More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0130 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0130  outer membrane porin protein  100 
 
 		 326 aa  657    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0258844  normal  0.0261696 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  44.57 
 
 		 327 aa  241  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  44.78 
 
 		 336 aa  229  4e-59  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  45.09 
 
 		 329 aa  228  2e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  44.18 
 
 		 336 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  40.92 
 
 		 340 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  36.12 
 
 		 381 aa  124  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  31.32 
 
 		 383 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  33.53 
 
 		 413 aa  119  7e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  31 
 
 		 381 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  37.04 
 
 		 383 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  30.5 
 
 		 379 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  30.25 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  30.25 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  31.99 
 
 		 396 aa  116  5e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  30.25 
 
 		 379 aa  116  5e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  30.25 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  37.41 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  30 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  31.74 
 
 		 394 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  32.96 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  32.47 
 
 		 368 aa  114  3e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  33.05 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  35.51 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  32.96 
 
 		 430 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  33.33 
 
 		 374 aa  114  3e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  35.23 
 
 		 390 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  34.94 
 
 		 381 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  33.8 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  33.8 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  33.8 
 
 		 430 aa  113  5e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  33.8 
 
 		 390 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  33.77 
 
 		 355 aa  112  7.000000000000001e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  32.37 
 
 		 376 aa  112  9e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  35.58 
 
 		 383 aa  111  1.0000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  28.53 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  31.74 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  30.54 
 
 		 381 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02026  porin signal peptide protein  32.11 
 
 		 382 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.555277 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  33.42 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1245  porin  32.04 
 
 		 342 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6212  porin Gram-negative type  31.07 
 
 		 389 aa  109  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.324597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  36.78 
 
 		 374 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  32.05 
 
 		 393 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  29.65 
 
 		 389 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  32.9 
 
 		 376 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  31.41 
 
 		 385 aa  105  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  33.72 
 
 		 383 aa  106  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  31.63 
 
 		 386 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  31.41 
 
 		 385 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  29.79 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  31.89 
 
 		 386 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  29.79 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  29.79 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4097  OmpC family outer membrane porin  31.44 
 
 		 389 aa  105  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0112259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  29.79 
 
 		 374 aa  105  1e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  31.32 
 
 		 339 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  30.89 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  32.01 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  31.12 
 
 		 386 aa  104  2e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  32.01 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  32.01 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  32.01 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  32.01 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  30.89 
 
 		 383 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  32.01 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  32.01 
 
 		 384 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  34.96 
 
 		 391 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  29.31 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  33.46 
 
 		 411 aa  103  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  31.63 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  33.71 
 
 		 414 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  29.31 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  31.63 
 
 		 386 aa  103  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  29.31 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  31.2 
 
 		 388 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  29.31 
 
 		 376 aa  103  4e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.9 
 
 		 354 aa  103  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  30.63 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  30.63 
 
 		 383 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  31 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  31.12 
 
 		 386 aa  102  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  31 
 
 		 436 aa  102  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  31.04 
 
 		 394 aa  102  7e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  31 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  31 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  31 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  31 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  31 
 
 		 386 aa  102  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  29.65 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  32.29 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  30.25 
 
 		 436 aa  102  1e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3528  OmpC family outer membrane porin  30.13 
 
 		 372 aa  101  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.169266 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  30.73 
 
 		 387 aa  100  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  29.9 
 
 		 375 aa  100  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5786  porin  29.2 
 
 		 358 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10486  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  32.84 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  32.65 
 
 		 390 aa  101  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  32.84 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  32.84 
 
 		 362 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>