169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0287 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0287  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  529  1e-149  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.475037  normal  0.0161119 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4054  AzlC family protein  61.16 
 
 
249 aa  258  9e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.557844  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3399  AzlC family protein  61.16 
 
 
249 aa  258  1e-67  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.780663  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0830  AzlC family protein  60.85 
 
 
287 aa  233  3e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4691  AzlC family protein  55.56 
 
 
288 aa  232  6e-60  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0353  AzlC family protein  56.63 
 
 
259 aa  228  6e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.16576 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4080  AzlC family protein  59.11 
 
 
252 aa  218  7e-56  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3876  AzlC family protein  55.65 
 
 
249 aa  216  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4637  AzlC-like  55.65 
 
 
255 aa  205  5e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.621968  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5110  AzlC family protein  48.75 
 
 
246 aa  195  6e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0563  AzlC-like  43.68 
 
 
276 aa  192  5e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.973282  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  45.58 
 
 
266 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0457  AzlC family protein  45.62 
 
 
251 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.279448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0568  hypothetical protein  43.31 
 
 
265 aa  177  1e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2019  AzlC-like  42.56 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2659  AzlC family protein  42.56 
 
 
251 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.334456  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2630  AzlC family protein  42.56 
 
 
272 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.805391  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0668  AzlC family protein  45.24 
 
 
251 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.69294 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0488  AzlC family protein  44.49 
 
 
264 aa  167  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.116445  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2550  AzlC family protein  48.1 
 
 
251 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.121866  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2677  AzlC family protein  46.89 
 
 
251 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.820347  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0687  branched chain amino acid efflux pump LivE  43.5 
 
 
248 aa  165  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.264369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0661  AzlC family protein  47.26 
 
 
253 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.428637  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0993  AzlC family protein  46.34 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.486943  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0831  AzlC family protein  46.34 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0835  AzlC family protein  46.34 
 
 
249 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.327675  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1274  AzlC family protein  40.71 
 
 
241 aa  164  2.0000000000000002e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0294  AzlC family protein  46.08 
 
 
249 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.871513  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0589  AzlC family protein  46.08 
 
 
249 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2422  AzlC family protein  46.08 
 
 
249 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0035  AzlC family protein  46.08 
 
 
249 aa  162  6e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0475  AzlC family protein  46.27 
 
 
264 aa  161  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5961  AzlC-like efflux pump  47.92 
 
 
251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.151164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3279  AzlC family protein  44.88 
 
 
248 aa  154  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.981424  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  32.73 
 
 
234 aa  112  6e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  34.4 
 
 
234 aa  111  2.0000000000000002e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  31.08 
 
 
228 aa  109  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  31.3 
 
 
246 aa  100  3e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  31.58 
 
 
228 aa  98.2  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  33.49 
 
 
240 aa  96.7  3e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  29.73 
 
 
244 aa  96.7  4e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  32.61 
 
 
258 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  30 
 
 
244 aa  94.7  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  30.45 
 
 
242 aa  89.7  5e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  32.79 
 
 
255 aa  89  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  29.7 
 
 
265 aa  85.5  9e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0461  AzlC-like  27.94 
 
 
240 aa  85.1  0.000000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  27.11 
 
 
250 aa  84  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1962  AzlC family protein  30.08 
 
 
240 aa  84.3  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  29.58 
 
 
257 aa  84  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  33.48 
 
 
255 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  29.78 
 
 
242 aa  83.6  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  31.11 
 
 
253 aa  82.8  0.000000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3078  AzlC family protein  27.93 
 
 
234 aa  82  0.000000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  30.67 
 
 
253 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  29.78 
 
 
242 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  32.43 
 
 
247 aa  80.9  0.00000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0429  AzlC family protein  31.15 
 
 
258 aa  80.5  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  decreased coverage  0.000397006  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  28.09 
 
 
235 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  28.1 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  31.54 
 
 
292 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  28.1 
 
 
235 aa  79.3  0.00000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  28.51 
 
 
242 aa  79  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  33.19 
 
 
280 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  30.98 
 
 
250 aa  77.4  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  33.19 
 
 
255 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0575  AzlC family protein  33.15 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  34.46 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  34.46 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  31.94 
 
 
249 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  29.63 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  30.29 
 
 
243 aa  68.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1721  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  27.66 
 
 
235 aa  68.6  0.00000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000124363  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  26.71 
 
 
244 aa  68.6  0.0000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  32.61 
 
 
247 aa  68.2  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  26.13 
 
 
244 aa  67.8  0.0000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2667  AzlC family protein  31.52 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.301711  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  26.58 
 
 
282 aa  66.6  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1744  branched-chain amino acid permease (azaleucine resistance)  30.34 
 
 
231 aa  65.5  0.0000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.260158  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  26.52 
 
 
242 aa  65.1  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  24.76 
 
 
242 aa  64.7  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0697  AzlC family protein  31.66 
 
 
256 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  26.2 
 
 
241 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  26.79 
 
 
233 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  26.2 
 
 
241 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  26.2 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  26.2 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  26.2 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  26.2 
 
 
241 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  25.76 
 
 
241 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  25.76 
 
 
241 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  25.76 
 
 
241 aa  62.8  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0256  AzlC family protein  25.58 
 
 
233 aa  62.4  0.000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0306834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4092  AzlC family protein  27.06 
 
 
242 aa  62.4  0.000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2930  AzlC family protein  33.51 
 
 
245 aa  62  0.000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.862263 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1391  AzlC family protein  25.33 
 
 
244 aa  62  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.475326  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  27.69 
 
 
238 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2051  branched-chain amino acid transport protein AzlC, putative  26.89 
 
 
230 aa  59.7  0.00000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  35.87 
 
 
240 aa  58.9  0.00000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  26.64 
 
 
240 aa  58.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>