121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0282 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0282  putative signal peptide protein  100 
 
 
387 aa  779  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0184346 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0349  peptidoglycan-binding LysM  59.5 
 
 
394 aa  426  1e-118  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0885534 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3861  peptidoglycan-binding LysM  50.25 
 
 
409 aa  353  4e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4640  peptidoglycan-binding LysM  51.19 
 
 
408 aa  352  9e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.132875  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3879  peptidoglycan-binding LysM  47.93 
 
 
430 aa  333  3e-90  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5114  Peptidoglycan-binding LysM  46.75 
 
 
405 aa  330  2e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0439251  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4050  peptidoglycan-binding LysM  44.87 
 
 
426 aa  311  8e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.021914  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4687  peptidoglycan-binding LysM  47.06 
 
 
417 aa  311  9e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3395  Peptidoglycan-binding LysM  44.62 
 
 
419 aa  308  1e-82  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4083  peptidoglycan-binding LysM  45.53 
 
 
420 aa  307  2e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.164352  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0834  peptidoglycan-binding LysM  44.53 
 
 
401 aa  298  1e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3409  peptidoglycan-binding LysM  43.11 
 
 
388 aa  286  4e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.392654  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3680  Peptidoglycan-binding LysM  42.06 
 
 
395 aa  254  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0069  signal peptide protein  41.64 
 
 
390 aa  251  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3357  Peptidoglycan-binding LysM  41.64 
 
 
364 aa  250  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.695863  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0096  Peptidoglycan-binding LysM  40.73 
 
 
349 aa  246  4e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3566  peptidoglycan-binding LysM  39.11 
 
 
358 aa  244  2e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0020  peptidoglycan-binding LysM  37.71 
 
 
343 aa  236  5e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.732804  normal  0.419154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0188  peptidoglycan-binding LysM  38.51 
 
 
350 aa  229  7e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000749903 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0013  peptidoglycan-binding LysM-like protein  36.2 
 
 
403 aa  220  3e-56  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.154454 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0044  peptidoglycan-binding LysM  37.99 
 
 
338 aa  213  4e-54  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3013  peptidoglycan-binding LysM  38.39 
 
 
345 aa  210  3e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00210  lysin domain-containing protein  37.35 
 
 
341 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0120002  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0056  peptidoglycan-binding LysM  38.12 
 
 
345 aa  208  1e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0021  hypothetical protein  37.05 
 
 
341 aa  207  4e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156222  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0194  peptidoglycan-binding LysM  35.87 
 
 
383 aa  205  1e-51  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00180  peptidoglycan-binding LysM protein  36.94 
 
 
341 aa  201  2e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0309659  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0018  peptidoglycan-binding LysM  37.35 
 
 
341 aa  198  1e-49  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  1.9767e-06  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0020  peptidoglycan-binding LysM  37.17 
 
 
341 aa  197  2e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0176  LysM domain protein  36.58 
 
 
341 aa  196  7e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2274  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  32.46 
 
 
389 aa  183  5e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00514615 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0022  hypothetical protein  32.08 
 
 
352 aa  182  6e-45  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.124597  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2629  peptidoglycan-binding LysM  34.65 
 
 
338 aa  173  5e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.829323  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0021  LysM domain-containing protein  30.99 
 
 
361 aa  170  4e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0025  peptidoglycan-binding LysM  31.7 
 
 
368 aa  162  9e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2842  LysM domain-containing protein  33.62 
 
 
341 aa  160  5e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2519  hypothetical protein  33.43 
 
 
345 aa  156  7e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3735  peptidoglycan-binding LysM  31.32 
 
 
365 aa  156  8e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.315042  hitchhiker  0.00230648 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0025  peptidoglycan-binding LysM  29.91 
 
 
374 aa  154  3e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3586  Peptidoglycan-binding LysM  31.37 
 
 
377 aa  154  3e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2649  hypothetical protein  33.14 
 
 
345 aa  153  5e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2087  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  30.41 
 
 
393 aa  152  8e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2136  hypothetical protein  28.13 
 
 
377 aa  150  3e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.116452 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0028  peptidoglycan-binding LysM  30.2 
 
 
376 aa  148  2e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0033  peptidoglycan-binding LysM  30.2 
 
 
376 aa  148  2e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0032  peptidoglycan-binding LysM  30.2 
 
 
376 aa  148  2e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00105156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0033  LysM domain-containing protein  28.98 
 
 
378 aa  148  2e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0032  Peptidoglycan-binding LysM  30.2 
 
 
376 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  2.35775e-06 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2464  peptidoglycan-binding LysM  28.29 
 
 
377 aa  147  3e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.175579 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0036  peptidoglycan-binding LysM  30.86 
 
 
367 aa  146  5e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.971795  normal  0.107314 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04054  LysM domain protein  30.89 
 
 
366 aa  146  5e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0028  peptidoglycan-binding LysM  29.68 
 
 
374 aa  145  1e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.198583 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0044  LysM domain-containing protein  30.2 
 
 
346 aa  143  4e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.764087  normal  0.149636 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0030  peptidoglycan-binding LysM  28.37 
 
 
374 aa  143  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.772252  hitchhiker  0.00540943 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0036  peptidoglycan-binding LysM  29.39 
 
 
374 aa  143  5e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  2.43599e-05 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0077  peptidoglycan-binding LysM  31.1 
 
 
360 aa  142  8e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.820269 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0025  peptidoglycan-binding LysM  30.77 
 
 
369 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0032  peptidoglycan-binding LysM  30.17 
 
 
362 aa  136  5e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2472  hypothetical protein  31.1 
 
 
391 aa  135  1e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0039  peptidoglycan-binding LysM  29.89 
 
 
369 aa  135  1e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.357546 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0409  LysM domain-containing protein  30.27 
 
 
333 aa  130  4e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.22112e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0019  Peptidoglycan-binding LysM  28.62 
 
 
349 aa  129  1e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.154254 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0018  LysM domain protein  28.62 
 
 
349 aa  129  1e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1930  hypothetical protein  30.25 
 
 
384 aa  126  6e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1866  peptidoglycan-binding LysM  29.51 
 
 
384 aa  124  3e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0076  putative cell wall degradation enzyme  30.09 
 
 
353 aa  124  4e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0024  peptidoglycan-binding LysM  27.33 
 
 
359 aa  116  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00023  Peptidoglycan-binding LysM  28.95 
 
 
367 aa  116  7e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.574097  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002058  LysM domain-containing protein  29.12 
 
 
364 aa  110  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.778363  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00390  hypothetical protein  27.67 
 
 
364 aa  109  7e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2701  peptidoglycan-binding LysM  28.94 
 
 
440 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2887  Peptidoglycan-binding LysM  29.43 
 
 
440 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.94359  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2794  Peptidoglycan-binding LysM  29.11 
 
 
440 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0244523  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3268  Peptidoglycan-binding LysM  25.53 
 
 
339 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000361142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2695  peptidoglycan-binding LysM  29.48 
 
 
435 aa  102  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.123815 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0530  peptidoglycan-binding LysM  28.19 
 
 
331 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2551  LysM domain-containing protein  28.4 
 
 
335 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551976  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0889  peptidoglycan-binding LysM  27.57 
 
 
333 aa  92  2e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  3.0411e-06  hitchhiker  3.23717e-12 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3691  peptidoglycan-binding LysM  27.46 
 
 
340 aa  89.4  1e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  2.7016e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0537  peptidoglycan-binding LysM  26.61 
 
 
394 aa  87.4  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  2.01658e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0501  Peptidoglycan-binding lysin domain protein  27.5 
 
 
429 aa  83.2  7e-15  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2866  hypothetical protein  29.48 
 
 
329 aa  80.1  7e-14  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2713  Peptidoglycan-binding LysM  27.86 
 
 
335 aa  67.4  4e-10  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.292431  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1527  Peptidoglycan-binding LysM  27.78 
 
 
338 aa  65.5  2e-09  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.27524e-30 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2489  peptidoglycan-binding LysM  33.8 
 
 
219 aa  53.9  4e-06  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0553  peptidoglycan-binding LysM  30.53 
 
 
428 aa  53.9  4e-06  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3954  hypothetical protein  51.02 
 
 
405 aa  54.3  4e-06  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.10149  normal  0.332371 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5282  Peptidoglycan-binding LysM  43.4 
 
 
552 aa  54.3  4e-06  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.772795 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1636  Peptidoglycan-binding LysM  50 
 
 
451 aa  53.9  5e-06  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0461  peptidoglycan-binding LysM  47.17 
 
 
439 aa  52.4  1e-05  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.520913  normal  0.0203741 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5209  Peptidoglycan-binding LysM  37.88 
 
 
511 aa  50.8  4e-05  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.263437 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0972  peptidoglycan-binding LysM  38.46 
 
 
546 aa  50.4  5e-05  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1930  peptidoglycan-binding LysM  44.23 
 
 
503 aa  50.4  5e-05  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0490055 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1910  peptidoglycan-binding LysM  46 
 
 
382 aa  49.7  9e-05  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.937907 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4742  peptidoglycan-binding LysM  42.86 
 
 
511 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6887  transcriptional regulator, SARP family  34.25 
 
 
935 aa  48.9  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.691511  normal  0.899507 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1442  hypothetical protein  37.88 
 
 
212 aa  48.1  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2091  hypothetical protein  28.47 
 
 
167 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.314887  normal  0.895772 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0448  LysM domain-containing protein  38.46 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0441  LysM domain-containing protein  38.46 
 
 
404 aa  48.1  0.0003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.21565  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>