20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0101 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0101  hypothetical protein  100 
 
 
1937 aa  3834    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.485173 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1200  hypothetical protein  33.48 
 
 
2159 aa  594  1e-168  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.932976 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3618  hypothetical protein  33.3 
 
 
1805 aa  568  1e-160  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.461669  hitchhiker  0.00340564 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0108  hypothetical protein  31.62 
 
 
1878 aa  537  1e-151  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1049  hypothetical protein  32.51 
 
 
1460 aa  469  9.999999999999999e-131  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.523001  normal  0.173427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0589  hypothetical protein  29.25 
 
 
1921 aa  459  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1230  hypothetical protein  30.24 
 
 
1831 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3192  hypothetical protein  28.19 
 
 
933 aa  186  4.0000000000000006e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00191616 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0200  hypothetical protein  27.66 
 
 
1268 aa  81.3  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.01392  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3056  PGAP1 family protein  28.98 
 
 
487 aa  60.5  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4965  hypothetical protein  28.96 
 
 
457 aa  56.6  0.000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.580527  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1925  hypothetical protein  28.18 
 
 
783 aa  53.1  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3805  prophage LambdaBa01, acyltransferase  23.43 
 
 
876 aa  52.4  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0223905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3524  prophage LambdaBa01, acyltransferase  23.43 
 
 
876 aa  52.4  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3055  hypothetical protein  26.07 
 
 
615 aa  52  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1130  hypothetical protein  29.32 
 
 
468 aa  47.4  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00209773  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1019  hypothetical protein  27.93 
 
 
659 aa  47.4  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.172565  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1768  TPR repeat-containing protein  26.63 
 
 
923 aa  45.8  0.007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.706396 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1361  TPR repeat-containing protein  24.02 
 
 
1276 aa  45.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2528  hypothetical protein  27.12 
 
 
459 aa  45.8  0.008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>