More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0077 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0077  putative transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  100 
 
 
509 aa  1001    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.156508 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0499  histidine kinase  64.81 
 
 
518 aa  589  1e-167  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00445235 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  58.91 
 
 
484 aa  549  1e-155  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3348  histidine kinase  61.1 
 
 
481 aa  528  1e-149  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0882915  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3998  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.1 
 
 
493 aa  529  1e-149  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4688  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  59.18 
 
 
487 aa  519  1e-146  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.125794  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3959  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  59.18 
 
 
481 aa  516  1.0000000000000001e-145  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0390859 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0358  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.49 
 
 
482 aa  516  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0877  histidine kinase  59.53 
 
 
500 aa  509  1e-143  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.43922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0549  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  56.69 
 
 
513 aa  503  1e-141  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4637  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  61.91 
 
 
485 aa  503  1e-141  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.337185  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0464  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  56.9 
 
 
524 aa  501  1e-141  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0453  histidine kinase  56.28 
 
 
526 aa  499  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0469  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.86 
 
 
531 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0525  sensor histidine kinase  57.11 
 
 
517 aa  493  9.999999999999999e-139  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.265453  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2701  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.83 
 
 
517 aa  487  1e-136  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.64728  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0641  sensor histidine kinase  57.7 
 
 
517 aa  486  1e-136  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2575  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  57.58 
 
 
519 aa  484  1e-135  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.39 
 
 
515 aa  484  1e-135  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0679423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0438  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.11 
 
 
515 aa  482  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5198  histidine kinase  56.03 
 
 
481 aa  478  1e-133  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0648  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.87 
 
 
515 aa  473  1e-132  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0970  two-component sensor kinase transcriptional regulatory protein  56.49 
 
 
817 aa  472  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.862903  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2654  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.17 
 
 
517 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.957819  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2043  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  57.17 
 
 
517 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0232948  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2683  histidine kinase  57.39 
 
 
517 aa  474  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0812  sensor histidine kinase  56.28 
 
 
518 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.237942  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3297  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  55.75 
 
 
515 aa  470  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0213546  normal  0.936608 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0808  sensor histidine kinase  56.49 
 
 
523 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0669  Signal transduction histidine Kinases (STHK)  55.53 
 
 
515 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.329598 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0270  sensor histidine kinase  54.76 
 
 
505 aa  449  1e-125  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.258994  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0019  sensor histidine kinase  54.76 
 
 
505 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2406  sensor histidine kinase  54.76 
 
 
505 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.451511  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2670  sensor histidine kinase  54.76 
 
 
505 aa  450  1e-125  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0430  sensor histidine kinase  48.67 
 
 
501 aa  425  1e-117  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00032493 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1422  histidine kinase  48.88 
 
 
499 aa  403  1e-111  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0306642  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6289  histidine kinase  38.92 
 
 
463 aa  284  2.0000000000000002e-75  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0135333  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0159  histidine kinase  38.43 
 
 
496 aa  251  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1696  histidine kinase  38 
 
 
506 aa  248  1e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0769699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1046  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase, tctE  36.91 
 
 
472 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0767408  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2400  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.13 
 
 
471 aa  244  3e-63  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.314364  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1765  sensor histidine kinase  37.92 
 
 
466 aa  243  5e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1626  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 
478 aa  243  5e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1580  sensor histidine kinase  34.25 
 
 
462 aa  243  6e-63  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0943053  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0065  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
494 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1181  sensor histidine kinase  36.09 
 
 
469 aa  240  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0073  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.2 
 
 
494 aa  240  5e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3340  sensor histidine kinase  36.44 
 
 
495 aa  239  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0074  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
494 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1308  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.01 
 
 
452 aa  238  2e-61  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.116262 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2981  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 
494 aa  238  2e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0092  histidine kinase  34.91 
 
 
494 aa  237  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.438311 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0557  histidine kinase  36.76 
 
 
480 aa  236  7e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4248  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
474 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.31722  normal  0.105539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4118  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.15 
 
 
474 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.137791  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0209  sensor histidine kinase  36.02 
 
 
494 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3255  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.33 
 
 
494 aa  234  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4079  sensor histidine kinase  36.02 
 
 
494 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1517  histidine kinase  37.61 
 
 
439 aa  233  5e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0801094  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2982  sensor histidine kinase  35.82 
 
 
488 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3269  histidine kinase  36.15 
 
 
474 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.86332  normal  0.63748 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3387  sensor histidine kinase  35.82 
 
 
488 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1620  sensor histidine kinase  35.82 
 
 
488 aa  233  8.000000000000001e-60  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3515  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.4 
 
 
462 aa  233  9e-60  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.289795  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_4005  sensor histidine kinase  35.61 
 
 
488 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3687  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.01 
 
 
455 aa  231  3e-59  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3121  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.13 
 
 
457 aa  231  3e-59  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.933036  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2923  sensor histidine kinase  36.16 
 
 
495 aa  230  4e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2102  sensor histidine kinase  37.61 
 
 
472 aa  230  4e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.801487  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1723  sensor histidine kinase  35.76 
 
 
504 aa  230  4e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.192682  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4142  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
463 aa  230  5e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.129438  normal  0.113394 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0074  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35 
 
 
493 aa  230  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1092  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
480 aa  228  1e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5060  histidine kinase  35.94 
 
 
467 aa  227  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0718016  normal  0.845094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3670  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.2 
 
 
463 aa  228  3e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3536  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.34 
 
 
560 aa  228  3e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.23778  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3390  sensor histidine kinase  34.71 
 
 
542 aa  227  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.397435  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4342  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.28 
 
 
476 aa  226  6e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  35.81 
 
 
477 aa  225  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00600595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3935  two-component regulatory system sensory histidine kinase  33.77 
 
 
475 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.41148  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1126  sensor histidine kinase  37.04 
 
 
501 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2278  sensor histidine kinase  37.04 
 
 
501 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.992054  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1038  Signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 
501 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0953  sensor histidine kinase  37.04 
 
 
501 aa  224  4e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0115  sensor histidine kinase  37.04 
 
 
501 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1500  sensor histidine kinase  37.04 
 
 
501 aa  224  4e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1450  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 
460 aa  223  7e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.126208  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3925  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
501 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.306809  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0007  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.75 
 
 
500 aa  221  3e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5340  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 
465 aa  220  3.9999999999999997e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.81326 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3336  two component sensor kinase  36.25 
 
 
473 aa  220  5e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3058  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.92 
 
 
499 aa  219  8.999999999999998e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2579  histidine kinase  35.78 
 
 
466 aa  219  1e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49440  sensory histidine protein kinase TctE  34.97 
 
 
474 aa  218  2e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2766  histidine kinase  37.39 
 
 
476 aa  218  2e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0989044  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2816  sensor histidine kinase  34.92 
 
 
449 aa  217  4e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4390  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.45 
 
 
459 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.982786 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1735  two-component transmembrane sensor kinase transcription regulator protein  37.05 
 
 
471 aa  213  9e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.143515  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1879  sensor histidine kinase  36.64 
 
 
467 aa  211  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1421  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 
463 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>