91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0540 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0540  putative major capsid protein  100 
 
 		 388 aa  793    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.272419 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0867  HK97 family phage major capsid protein  37.89 
 
 		 407 aa  253  5.000000000000001e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.887226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1999  phage major capsid protein, HK97  42.95 
 
 		 380 aa  251  1e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431544 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2174  putative phage major capsid protein  41.58 
 
 		 405 aa  248  1e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1061  phage major capsid protein, HK97  41.39 
 
 		 398 aa  248  2e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0887541 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1655  phage major capsid protein, HK97 family  36.94 
 
 		 406 aa  246  4e-64  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0906  HK97 family phage major capsid protein  35.19 
 
 		 435 aa  239  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.225289  normal  0.497938 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1970  phage major capsid protein, HK97  38.8 
 
 		 431 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.141118  normal  0.540615 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1635  phage major capsid protein, HK97  40 
 
 		 393 aa  236  4e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.304591  normal  0.904057 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1167  Phage major capsid protein, HK97  39.74 
 
 		 417 aa  232  9e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1415  phage major capsid protein, HK97  36.2 
 
 		 417 aa  231  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2096  phage major capsid protein, HK97 family  38.42 
 
 		 418 aa  231  2e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.225363  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1427  phage major capsid protein, HK97 family  37.13 
 
 		 421 aa  230  4e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.370183 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1705  phage major capsid protein, HK97 family  36.31 
 
 		 421 aa  228  1e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.154021  normal  0.125329 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0922  HK97 family phage major capsid protein  36.19 
 
 		 403 aa  227  2e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.255185 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1431  HK97 family phage major capsid protein  36.86 
 
 		 421 aa  226  4e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.263231 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1805  phage major capsid protein, HK97  35.12 
 
 		 416 aa  226  6e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.539863  normal  0.129536 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2898  HK97 family phage major capsid protein  35.17 
 
 		 388 aa  224  2e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593833  normal  0.443807 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3122  phage major capsid protein, HK97  40.21 
 
 		 380 aa  224  2e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3155  HK97 family phage major capsid protein  36.59 
 
 		 428 aa  223  6e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0231727  normal  0.0147808 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3709  HK97 family phage major capsid protein  41.27 
 
 		 450 aa  222  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4965  HK97 family phage major capsid protein  36.22 
 
 		 430 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000154569 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3913  HK97 family phage major capsid protein  36.99 
 
 		 408 aa  220  3e-56  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.511324  normal  0.0176262 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3481  Phage major capsid protein, HK97  35.73 
 
 		 417 aa  219  6e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.137838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1078  HK97 family phage major capsid protein  39.56 
 
 		 387 aa  218  1e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.506947 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1338  phage major capsid protein HK97 family  39.09 
 
 		 420 aa  217  2.9999999999999998e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0373474  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6186  phage major capsid protein HK97 family  38.33 
 
 		 471 aa  214  1.9999999999999998e-54  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.423125  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1133  HK97 family phage major capsid protein  37.66 
 
 		 387 aa  211  3e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2471  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  37.66 
 
 		 398 aa  210  4e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2263  phage major capsid protein, HK97 family  31.09 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0574985 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2266  phage major capsid protein, HK97 family  31.09 
 
 		 401 aa  204  2e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000739522 
 
 
-
 
NC_004310  BR0589  HK97 family major capsid protein  34.97 
 
 		 424 aa  204  2e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1190  HK97 family phage major capsid protein  36.07 
 
 		 401 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000012399 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1542  Phage major capsid protein, HK97  37.59 
 
 		 419 aa  190  4e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0644  HK97 family phage major capsid protein  35.33 
 
 		 379 aa  179  4.999999999999999e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.146587 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0795  HK97 family phage major capsid protein  35 
 
 		 379 aa  178  1e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3867  HK97 family phage major capsid protein  32.38 
 
 		 425 aa  176  6e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292858 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1047  HK97 family phage major capsid protein  31.23 
 
 		 441 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.144894  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0951  HK97 family phage major capsid protein  29.61 
 
 		 389 aa  173  3.9999999999999995e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0861  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  28.57 
 
 		 403 aa  162  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.456659  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0458  HK97 family phage major capsid protein  28.84 
 
 		 399 aa  159  7e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.830326  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2500  phage major capsid protein, HK97 family  30.67 
 
 		 416 aa  157  4e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00454127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1334  HK97 family phage major capsid protein  28 
 
 		 424 aa  143  6e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.280266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0256  HK97 family phage major capsid protein  28.42 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0170854  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1895  HK97 family phage major capsid protein  30.39 
 
 		 389 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1359  HK97 family phage major capsid protein  31.81 
 
 		 385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal  0.308637 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1719  phage major capsid protein, HK97  31.27 
 
 		 384 aa  136  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2025  phage major capsid protein, HK97  30 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.848367  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0337  phage major capsid protein, HK97  30 
 
 		 382 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.139658  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0830  HK97 family phage major capsid protein  28.95 
 
 		 383 aa  134  3e-30  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0277  HK97 family phage major capsid protein  30.95 
 
 		 385 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3980  phage major capsid protein, HK97 family  29.03 
 
 		 382 aa  125  9e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010721  Mpop_5467  hypothetical protein  27.79 
 
 		 386 aa  125  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1482  Phage major capsid protein, HK97  28.24 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.353157 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1625  Phage major capsid protein, HK97  28.24 
 
 		 385 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.490763  normal  0.450118 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2358  phage phi-C31 gp36-like protein /HK97 family major capsid protein  27.14 
 
 		 420 aa  119  9e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.172606  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2489  phage major capsid protein, HK97  30.11 
 
 		 390 aa  119  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0466  HK97 family phage major capsid protein  27.12 
 
 		 369 aa  107  3e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1254  HK97 family phage major capsid protein  27.06 
 
 		 399 aa  103  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1628  HK97 family phage major capsid protein  25.48 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1022  phage major capsid protein, HK97 family  28.16 
 
 		 411 aa  93.2  7e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0400  HK97 family phage major capsid protein  24.43 
 
 		 397 aa  92.4  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1695  phage major capsid protein, HK97 family  27 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1311  phage major capsid protein, HK97 family  27 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2271  phage major capsid protein, HK97 family  27 
 
 		 427 aa  91.7  2e-17  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2834  phage major capsid protein, HK97 family  24.1 
 
 		 397 aa  90.9  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.174812  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1085  HK97 family major capsid protein  24.37 
 
 		 405 aa  88.2  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1485  phage phi-C31 gp36 major capsid-like protein  24.01 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1466  HK97 family phage major capsid protein  27.9 
 
 		 312 aa  81.3  0.00000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000392324  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3313  phage major capsid protein, HK97 family  23.14 
 
 		 562 aa  75.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000533544 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3970  HK97 family phage major capsid protein  26.29 
 
 		 413 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.33538 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0852  major capsid protein, HK97 family  22.38 
 
 		 386 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0590991  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0875  phage capsid family protein  24.51 
 
 		 315 aa  66.2  0.0000000008  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2598  HK97 family phage major capsid protein  22.55 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00517058 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1458  HK97 family major capsid protein  23.74 
 
 		 388 aa  60.8  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.90039  n/a   
 
 
-
 
NC_014149  Plim_4253  phage major capsid protein, HK97 family  24.52 
 
 		 440 aa  60.5  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7329  phage major capsid protein, HK97 family  27.78 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4361  phage major capsid protein, HK97  24.6 
 
 		 389 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.455164  normal  0.407566 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4981  HK97 family phage major capsid protein  20.71 
 
 		 359 aa  53.1  0.000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1086  HK97 family phage major capsid protein  21.95 
 
 		 400 aa  52.8  0.00001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5360  HK97 family phage major capsid protein  20.71 
 
 		 346 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2179  phage major capsid protein, HK97 family  24.29 
 
 		 373 aa  49.3  0.0001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1970  major capsid-like protein  23.16 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.244233  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3486  HK97 family phage major capsid protein  26.51 
 
 		 394 aa  49.7  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.168874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1998  phage major capsid protein, HK97 family  23.23 
 
 		 438 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1684  phage phi-C31 GP36-like protein  23.19 
 
 		 412 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.885456 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3898  major capsid protein HK97  24.74 
 
 		 279 aa  45.4  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2474  major capsid protein HK97  23.13 
 
 		 483 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.690827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0446  prophage LambdaBa04, major capsid protein  26.4 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0468  prophage LambdaBa04, major capsid protein  26.4 
 
 		 396 aa  43.5  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7144  HK97 family phage major capsid protein  28.57 
 
 		 434 aa  42.7  0.01  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00647338 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>