265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0123 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0123  thiosulfate binding protein  100 
 
 
337 aa  684    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000442607 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0614  thiosulphate-binding protein  66.26 
 
 
329 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.772188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45110  sulfate-binding protein of ABC transporter  63.28 
 
 
332 aa  411  1e-114  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3839  sulfate-binding protein of ABC transporter  62.95 
 
 
332 aa  409  1e-113  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0169  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.94 
 
 
341 aa  401  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1591  thiosulphate-binding protein  59.38 
 
 
332 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00740648  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0443  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.01 
 
 
341 aa  396  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4305  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.84 
 
 
332 aa  391  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3383  extracellular solute-binding protein  59.87 
 
 
341 aa  394  1e-108  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0659293  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3870  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.16 
 
 
332 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4267  sulfate ABC transporter periplasmic ligand-binding protein  56.8 
 
 
341 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0582405 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3632  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.84 
 
 
332 aa  388  1e-107  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2531  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.17 
 
 
356 aa  386  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.000000000783626  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0325  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.25 
 
 
337 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0392  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.79 
 
 
337 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0560  sulfate-binding protein precursor  57.79 
 
 
337 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.845456  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0371  sulfate/thiosulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.79 
 
 
337 aa  379  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.597645  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30540  Sulfate ABC transporter-binding component-CysP-like protein  58.68 
 
 
332 aa  380  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3693  thiosulphate-binding protein  56.16 
 
 
332 aa  378  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1565  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  59.22 
 
 
332 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.105023  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2961  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  61.04 
 
 
338 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2376  thiosulphate-binding protein  55.69 
 
 
330 aa  372  1e-102  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2992  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.96 
 
 
339 aa  374  1e-102  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3894  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.57 
 
 
337 aa  373  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0402445  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4118  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.92 
 
 
359 aa  369  1e-101  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000140992  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1336  sulfate-binding precursor signal peptide protein  59.09 
 
 
336 aa  365  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.533362  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3625  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.79 
 
 
332 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.929699  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1906  thiosulphate-binding protein  57.93 
 
 
337 aa  365  1e-100  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000896115  hitchhiker  0.00000000124986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0866  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.98 
 
 
334 aa  366  1e-100  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2134  thiosulphate-binding protein  56.1 
 
 
331 aa  364  1e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  3.73195e-21  decreased coverage  0.000103932 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1543  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.12 
 
 
330 aa  364  1e-99  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.513686  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1781  thiosulphate-binding protein  56.35 
 
 
344 aa  363  2e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2966  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.25 
 
 
339 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.806732 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1211  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.16 
 
 
339 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0110956  normal  0.0538246 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2331  thiosulphate-binding protein  58.25 
 
 
339 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0147593  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1274  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.16 
 
 
339 aa  363  2e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.401936  normal  0.300495 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2945  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.25 
 
 
339 aa  363  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1723  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.33 
 
 
329 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000440935  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2940  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.25 
 
 
363 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0899  sulfate starvation-induced protein 2  56.37 
 
 
338 aa  362  4e-99  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.368441  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0821  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.21 
 
 
329 aa  361  1e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0561556  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1762  thiosulphate-binding protein  56.73 
 
 
332 aa  360  1e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.478994  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3560  thiosulphate-binding protein  54.91 
 
 
329 aa  361  1e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4010  thiosulphate-binding protein  54.91 
 
 
329 aa  359  3e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.311837 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0122  thiosulfate binding protein  57.96 
 
 
337 aa  358  9e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.964738  decreased coverage  0.00000712106 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2545  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  58.01 
 
 
337 aa  357  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.437885  normal  0.0124572 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0563  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.57 
 
 
341 aa  358  9.999999999999999e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.201199  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2855  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.96 
 
 
339 aa  356  2.9999999999999997e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1346  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.1 
 
 
337 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6297  ABC thiosulphate transporter, periplasmic ligand binding protein  57.28 
 
 
339 aa  355  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0733  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.94 
 
 
337 aa  355  5.999999999999999e-97  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3804  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.66 
 
 
337 aa  355  7.999999999999999e-97  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6977  sulfate ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  53.37 
 
 
329 aa  352  4e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4345  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  56.49 
 
 
332 aa  352  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4590  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  57.43 
 
 
342 aa  352  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1369  thiosulphate-binding protein  59.31 
 
 
335 aa  352  5.9999999999999994e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0327074  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4652  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.5 
 
 
337 aa  352  7e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1045  thiosulphate-binding protein  53.99 
 
 
327 aa  351  1e-95  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1799  sulfate adenylyltransferase, large subunit  56.45 
 
 
807 aa  350  2e-95  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2470  ABC sulfate/thiosulfate transporter, periplasmic ligand binding protein, CysP  56.27 
 
 
346 aa  350  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0297151  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1156  thiosulphate-binding protein  54.6 
 
 
329 aa  350  2e-95  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.464796 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2422  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.99 
 
 
343 aa  350  3e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.944907 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03802  sulfate transporter subunit  55.35 
 
 
329 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4068  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.35 
 
 
329 aa  349  4e-95  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4357  sulfate transporter subunit  55.35 
 
 
329 aa  349  4e-95  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.427406 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4148  sulfate transporter subunit  55.35 
 
 
329 aa  349  4e-95  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03751  hypothetical protein  55.35 
 
 
329 aa  349  4e-95  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4451  sulfate transporter subunit  55.35 
 
 
329 aa  349  4e-95  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4101  sulfate transporter subunit  55.35 
 
 
329 aa  349  4e-95  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1978  thiosulphate-binding protein  60.65 
 
 
335 aa  348  5e-95  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0507  thiosulphate-binding protein  55.26 
 
 
330 aa  349  5e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.347365  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4280  sulfate transporter subunit  55.66 
 
 
329 aa  348  7e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0399629  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4397  sulfate transporter subunit  55.03 
 
 
329 aa  348  7e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1552  thiosulphate-binding protein  54.04 
 
 
335 aa  348  8e-95  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1519  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.78 
 
 
335 aa  348  1e-94  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.059232  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1398  thiosulphate-binding protein  54.07 
 
 
336 aa  347  1e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2338  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.78 
 
 
335 aa  347  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0895899  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4461  sulfate transporter subunit  55.35 
 
 
329 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5372  sulfate transporter subunit  55.03 
 
 
329 aa  347  2e-94  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1223  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  50.88 
 
 
358 aa  347  2e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5479  sulfate adenylyltransferase, large subunit  55.81 
 
 
798 aa  346  3e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0197363  decreased coverage  0.00943774 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2105  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.59 
 
 
341 aa  346  3e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.126635  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4055  sulfate transporter subunit  55.35 
 
 
329 aa  346  4e-94  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4394  sulfate transporter subunit  55.03 
 
 
329 aa  345  6e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.770755  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4392  sulfate transporter subunit  55.03 
 
 
329 aa  345  8e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.188872  normal  0.694674 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4410  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.56 
 
 
342 aa  344  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.476755  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03700  sulfate-binding protein precursor  52.27 
 
 
332 aa  344  2e-93  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000120397 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2760  thiosulphate-binding protein  55.21 
 
 
329 aa  343  2.9999999999999997e-93  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.997597 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2196  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  54.93 
 
 
345 aa  343  2.9999999999999997e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.559252  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2345  thiosulphate-binding protein  54.22 
 
 
342 aa  341  8e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.6842  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2061  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.83 
 
 
331 aa  341  1e-92  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.647625  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0620  thiosulphate-binding protein  57.23 
 
 
336 aa  340  1e-92  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.000000295034  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1378  thiosulphate-binding protein  52.92 
 
 
335 aa  341  1e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02518  ABC transporter sulfate binding protein  53.61 
 
 
365 aa  340  1e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.607163  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0374  sulfate-binding protein precursor  51.96 
 
 
332 aa  341  1e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.93068  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4309  sulfate transporter subunit  55.92 
 
 
329 aa  341  1e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0090  sulfate transporter subunit  56.07 
 
 
329 aa  340  2e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4018  thiosulphate-binding protein  52.04 
 
 
335 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.206129  normal  0.132982 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0967  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  51.49 
 
 
337 aa  340  2e-92  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4554  sulfate ABC transporter, periplasmic sulfate-binding protein  55.59 
 
 
350 aa  339  4e-92  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>