More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0164 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  100 
 
 		 420 aa  828    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  59.86 
 
 		 411 aa  504  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  59.56 
 
 		 425 aa  467  9.999999999999999e-131  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  34.9 
 
 		 414 aa  180  4e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  39.37 
 
 		 413 aa  169  8e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  34.94 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  35.91 
 
 		 418 aa  149  8e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  33.53 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  36.26 
 
 		 434 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  38.21 
 
 		 445 aa  145  1e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  34.34 
 
 		 424 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  32.74 
 
 		 434 aa  143  7e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  34.77 
 
 		 423 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  34.96 
 
 		 423 aa  141  3e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  34.46 
 
 		 426 aa  139  8.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 457 aa  136  6.0000000000000005e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2826  geranylgeranyl reductase  35.6 
 
 		 443 aa  136  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0858816 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  32.94 
 
 		 435 aa  135  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  31.61 
 
 		 425 aa  133  5e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  34.11 
 
 		 431 aa  131  2.0000000000000002e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  36.69 
 
 		 419 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  31.99 
 
 		 431 aa  130  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3131  geranylgeranyl reductase  36.36 
 
 		 444 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  35.71 
 
 		 440 aa  127  3e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  32.74 
 
 		 424 aa  123  8e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  31.71 
 
 		 398 aa  122  9.999999999999999e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  31.34 
 
 		 398 aa  116  6e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  32.45 
 
 		 430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  29.61 
 
 		 393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  29.91 
 
 		 393 aa  114  3e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  31.94 
 
 		 443 aa  111  3e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  32.09 
 
 		 409 aa  103  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 393 aa  100  5e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  32.26 
 
 		 466 aa  100  7e-20  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  28.66 
 
 		 393 aa  99.4  9e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0362  geranylgeranyl reductase  33.14 
 
 		 436 aa  99.4  1e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.495463  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1294  geranylgeranyl reductase  32.45 
 
 		 420 aa  98.6  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.730528  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  32.49 
 
 		 431 aa  97.4  4e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.76 
 
 		 384 aa  96.3  8e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.55 
 
 		 389 aa  95.5  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  32.6 
 
 		 416 aa  95.5  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  34.91 
 
 		 415 aa  95.5  2e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0770  geranylgeranyl reductase  32.27 
 
 		 400 aa  94.4  3e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0765  geranylgeranyl reductase  31.97 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.616022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10571  oxidoreductase  32.9 
 
 		 408 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.649109  normal  0.274108 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0784  geranylgeranyl reductase  32.27 
 
 		 406 aa  94.7  3e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  33.23 
 
 		 409 aa  93.6  6e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 376 aa  92  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 		 382 aa  92  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 		 415 aa  91.3  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0991  geranylgeranyl reductase  31.11 
 
 		 418 aa  91.3  3e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1099  geranylgeranyl reductase  33.43 
 
 		 435 aa  89.7  8e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.997696  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  26.4 
 
 		 406 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  28.44 
 
 		 381 aa  83.2  0.000000000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  29.13 
 
 		 506 aa  82.4  0.00000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  31.21 
 
 		 429 aa  81.3  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 407 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  33.01 
 
 		 403 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10884  conserved hypothetical protein  25.79 
 
 		 647 aa  79.3  0.0000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  29.69 
 
 		 384 aa  79.3  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0948  geranylgeranyl reductase  34.94 
 
 		 417 aa  79.3  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.3862  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  30.58 
 
 		 378 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  29.58 
 
 		 367 aa  77.4  0.0000000000004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  24.57 
 
 		 362 aa  77  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  30.09 
 
 		 400 aa  76.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1332  oxidoreductase, FAD-binding, putative  30.51 
 
 		 449 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.401661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  23.86 
 
 		 370 aa  75.5  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 368 aa  75.1  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  31.07 
 
 		 406 aa  74.7  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  28.69 
 
 		 455 aa  73.9  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  22.8 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.16 
 
 		 387 aa  72.8  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  24.49 
 
 		 408 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.37 
 
 		 396 aa  70.9  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2237  tryptophan halogenase  25.66 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  24.17 
 
 		 390 aa  70.5  0.00000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  27.61 
 
 		 455 aa  70.1  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  25.45 
 
 		 495 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 398 aa  70.1  0.00000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  27.83 
 
 		 394 aa  70.1  0.00000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0808  geranylgeranyl reductase  32.95 
 
 		 406 aa  69.7  0.00000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.967973  hitchhiker  0.000310699 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  27.73 
 
 		 417 aa  68.9  0.0000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4606  tryptophan halogenase  23.98 
 
 		 420 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.577017 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  25.66 
 
 		 444 aa  68.6  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  26.5 
 
 		 453 aa  68.9  0.0000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.29 
 
 		 365 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  26.9 
 
 		 409 aa  68.2  0.0000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  29.35 
 
 		 403 aa  68.9  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0327  geranylgeranyl reductase  32.66 
 
 		 373 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.252383  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  27.6 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  28.75 
 
 		 399 aa  68.9  0.0000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  29.72 
 
 		 398 aa  67.8  0.0000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3957  tryptophan halogenase  26.07 
 
 		 444 aa  68.2  0.0000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.89 
 
 		 395 aa  67.4  0.0000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4161  putative tryptophan halogenase  25.29 
 
 		 470 aa  67.8  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.326464 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  28.21 
 
 		 394 aa  67.4  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>