36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0490 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0490  polygranule-associated protein  100 
 
 		 182 aa  353  5e-97  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.394794  normal  0.0296543 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3495  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  59.86 
 
 		 194 aa  178  2.9999999999999997e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.827909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4024  poly granule associated  60.81 
 
 		 168 aa  177  5.999999999999999e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.533985  normal  0.490701 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3527  poly granule associated  65.83 
 
 		 200 aa  168  4e-41  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.219058  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2170  poly granule associated family protein  52.98 
 
 		 183 aa  137  6e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.940571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0552  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  52.38 
 
 		 157 aa  136  2e-31  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0536  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  51.59 
 
 		 157 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.326611  normal  0.0874326 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0350  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  50.36 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1492  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  41.41 
 
 		 139 aa  104  8e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0391  Poly granule associated  38.41 
 
 		 230 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5147  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaF  35.62 
 
 		 257 aa  92  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2543  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  39.39 
 
 		 163 aa  88.6  5e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.00882865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00722  poly(hydroxyalcanoate) granule associated protein  33.13 
 
 		 187 aa  87  1e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.176303  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0389  Poly granule associated  35.54 
 
 		 140 aa  82.4  0.000000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0390  Poly granule associated  35.29 
 
 		 292 aa  80.1  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.210715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66880  hypothetical protein  30.08 
 
 		 138 aa  78.2  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0525  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  37.09 
 
 		 148 aa  77.8  0.00000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.233444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5800  hypothetical protein  30.83 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5799  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  31.2 
 
 		 322 aa  77  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5058  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.79 
 
 		 139 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66875  polyhydroxyalkanoate synthesis protein PhaF  31.2 
 
 		 309 aa  76.6  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5057  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.52 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4881  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.52 
 
 		 261 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0559  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  31.5 
 
 		 168 aa  75.9  0.0000000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0457  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.52 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868468  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5008  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  31.15 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4882  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  31.15 
 
 		 139 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.780933 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5007  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  32.52 
 
 		 261 aa  75.5  0.0000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.508327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0456  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  31.97 
 
 		 139 aa  74.7  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.891613  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0604  poly(hydroxyalcanoate) granule associated protein  27.64 
 
 		 168 aa  74.3  0.0000000000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0526  poly(hydroxyalkanoate) granule-associated protein  30.47 
 
 		 284 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.170611  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5148  polyhydroxyalkanoate granule-associated protein PhaI  32.8 
 
 		 148 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2415  hypothetical protein  32.99 
 
 		 177 aa  47.4  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.471261  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01151  hypothetical protein  29.13 
 
 		 119 aa  45.1  0.0006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1550  hypothetical protein  38.16 
 
 		 131 aa  41.6  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00170451  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  31.62 
 
 		 129 aa  40.8  0.01  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>