 
 
 
260 aa  139  4e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.598232  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1514  flagellar biosynthesis protein FliR  35.34 
 
 
260 aa  138  9e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0373  flagellar biosynthetic fliR transmembrane protein  37.02 
 
 
262 aa  137  2e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24110  flagellar biosynthetic protein  38.12 
 
 
264 aa  137  2e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.253106  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0742  flagellar biosynthetic protein FliR  34.69 
 
 
247 aa  136  3e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.42269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3442  flagellar biosynthesis protein FliR  31.73 
 
 
261 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.65432 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1354  flagellar biosynthesis protein FliR  35.75 
 
 
265 aa  130  2e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.541538  normal  0.208053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1361  flagellar biosynthesis protein FliR  35.75 
 
 
265 aa  130  3e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.837405 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02875  flagellar biosynthesis protein FliR  35.06 
 
 
259 aa  129  4e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1294  flagellar biosynthesis protein FliR  36.65 
 
 
265 aa  129  4e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.755718  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3216  flagellar biosynthesis protein FliR  35.68 
 
 
265 aa  129  5e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3054  flagellar biosynthesis protein FliR  35.4 
 
 
265 aa  128  1e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.649566  normal  0.208411 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3056  flagellar biosynthesis protein FliR  36.56 
 
 
265 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.394206 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2564  flagellar biosynthesis protein FliR  35.29 
 
 
265 aa  127  2e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1974  flagellar biosynthetic protein FliR  32.2 
 
 
258 aa  127  2e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0533447  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0980  flagellar biosynthetic protein FliR  33.18 
 
 
260 aa  127  2e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.250656  normal  0.0129952 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2914  flagellar biosynthesis protein FliR  36.56 
 
 
265 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.401935  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1449  flagellar biosynthesis protein FliR  35.93 
 
 
265 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.22312  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1170  flagellar biosynthetic protein FliR  33.48 
 
 
253 aa  127  2e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.113223 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2924  flagellar biosynthesis protein FliR  36.56 
 
 
265 aa  127  2e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3679  flagellar biosynthesis protein FliR  33.04 
 
 
258 aa  126  3e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0271988  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1194  flagellar biosynthesis protein FliR  33.75 
 
 
267 aa  126  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1982  flagellar biosynthesis protein FliR  32.61 
 
 
261 aa  126  3e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.345887  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1373  flagellar biosynthesis protein FliR  35.81 
 
 
266 aa  124  1e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.458801  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0712  flagellar biosynthetic protein FliR  34.98 
 
 
258 aa  123  2e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1378  flagellar biosynthesis protein FliR  33.33 
 
 
265 aa  123  2e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.720864  normal  0.279429 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2285  flagellar biosynthesis protein FliR  35.84 
 
 
262 aa  124  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216836  normal  0.948189 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45740  flagellar biosynthesis protein FliR  36.8 
 
 
258 aa  122  8e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1338  flagellar biosynthesis protein FliR  33.47 
 
 
267 aa  121  1e-26  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1630  flagellar biosynthesis protein FliR  34.8 
 
 
261 aa  121  1e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3879  flagellar biosynthesis protein FliR  35.44 
 
 
258 aa  120  2e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3035  flagellar biosynthesis protein FliR  33.6 
 
 
259 aa  119  4e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1513  flagellar biosynthesis protein FliR  31.3 
 
 
258 aa  119  4e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.859445  normal  0.0902161 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3915  flagellar biosynthesis protein FliR  31.3 
 
 
258 aa  119  4e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.834588  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2810  flagellar biosynthesis protein FliR  32.33 
 
 
258 aa  119  7e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.47893  normal  0.0490399 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4353  flagellar biosynthesis protein FliR  30.43 
 
 
258 aa  118  8e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.923206  normal  0.179069 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1551  flagellar biosynthesis protein FliR  31.9 
 
 
261 aa  118  1e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00272266  normal  0.357527 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2033  flagellar biosynthesis protein FliR  30.25 
 
 
265 aa  117  1e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.468794  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0482  flagellar biosynthetic protein FliR  30.97 
 
 
263 aa  112  5e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2924  flagellar biosynthetic protein FliR  33.2 
 
 
259 aa  112  6e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0091  flagellar biosynthetic protein FliR  27.63 
 
 
259 aa  111  1e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1751  flagellar biosynthetic protein fliR  30.51 
 
 
256 aa  111  1e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>